检测CV-A16感染诱导IP-10表达
确定CV-A16感染是否上调IP-10表达。
用CV-A16(MOI 0.1)感染HUVECs,在不同时间点收集细胞和上清,通过qRT-PCR、Western blot和ELISA检测IP-10 mRNA和蛋白水平。
IP-10 acts early in CV-A16 infection to induce BBB destruction and promote virus entry into the CNS by increasing TNF-α expression.
包含体外HUVEC模型和体内乳鼠模型两个独立证据层级,并明确进行了NF-κB调控IP-10、IP-10调控TNF-α及BBB连接复合物破坏的功能和机制验证。
人脐静脉内皮细胞(HUVECs) BALB/C乳鼠模型
CV-A16感染HUVECs的MOI为0.1,感染后2h吸附,维持于2%FBS DMEM中 Eldelumab处理浓度分为低、中、高剂量(具体剂量需查阅补充材料) 乳鼠分为10组,每组N=12,IP-10重组蛋白剂量为100 ng/ml,TNF-α重组蛋白剂量为50 ng/ml,Anti-TNF-α剂量为5 mg/kg(原文如此,可能为笔误) 在感染后第4天和第8天检测血和脑组织中的IP-10、TNF-α、病毒载量及连接复合物表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定CV-A16感染是否上调IP-10表达。
用CV-A16(MOI 0.1)感染HUVECs,在不同时间点收集细胞和上清,通过qRT-PCR、Western blot和ELISA检测IP-10 mRNA和蛋白水平。
验证CV-A16感染激活NF-κB通路并调控IP-10表达。
用NF-κB敲低或过表达质粒转染HUVECs,检测IP-10表达;同时用WB检测TLR3、TRIF、TRAF3、TBK1、NF-κB等通路蛋白,免疫荧光观察NF-κB核转位。
观察CV-A16感染后炎症细胞因子的表达变化。
使用流式细胞术检测12种炎症细胞因子在不同时间点的表达。
确定IP-10是否参与BBB损伤。
用Eldelumab(IP-10中和抗体)处理CV-A16感染的HUVECs,通过WB和IF检测连接复合物Claudin5、Occludin、ZO-1、VE-Cadherin的表达。
探讨IP-10是否通过TNF-α破坏BBB。
用不同浓度Eldelumab处理CV-A16感染的HUVECs,流式检测炎症细胞因子,ELISA检测IP-10和TNF-α浓度;用TNF-α处理HUVECs,WB检测连接复合物。
在体内验证IP-10和TNF-α对BBB破坏、神经炎症和病毒传播的影响。
将乳鼠随机分为10组,分别用IP-10重组蛋白、Anti-IP-10、TNF-α重组蛋白、Anti-TNF-α处理,并/或感染CV-A16,监测生存率、临床症状,通过H&E染色观察脑病理,WB检测连接复合物,IHC检测VP1,qRT-PCR检测病毒载量,流式检测炎症因子。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | TIANGEN | -- |
| cDNA合成 | PrimeScript™ RT试剂盒 | TAKARA | -- |
| qRT-PCR | SYBR Premix Ex Taq | TAKARA | -- |
| ABI7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| IP-10抗体 | ABclonal | A21986 | |
| TLR3抗体 | ABclonal | A24885 | |
| TRIF抗体 | Affinity | DF6289 | |
| RIG-I抗体 | ABclonal | A23179 | |
| MDA5抗体 | ABclonal | A2419 | |
| MAVS抗体 | Affinity | DF12211 | |
| TRAF3抗体 | Affinity | AF5380 | |
| TBK1抗体 | Affinity | DF7026 | |
| NF-κB抗体 | Affinity | AF5006 | |
| Claudin5抗体 | Affinity | AF5216 | |
| Occludin抗体 | Affinity | DF7504 | |
| ZO-1抗体 | ABclonal | A11417 | |
| VE-钙黏蛋白抗体 | Affinity | AF6265 | |
| VP1抗体 | Millipore | 3822821 | |
| GAPDH抗体 | Abbinke | ABL1025 | |
| HRP标记二抗 | Abbinke | A21010 | |
| 增强化学发光系统 | Biosharp | -- | |
| ELISA | 人IP-10 ELISA试剂盒 | Abcam | ab173194 |
| 人IL-1β ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EHC002bQT.96 | |
| 人IL-6 ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EHC007QT.96 | |
| 人TNF-α ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EHC103aQT.96 | |
| 免疫荧光 | 牛血清白蛋白 | Biofroxx | -- |
| Alexa Fluor® 488标记的山羊抗小鼠IgG | CST | 4408S | |
| Alexa Fluor® 594标记的山羊抗兔IgG | CST | 8889S | |
| DAPI | 未明确说明 | -- | |
| 激光共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| ELISA检测 | NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 流式分析 | LEGENDplex v8.0软件 | 未明确说明 | -- |
| 动物实验 | IP-10重组蛋白 | ABclonal | -- |
| IP-10抗体 | Abmart | -- | |
| TNF-α重组蛋白 | MCE | -- | |
| TNF-α抗体 | MCE | -- | |
| H&E染色 | 伊红 | 未明确说明 | -- |
| 数字病理切片扫描仪 | KFBIO | -- | |
| qRT-PCR | 一步法PrimeScript™ RT-PCR试剂盒 | TAKARA | -- |
| GENTIER 96仪器 | TIANLONG | -- | |
| IHC染色 | 柠檬酸抗原修复液 | Servicebio | -- |
| 统计 | GraphPad Prism 7.0软件 | 未明确说明 | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与病毒株 | HUVECs来源(ATCC) 阅读提示:Materials and methods, Cells and viruses |
| 细胞培养与病毒株 | CV-A16-G20株,MOI=0.1 阅读提示:Materials and methods, Cells and viruses |
| 病毒接种 | 感染后2小时弃去病毒液,换含2%FBS的DMEM 阅读提示:Materials and methods, Cells and viruses |
| IP-10表达检测 | qRT-PCR引物序列 阅读提示:Materials and methods, Quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction |
| IP-10表达检测 | GAPDH作为内参,2^-ΔΔCt法 阅读提示:Materials and methods, Quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction |
| Western blot | 抗体稀释比例及来源 阅读提示:Materials and methods, Western blotting analysis |
| ELISA | 试剂盒货号及品牌 阅读提示:Materials and methods, Enzyme-linked immunosorbent assay |
| 免疫荧光 | 细胞固定、通透、封闭条件 阅读提示:Materials and methods, Confocal fluorescence microscopy |
| 流式检测炎症因子 | 炎症因子检测步骤 阅读提示:Materials and methods, Flow cytometry analysis of inflammatory cytokines |
| 动物实验 | 乳鼠分组及处理剂量 阅读提示:Materials and methods, Mouse experiments |
| 动物实验 | 动物伦理批准号 阅读提示:Materials and methods, Mouse experiments |
| 动物实验 | 临床观察和样本采集时间点(Day 4和Day 8) 阅读提示:Materials and methods, Mouse experiments |
| H&E染色 | 染色步骤 阅读提示:Materials and methods, H&E staining |
| qRT-PCR病毒载量 | 标准曲线方法 阅读提示:Materials and methods, qRT-PCR for determining the viral load |
| IHC染色 | 抗原修复条件(微波10min) 阅读提示:Materials and methods, IHC staining |