体内和体外检测KLK12表达
确定M. bovis感染是否诱导KLK12表达上调。
通过鼻内感染C57BL/6小鼠(200 CFU/只),在感染后3周和12周收取肺和脾脏,用qRT-PCR检测KLK12表达。体外用M. bovis C68004和N株感染BMDMs和RAW264.7细胞,以不同MOI和时间点处理,用qRT-PCR和Western Blot检测KLK12表达。
Kallikrein 12 Regulates Innate Resistance of Murine Macrophages against Mycobacterium bovis Infection by Modulating Autophagy and Apoptosis.
包含体内小鼠感染模型和体外BMDM/RAW264.7细胞实验,涵盖基因表达、siRNA敲低、自噬、凋亡、细胞因子检测及CFU分析,但缺少体内功能验证和患者样本。
C57BL/6小鼠体内感染模型 骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) RAW264.7巨噬细胞
KLK12敲低效率(siRNA KLK12-mus-402) M. bovis感染剂量(MOI 10)和时间点(6、24 h) 自噬检测(LC3-II、Beclin-1、p62、β-catenin) 凋亡检测(Annexin V/PI染色、BAX、Bcl-2、Cytochrome c、Caspase 3) 细胞因子检测(IL-1β、IL-6、IL-12、TNF-α、IL-10、IFN-β)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定M. bovis感染是否诱导KLK12表达上调。
通过鼻内感染C57BL/6小鼠(200 CFU/只),在感染后3周和12周收取肺和脾脏,用qRT-PCR检测KLK12表达。体外用M. bovis C68004和N株感染BMDMs和RAW264.7细胞,以不同MOI和时间点处理,用qRT-PCR和Western Blot检测KLK12表达。
确认M. bovis感染是否上调自噬标志物。
用M. bovis C68004感染BMDMs,以不同MOI和时间点处理,通过Western Blot检测LC3-II、Beclin-1和β-catenin表达。
确定KLK12敲低是否影响M. bovis诱导的自噬。
使用siRNA转染BMDMs敲低KLK12,48小时后感染M. bovis(MOI 10),在6和24小时检测自噬标志物。并用雷帕霉素和巴弗洛霉素A1处理,检测LC3-II水平。
探讨KLK12调节自噬是否通过AMPK/TSC2/mTOR通路。
在KLK12敲低和对照BMDMs感染M. bovis后,通过Western Blot检测磷酸化AMPK、TSC2和mTOR水平。
确定KLK12敲低是否影响M. bovis诱导的凋亡。
通过流式细胞术(Annexin V/PI染色)和Western Blot检测凋亡相关蛋白(BAX、Bcl-2、Cytochrome c、Caspase 3)在KLK12敲低和对照BMDMs中的变化。
确定KLK12敲低是否改变炎症细胞因子表达。
通过qRT-PCR和ELISA检测KLK12敲低和对照BMDMs感染M. bovis后细胞因子(IL-1β、IL-6、IL-12、TNF-α、IL-10、IFN-β)的表达。
确定KLK12是否影响巨噬细胞控制M. bovis感染的能力。
在KLK12敲低和对照BMDMs感染M. bovis后,通过CFU测定评估细菌存活。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Hyclone | -- |
| RPMI1640培养基 | Hyclone | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | -- | |
| 7H9 Middlebrook培养基 | Difco | -- | |
| 细菌培养 | OADC富集液 | BD Biosciences | -- |
| 分枝杆菌生长素J | Dickinson and Sparks Company | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Western blot | 抗KLK12抗体 | BioVision | 3720-100 |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Proteintech | 11224-1-AP | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 20536-1-AP | |
| 抗LC3抗体 | Proteintech | 18725-1-AP | |
| 抗Beclin 1抗体 | Proteintech | 11306-1-AP | |
| 抗P62抗体 | Proteintech | 18420-1-AP | |
| 抗β-连环蛋白抗体 | Proteintech | 51067-2-AP | |
| 抗BAX抗体 | Proteintech | 50599-2-Ig | |
| 抗细胞色素C抗体 | Proteintech | 10993-1-AP | |
| 抗TOM20抗体 | Proteintech | 11802-1-AP | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔抗体 | Proteintech | SA00001-2 | |
| 磷酸化AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 877-616-CELL | |
| 磷酸化mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | S2481 | |
| 磷酸化结节性硬化复合物2抗体 | Cell Signaling Technology | 877-678-CELL | |
| Caspase 3抗体 | Abcam | GR64557-1 | |
| Bcl-2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | F0106 | |
| 山羊抗小鼠二抗 | Beijing ZSGB Biotechnology | ZB-5305 | |
| ELISA | 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Neobioscience Technology | -- |
| 小鼠IL-10 ELISA试剂盒 | Neobioscience Technology | -- | |
| 小鼠IL-12 ELISA试剂盒 | Neobioscience Technology | -- | |
| 小鼠IFN-β ELISA试剂盒 | Neobioscience Technology | -- | |
| 细胞活力检测 | CellTiter 96Aqueous one solution细胞增殖检测试剂盒 | Promega | -- |
| 药物处理 | 雷帕霉素(西罗莫司) | Selleckchem | S1039 |
| 巴弗洛霉素A1 | Solarbio Life Sciences | A8510 | |
| RNA提取 | RNA提取试剂盒 | Aidlab Biotechnology | -- |
| cDNA合成 | RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| qRT-PCR | AceQ qPCR SYBR Green预混液 | Vazyme Biotech | -- |
| ViiA7实时荧光定量PCR系统 | ABI | -- | |
| 线粒体分离 | 细胞线粒体分离试剂盒 | Beyotime | -- |
| 流式细胞术 | Annexin V/碘化丙啶染色试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| BD FACS Calibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | Sigma Aldrich | -- |
| 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | -- | |
| 增强化学发光底物 | Bio-Rad | -- | |
| BIO-RAD成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 细胞裂解 | Triton X-100 | -- | -- |
| 细菌培养 | 7H10琼脂平板 | -- | -- |
| 蛋白质印迹 | SDS上样缓冲液 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物感染 | 小鼠品系、年龄、性别、分组、感染剂量、感染途径、安乐死时间点 阅读提示:见2.4节和Figure 1A,B |
| 细胞感染 | 细胞类型、MOI、感染时间点、感染后培养条件 阅读提示:见2.5节和2.6节 |
| siRNA转染 | siRNA序列、浓度、转染试剂、转染时间、敲低效率验证 阅读提示:见2.6节和Supplementary Table S1 |
| 自噬检测 | 自噬标志物、检测方法、雷帕霉素和巴弗洛霉素A1的浓度和处理时间 阅读提示:见3.3节和Figure 3 |
| 凋亡检测 | 凋亡检测方法、时间点、线粒体和胞质分离方法 阅读提示:见2.8节和3.5节 |
| 细胞因子检测 | 检测方法(qRT-PCR、ELISA)、引物序列、ELISA试剂盒 阅读提示:见2.7节、2.11节和3.6节 |
| 细菌存活 | CFU测定方法、裂解条件、涂板培养基、培养时间 阅读提示:见2.12节和3.7节 |