体外抗炎活性评估
评估DNQ在LPS刺激的巨噬细胞中的抗炎作用
用不同浓度DNQ预处理RAW264.7、BV2和THP-1细胞,再用LPS刺激,检测炎症基因表达、NO释放、细胞因子分泌等。
Small molecule deoxynyboquinone triggers alkylation and ubiquitination of Keap1 at Cys489 on Kelch domain for Nrf2 activation and inflammatory therapy.
研究包含体外细胞实验、体内小鼠模型、分子机制验证(突变体、Co-IP、泛素化分析)及靶点鉴定(LC-MS/MS),多个证据层级相互验证。
RAW264.7巨噬细胞 BV2小胶质细胞 THP-1巨噬细胞 LPS诱导的急性炎症小鼠模型
DNQ浓度(0.06–1 μM)及处理时间(6–12 h) LPS刺激浓度(2 mg/kg)及处理时间(4 h) Keap1 Cys489位点突变 Nrf2 shRNA敲低效率 DNQ给药途径(静脉注射)及剂量(0.25–2 mg/kg)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估DNQ在LPS刺激的巨噬细胞中的抗炎作用
用不同浓度DNQ预处理RAW264.7、BV2和THP-1细胞,再用LPS刺激,检测炎症基因表达、NO释放、细胞因子分泌等。
鉴定DNQ抗炎活性的关键化学结构
通过DNQ与NAC反应,利用UPLC和NMR鉴定反应产物,并测试其抗炎活性。
验证DNQ是否通过激活Nrf2/ARE通路发挥抗炎作用
检测Nrf2核转位、ARE报告基因活性、下游基因表达及蛋白水平变化,并使用Nrf2 shRNA敲低进行功能验证。
确认DNQ直接靶向Keap1并确定结合位点
使用等温滴定量热法、细胞热位移分析、DNQ-L探针pulldown和LC-MS/MS鉴定DNQ与Keap1的结合及修饰位点。
验证Cys489对DNQ激活Nrf2和抗炎作用的必要性
构建Keap1半胱氨酸突变体,检测DNQ与突变蛋白的结合、Nrf2激活及炎症相关基因表达。
阐明DNQ烷基化Cys489后如何导致Keap1降解和Nrf2释放
通过Co-IP检测DNQ对Keap1-Nrf2相互作用的影响,使用MG132处理检测Keap1和Nrf2的泛素化水平。
评估DNQ在LPS诱导的急性炎症小鼠模型中的治疗效果
给予小鼠不同剂量DNQ,然后腹腔注射LPS,检测体温、脾指数和血清细胞因子水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| DMEM/F12培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 药物处理 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 脱氧尼博醌 | 文中未明确说明 | -- | |
| 细胞活力检测 | 噻唑蓝 | Sigma-Aldrich | -- |
| LDH检测 | LDH细胞毒性检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 88953 |
| 免疫荧光 | DAPI | Beyotime | -- |
| 抗Nrf2抗体 | Proteintech | 16396-1-AP | |
| Western blot | 抗HO-1抗体 | Proteintech | 10701-1-AP |
| 抗Keap1抗体 | Proteintech | 10503-2-AP | |
| 抗GCLM抗体 | Proteintech | 14241-1-AP | |
| 抗Nrf2抗体 | Proteintech | 16396-1-AP | |
| 抗泛素抗体 | Proteintech | 10201-2-AP | |
| 抗Flag抗体 | Proteintech | 66008-4-Ig | |
| 抗iNOS抗体 | Cell Signaling Technology | 13120 | |
| 抗NLRP3抗体 | Cell Signaling Technology | 15101 | |
| 抗Myc标签抗体 | Cell Signaling Technology | 2276 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Cohesion Biosciences | CPA1009 | |
| qPCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| PrimeScript逆转录试剂盒 | Takara | RR047A | |
| TB Green预混Ex Taq | Takara | RR420A | |
| Nrf2-ARE结合检测 | ARE报告基因试剂盒 | BioScience | 60514 |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1910 | |
| 细胞裂解 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| BCA蛋白定量 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 质粒转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Opti-MEM I减血清培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 质粒提取 | 质粒提取试剂盒 | QIAGEN | 12163 |
| pull-down | 生物素-PEG3-叠氮化物 | GreenChem | -- |
| 亲和素琼脂糖 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| DNQ-Linker探针 | 文中未明确说明 | -- | |
| 动物实验 | 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | -- |
| 聚乙二醇400 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外抗炎实验 | 细胞类型(RAW264.7、BV2、THP-1等)、DNQ浓度(0.06–1 μM)、LPS浓度(常为1 μg/mL或未明确)、处理时间(12 h) 阅读提示:Materials and methods 2.2, 2.3, 2.5, 2.6, 2.7;Figure legends 1 |
| 药效团鉴定 | NAC浓度(500 μM)、DNQ浓度(177.5 ng/mL)、反应时间(6 h或12 h)、培养基成分 阅读提示:Materials and methods 2.17;Figure legend 3 |
| Nrf2/ARE通路验证 | ARE报告基因实验中的细胞密度、转染量、DNQ处理时间(24 h)、下游基因检测时间(6 h) 阅读提示:Materials and methods 2.11;Figure legend 4 |
| 靶点鉴定 | DNQ-L探针浓度(2 μM)、click chemistry反应条件、LC-MS/MS方法(蛋白酶、孵育条件) 阅读提示:Materials and methods 2.18, 2.19;Supplementary Methods 2-4 |
| 关键位点验证 | Keap1突变体(C257A、C288A、C297A、C489A)、DNQ浓度(1 μM)、处理时间(6 h) 阅读提示:Materials and methods 2.14, 2.16;Figure legend 8 |
| 机制解析 | DNQ浓度(1 μM)、MG132浓度(10 mM或5 μM)、处理时间(DNQ 12 h,MG132 4-5 h)、细胞系(RAW264.7、HEK293T) 阅读提示:Materials and methods 2.16;Figure legend 9 |
| 体内实验 | 小鼠品系(C57/BL6雄性,7-8周龄)、DNQ剂量(0.25、0.5、1、2 mg/kg)、给药途径(静脉注射或腹腔注射)、LPS剂量(2 mg/kg)、刺激时间(4 h) 阅读提示:Materials and methods 2.20;Figure legend 2 |