单细胞转录组学揭示IL-17A在真实环境颗粒物暴露所致慢性肺损伤起始中的免疫失调介导作用

Single-cell transcriptomics reveals immune dysregulation mediated by IL-17A in initiation of chronic lung injuries upon real-ambient particulate matter exposure.

作者信息Rui Zhang, Shen Chen, Liping Chen, Lizhu Ye, Yue Jiang, Hui Peng, Zhanyu Guo, Miao Li, Xinhang Jiang, Ping Guo, Dianke Yu, Rong Zhang, Yujie Niu, Yuan Zhuang, Michael Aschner, Yuxin Zheng, Daochuan Li, Wen Chen
PMID35739565
发布时间2022-06-23
DOI10.1186/s12989-022-00483-w

实验完整度

包含体内动物模型(PM暴露与IL-17A敲除)、单细胞转录组学、病理学、流式、功能学验证等多层级证据

主要模型

C57BL/6J小鼠(真实环境PM暴露模型) IL-17A−/−小鼠 小鼠全肺单细胞转录组

重点核对

PM暴露时间点(11、15、23天,8周,16周)及分组(各时间点N=20) PM2.5暴露浓度(暴露舱内平均73.94 μg/m³) IL-17A敲除验证(mRNA表达降低87%) 胶原含量、Ashcroft评分、羟脯氨酸含量 MDSCs流式标记(CD11b+Gr1+,Ly6C/Ly6G亚型)

摘要

背景:长期暴露于细颗粒物(PM2.5)会增加慢性呼吸系统疾病(包括炎症和间质纤维化)的易感性。然而,免疫反应介导肺纤维化起始的调控机制尚未完全阐明。本研究旨在阐明PM暴露小鼠中不同细胞簇与关键通路在触发慢性肺损伤中的相互作用。结果:将6周龄C57BL/6J雄性小鼠暴露于PM或过滤空气16周,暴露系统位于中国石家庄的真实环境PM暴露系统。通过单细胞转录组学分析表征亚慢性PM暴露后全肺细胞的转录谱。利用IL-17A敲除(IL-17A−/−)小鼠模型确定IL-17信号通路是否介导PM诱导的慢性肺损伤中的免疫失调。16周PM暴露后,出现慢性肺损伤,伴有过度胶原沉积、成纤维细胞、中性粒细胞和单核细胞增加,同时主要免疫细胞类别数量减少。单细胞分析显示,IL-17信号通路的激活参与亚慢性PM暴露下肺纤维化的进展。IL-17A缺失导致慢性肺损伤显著减轻,这主要由髓源性抑制细胞(MDSCs)募集减少和TGF-β下调所触发。结论:这些新发现表明,通过IL-17A通路的免疫抑制在亚慢性PM暴露所致慢性肺损伤的起始中发挥关键作用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
真实环境PM暴露如何通过免疫调控触发慢性肺损伤及肺纤维化的起始?
核心机制
IL-17A信号通路激活,募集免疫抑制性MDSCs,上调TGF-β,形成免疫抑制微环境,促进成纤维细胞活化与胶原沉积。
主要证据
16周PM暴露小鼠肺组织出现纤维化改变,IL-17A−/−小鼠纤维化减轻;scRNA-seq显示IL-17信号通路在多种细胞簇激活;MDSCs骨髓、脾、肺中增加,IL-17A缺失后减少;TGF-β分泌下降。
研究意义
为理解环境颗粒物暴露相关慢性肺损伤的免疫调控机制提供新见解,IL-17A可作为潜在生物标志物。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

真实环境PM暴露模型建立与病理评估

建立亚慢性PM暴露动物模型并确认慢性肺损伤发生

C57BL/6J雄性小鼠置于石家庄真实环境PM暴露系统,与过滤空气对照组比较,进行8周和16周暴露,通过H&E、Masson染色、胶原含量、羟脯氨酸含量等评估病理变化。

2

单细胞转录组分析全肺细胞图谱

揭示PM暴露后肺细胞组成变化和关键信号通路激活

对对照组和PM暴露组(各3只)全肺细胞进行scRNA-seq,聚类鉴定13个细胞簇,分析差异表达基因、GO/KEGG富集及细胞间通讯。

3

IL-17A敲除验证其功能作用

验证IL-17A在PM诱导慢性肺损伤中的必要性

将IL-17A−/−小鼠与WT小鼠共同暴露于PM8周和16周,评估炎症评分、胶原含量、羟脯氨酸含量、TGF-β水平等。

4

MDSCs募集及免疫抑制功能检测

明确IL-17A对MDSCs募集及其免疫抑制功能的影响

通过流式细胞术检测骨髓、脾、肺中MDSCs比例,分离MDSCs与T细胞共培养,检测T细胞增殖抑制和TGF-β分泌。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DUSTTRAK II气溶胶检测仪TSI Incorporated--
胶原酶/分散酶Roche--
脱氧核糖核酸酶ISigma Aldrich--
Chromium单细胞3' v3试剂盒10x Genomics--
NovaSeq6000Illumina--
羟脯氨酸检测试剂盒Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute--
I型胶原检测试剂盒Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute--
DMEM培养基Gibco--
胎牛血清Gibco--
Cytoflex流式细胞仪Beckman Coulter--
FACS Aria III流式分选仪BD Biosciences--
TRIzol试剂Thermo Fisher--
Advantage RT-for-PCR试剂盒Takara--
SYBR Green PCR预混液Toyobo--
CellTrace™ CFSE细胞增殖染料Invitrogen--
ELISA试剂盒Neobioscience--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
PM暴露模型
PM2.5暴露浓度(舱内平均73.94 μg/m³)、暴露持续时间(16周)、小鼠品系(C57BL/6J雄性)、周龄(6周龄)
阅读提示:Methods: Animals and real-ambient PM exposure; Figure 1
病理评估
各组样本量(N=8)、染色方法(H&E、Masson三色、天狼星红)、评分标准(ALI评分、Ashcroft评分)、胶原含量计算
阅读提示:Methods: Histopathological analysis; Figure 2
scRNA-seq
每组样本量(N=3)、建库试剂盒(10x Genomics)、测序深度(500M)、细胞存活率、质量控制标准(基因数500-6500,线粒体基因<10%)
阅读提示:Methods: ScRNA-seq library preparation and sequencing; ScRNA-seq data processing
IL-17A敲除验证
IL-17A敲除效率(mRNA降低87%)、敲除小鼠来源(第三军医大学)
阅读提示:Methods: Animals and real-ambient PM exposure; Additional file 1: Fig. S6
MDSCs检测
流式标记(CD11b+Gr1+、Ly6C/Ly6G亚型)、样本来源(骨髓、脾、肺)、样本量(N=4)
阅读提示:Methods: Flow cytometry analysis; Figure 7
MDSCs功能实验
共培养比例(MDSCs:T=1:2)、时间(72h)、T细胞增殖检测(CFSE稀释)、TGF-β检测
阅读提示:Methods: Functional assays for MDSCs; Figure 7