验证InsP3R介导的Ca2+在吞噬中的作用
确定InsP3R介导的钙信号是否对巨噬细胞吞噬白色念珠菌必需。
用BMDMs与白色念珠菌共培养,记录胞质Ca2+变化;用BAPTA-AM和InsP3R抑制剂ARB处理观察吞噬指数变化。
InsP3R-SEC5 interaction on phagosomes modulates innate immunity to Candida albicans by promoting cytosolic Ca2+ elevation and TBK1 activity.
包含体外细胞实验(巨噬细胞吞噬、钙成像、电生理)、体内小鼠感染模型及生化机制验证(免疫共沉淀、GST pull-down、激酶实验),并验证功能与机制。
骨髓来源巨噬细胞 RAW264.7巨噬细胞系 HEK293细胞 小鼠系统性念珠菌感染模型
C57BL/6小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)培养条件:DMEM含20% FBS、30% L929条件培养基,培养7天。 C. albicans感染剂量:体内尾静脉注射1×10^5 CFU;体外MOI=10或5。 H1-TAT肽处理:2 μM体外预处理6小时;体内2 mg/kg腹腔注射。 SEC5-siRNA转染:120 pmol siRNA,48小时。 钙成像:Fura-2 AM负载,50 μM卡巴胆碱刺激。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定InsP3R介导的钙信号是否对巨噬细胞吞噬白色念珠菌必需。
用BMDMs与白色念珠菌共培养,记录胞质Ca2+变化;用BAPTA-AM和InsP3R抑制剂ARB处理观察吞噬指数变化。
寻找InsP3R新的结合蛋白并验证其相互作用。
通过酵母双杂交筛选人脑cDNA文库,发现SEC5;用免疫共沉淀、免疫荧光、FRET、GST pull-down验证相互作用和结合区域。
确定SEC5是否通过直接结合调节InsP3R通道门控。
在HEK293细胞中过表达或敲低SEC5,测量卡巴胆碱诱导的Ca2+释放;用核膜电生理直接记录InsP3R通道开放概率。
检测SEC5-InsP3R相互作用是否调控巨噬细胞吞噬和抗真菌免疫。
过表达或敲低SEC5观察吞噬指数变化;用H1-TAT肽破坏相互作用评估吞噬和体内真菌负荷。
确定SEC5是否通过TBK1-IRF-3信号调节IFN-β产生。
检测C. albicans刺激后p-TBK1水平和IRF-3核转位;敲低或过表达SEC5后测量IFN-β表达。
探索InsP3R如何在分子水平上促进TBK1激活。
用GST-H1 pull-down检测SEC5和TBK1的相互作用;免疫共沉淀验证H1肽增强TBK1结合;体外激酶实验检测TBK1活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 酵母双杂交 | pLexA载体 | Clontech | -- |
| 人胎脑cDNA文库 | Invitrogen | -- | |
| 酵母质粒提取试剂盒 | Qiagen | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 鸡血清 | -- | -- | |
| 抗生素-抗真菌剂 | -- | -- | |
| L929细胞 | -- | -- | |
| 质粒构建 | pET28a载体 | -- | -- |
| pCDNA3.1-V5-His载体 | Life Tech | -- | |
| pECFP-N1载体 | Clontech | -- | |
| pGEX-6P-1载体 | GE | -- | |
| 重组蛋白纯化 | 谷胱甘肽琼脂糖4B | GE | -- |
| 镍柱 | Qiagen | -- | |
| 免疫共沉淀 | 兔IgG同型对照 | Sigma | #18140 |
| 蛋白G琼脂糖树脂 | Yeasen | #36405ES08 | |
| 免疫荧光 | 盖玻片 | Fisher Scientific | -- |
| IGEPAL | Sigma | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Amresco | -- | |
| Vectashield封片剂 | -- | -- | |
| 钙成像 | Fura-2 AM | Invitrogen | -- |
| Pluronic F-127 | Sigma | -- | |
| 卡巴胆碱 | -- | -- | |
| 电生理 | HEKA EPC-10放大器 | HEKA Elektronik | -- |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 吞噬实验 | EMCCD相机 | -- | -- |
| 激酶实验 | 重组GST标记的IRF-3-C蛋白 | -- | -- |
| 细胞因子检测 | IFN-β ELISA试剂盒 | NeoBioscience | -- |
| 抗体 | 抗TBK1抗体 | Cell Signaling Technology | 3504S |
| 抗磷酸化TBK1(Ser172)抗体 | Cell Signaling Technology | 5483P | |
| 抗β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 4970S | |
| 抗PCNA抗体 | Cell Signaling Technology | 13110 | |
| 抗IRF3(磷酸化Ser396)抗体 | Cell Signaling Technology | 4302S | |
| 抗磷酸化IRF-3抗体 | Cell Signaling Technology | 29047 | |
| 抗SEC5抗体 | Sigma-Aldrich | HPA032093 | |
| 抗InsP3R-3抗体 | BD Biosciences | 610313 | |
| 抗GST抗体 | ABclonal Technology | AE006 | |
| 抗His标签抗体 | ABclonal Technology | AE003 | |
| 抗TBK1抗体(免疫荧光) | Abcam | ab40676 | |
| Alexa Fluor 488偶联驴抗小鼠IgG二抗 | Life Technologies | A-21202 | |
| Cy3偶联驴抗兔IgG二抗 | Millipore | AP182C | |
| 试剂 | 肌醇-1,4,5-三磷酸 | Cayman Chemical | 10008205 |
| arapuspongin B | Cayman Chemical | 10006797 | |
| 转染 | siRNA-SEC5 | Shanghai GenePharma | -- |
| siRNA阴性对照 | Shanghai GenePharma | -- | |
| ShRNA-SEC5 | Shanghai Genechem | -- | |
| 动物实验 | C57BL/6小鼠 | Shanghai BK Animal Model Inc. Ltd. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源:RAW264.7和HEK293购自ATCC;DT40细胞由Foskett实验室提供。培养基成分:DMEM或RPMI1640含10% FBS等;BMDMs需L929条件培养基和M-CSF。培养条件:37°C,5% CO2,95%湿度。 阅读提示:Methods: Cell culture, Mouse macrophage differentiation and culture |
| 吞噬实验 | BMDMs与C. albicans共培养时间30分钟(MOI=5或10);H1-TAT肽处理浓度2 μM,时间6小时;体内感染剂量1×10^5 CFU,给药途径(尾静脉和腹腔注射)。 阅读提示:Methods: Phagocytosis assays, C. albicans infection model and fungal burden, 图4 |
| 钙成像 | HEK293细胞转染后24小时;Fura-2 AM浓度2 μM负载30分钟;HBSS缓冲液成分(含1.8 mM CaCl2,0.8 mM MgCl2);卡巴胆碱刺激浓度50 μM。 阅读提示:Methods: Calcium imaging, 图3 |
| 电生理 | DT40KO-rInsP3R3细胞核膜片钳;pipette solution含500 nM InsP3和2 μM Ca2+;SEC5-2肽浓度1-2 μM。 阅读提示:Methods: Nuclear patch-clamp recording of InsP3R, 图3 |
| IFN-β检测 | C. albicans刺激时间(如4小时);SEC5-siRNA或shRNA处理时间48小时;MRT67307浓度20 nM处理2小时。 阅读提示:Methods: Cytokine measurements, 图5 |