临床疗效评估
评估YDJDG对COVID-19患者的临床疗效
招募262名COVID-19患者,采用PSM匹配分为YDJDG组和对照组,观察肺部渗出性病变消散时间、病毒核酸转阴时间、发热持续时间,并动态监测CD4+T细胞、CRP、SAA、ESR等指标。
Yindan Jiedu granules exhibit anti-inflammatory effect in patients with novel Coronavirus disease (COVID-19) by suppressing the NF-κB signaling pathway.
包含临床队列研究、网络药理学分析、HPLC-MS/MS成分鉴定、分子对接、体内ALI动物模型及体外细胞实验,多层级验证了YDJDG通过抑制NF-κB通路发挥抗炎作用。
COVID-19患者队列 LPS诱导的急性肺损伤(ALI)小鼠模型 RAW264.7小鼠巨噬细胞系
PSM匹配变量(年龄、性别、合并症、疾病严重程度、炎症指标等) YDJDG给药剂量(12g或24g,口服每日三次) LPS诱导ALI剂量(5 mg/kg,气管内滴注) YDJDG处理浓度(20%含药血清) LPS刺激浓度(体外10 μg/ml,体内5 mg/kg)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估YDJDG对COVID-19患者的临床疗效
招募262名COVID-19患者,采用PSM匹配分为YDJDG组和对照组,观察肺部渗出性病变消散时间、病毒核酸转阴时间、发热持续时间,并动态监测CD4+T细胞、CRP、SAA、ESR等指标。
预测YDJDG治疗COVID-19的潜在靶点和通路
从SymMap数据库收集YDJDG活性成分及靶点,从GeneCards、DisGeNET、DrugBank获取COVID-19相关基因,取交集后通过Metascape进行KEGG富集分析,构建PPI网络和“草药-成分-靶点”网络。
鉴定YDJDG中的主要活性成分
随机选取三袋YDJDG,取样约200mg,采用HPLC-MS/MS分析,并通过mzCloud、mzVault和ChemSpider数据库比对,鉴定出20个与网络药理学重叠的化合物,其中木犀草素、槲皮素和山柰酚得到确认。
验证YDJDG对LPS诱导ALI小鼠模型的保护作用
建立LPS诱导的ALI小鼠模型,分组为对照组、LPS组、LPS+YDJDG组、LPS+MP组,评估肺组织病理损伤、湿/干重比、BALF中细胞因子水平及肺组织中NF-κB通路蛋白表达。
验证YDJDG对LPS刺激的RAW264.7细胞的抗炎作用及机制
RAW264.7细胞经YDJDG含药血清预处理后,LPS刺激,检测细胞活力、NO产生、细胞因子水平、NF-κB p65核转位及NF-κB通路蛋白磷酸化水平。
验证YDJDG中活性成分与NF-κB p65和IκBα的结合能力
利用AutoDock 4.2将木犀草素、槲皮素和山柰酚与NF-κB p65(PDB ID:1IKN)和IκBα(PDB ID:1NFI)进行分子对接,计算结合能并分析氢键。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 脂多糖 | Sigma | L2630 |
| 细胞实验 | 脂多糖 | Sigma | L4391 |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Solarbio | CA1210 |
| 细胞实验 | 地塞米松 | Merck | D1756-25MG |
| NO检测 | 格里斯试剂 | Beyotime | S0021S |
| 细胞因子检测 | TNF-α ELISA试剂盒 | Neobioscience | ADI-900-047 |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Neobioscience | 88-7064-86 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Neobioscience | 88-8014-22 | |
| 免疫荧光 | NF-κB p65抗体 | CST | 8242T |
| Western blot | NF-κB p65抗体 | CST | 8242T |
| 磷酸化NF-κB p65 (Ser536)抗体 | CST | 3033T | |
| IκBα (44D4)抗体 | CST | 4812S | |
| 磷酸化IκBα抗体 | CST | 2859T | |
| GAPDH抗体 | CST | 5174 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床研究 | PSM匹配变量、YDJDG剂量(12g或24g每日三次)、观察时间点(第0、3、7、10、14天) 阅读提示:详见Methods部分‘Propensity score matching’和‘Drug preparation and treatment’,以及Fig.2和Table 1 |
| 网络药理学分析 | 活性化合物筛选标准(OB≥30%)、靶点数据库来源、交集基因筛选 阅读提示:详见Methods部分‘Collection and screening of compounds and targets’和‘Gene analysis and pathway annotation’ |
| 化学成分鉴定 | 样品量(约200mg)、HPLC-MS/MS条件、数据库比对(mzCloud, mzVault, ChemSpider) 阅读提示:详见Methods部分‘Identification of major chemical ingredients’和Fig.5D |
| 体内实验 | 小鼠品系(BALB/c)、LPS剂量(5 mg/kg)、YDJDG给药剂量(0.182ml,72.8mg)和给药时间(LPS后4h和10h)、MP剂量(6 mg/kg)、检测时间(LPS后24h) 阅读提示:详见Methods部分‘Establishment of acute Lung injury (ALI) model'和Fig.8 |
| 体外实验 | 细胞系(RAW264.7)、YDJDG血清浓度(20%)、LPS浓度(10 μg/ml)、检测时间(6、12、24h) 阅读提示:详见Methods部分‘Cell culture’和‘Cytotoxicity assay’,以及Fig.9 |