hESC三维悬浮分化成肝母细胞类器官
建立hESC来源的肝母细胞类器官模型,并比较有无Matrigel的影响。
将H9 hESC聚集体经定型内胚层、肝母细胞分化,再在添加或不添加5% Matrigel的扩增培养基中培养,观察形态和增殖。
Distinct Roles of Matrigel Enabled the Production of Expandable Hepatoblast and Polarized Hepatocyte Organoids from Human Embryonic Stem Cells under 3-Dimensional Suspension Conditions.
体外细胞实验(hESC分化)、类器官培养、多种功能检测(ELISA、CYP活性)、RNA-seq、抑制剂验证、TEM结构分析等多层级验证。
H9人胚胎干细胞系 肝母细胞类器官(HB-orgs) 极化肝细胞类器官(P-hep-orgs) 原代人肝细胞(PHHs)
低浓度Matrigel(5% vol/vol)的添加 三维悬浮培养条件(超低附着板) 细胞密度(2×10^5 cells/ml) 分化时间(6天) 生长因子和抑制剂浓度(如CHIR99021、SB431542等)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立hESC来源的肝母细胞类器官模型,并比较有无Matrigel的影响。
将H9 hESC聚集体经定型内胚层、肝母细胞分化,再在添加或不添加5% Matrigel的扩增培养基中培养,观察形态和增殖。
验证低浓度Matrigel是否支持HB-orgs的长期扩增。
比较有无Matrigel培养的HB-orgs的细胞活力、细胞周期、凋亡、衰老和自噬水平。
揭示Matrigel调控HB-orgs扩增的分子机制。
对有无Matrigel培养的HB-orgs进行RNA-seq,分析差异表达基因、KEGG通路和GSEA。
确认Matrigel通过抑制ROS-AMPK-mTOR通路维持ROS-自噬稳态。
检测ROS水平、溶酶体活性、自噬相关蛋白表达,并应用抑制剂或激活剂观察对扩增的影响。
比较有无Matrigel对肝细胞极化和成熟的影响。
将HB-orgs在有无Matrigel的肝细胞培养基中分化6天,形成P-hep-orgs和NP-hep-spheres,并通过免疫荧光、TEM、CDFDA染色评估极化结构。
验证P-hep-orgs的功能成熟度及其在药物毒性筛选中的实用性。
检测ALB分泌、胆汁酸产生、尿素合成、CYP活性、ICG摄取排泄、糖原储存;并用肝毒性化合物处理,测定TC50和MOS值。
确认Matrigel通过整合素信号促进肝细胞极化。
使用GRGDSP抑制整合素,检测极化标志物和信号通路蛋白的变化;并调节AMPK活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | mTeSR1 | Stem Cell Technologies | 85850 |
| Matrigel(生长因子减少型) | Corning | 354230 | |
| 细胞分化 | CHIR99021 | MedChemExpress | HY-10182 |
| SB431542 | MedChemExpress | HY-10431 | |
| 毛喉素 | MedChemExpress | HY-15371 | |
| 细胞培养 | Y27632 | MedChemExpress | HY-10071 |
| DMEM/F12培养基 | Gibco | C11330500BT | |
| 血清替代物 | Gibco | 10828028 | |
| 非必需氨基酸 | Gibco | 11140050 | |
| 谷氨酰胺补充剂 | Gibco | 35050061 | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | PeproTech | 100-18B | |
| 胶原酶IV | Gibco | C0130 | |
| RPMI 1640培养基 | Gibco | C11875500BT | |
| 激活素A | PeproTech | 120-14 | |
| IMDM培养基 | Gibco | C12440500BT | |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | FND500 | |
| 1-硫代甘油 | Sigma | M6145 | |
| 地塞米松 | Sigma | D4902 | |
| 二甲基亚砜 | MP Biomedical | 196055 | |
| 人胰岛素 | Sigma | 91077C | |
| 成纤维细胞生长因子4 | PeproTech | 100-31 | |
| 肝细胞生长因子 | PeproTech | 100-39 | |
| 骨形态发生蛋白2 | PeproTech | 120-02 | |
| 骨形态发生蛋白4 | PeproTech | 120-05 | |
| TrypLE消化液 | Gibco | 12604021 | |
| 烟酰胺 | Sigma | N0636 | |
| 表皮生长因子 | PeproTech | AF-100-15 | |
| 肝细胞培养基 | Lonza | CC-3199 | |
| SingleQuots补充剂 | Lonza | CC-4182 | |
| B27补充剂 | Gibco | 17504044 | |
| 制瘤素M | PeproTech | 300-10 | |
| 温和细胞解离试剂 | Stem Cell Technologies | 100-0485 | |
| 超低吸附6孔板 | Corning | 3471 | |
| 超低吸附96孔板 | Corning | 3474 | |
| 细胞活力检测 | 3D细胞活力检测试剂盒 | Promega | G9681 |
| 药物处理 | 甘露醇 | MedChemExpress | HY-N0378 |
| 曲格列酮 | MedChemExpress | HY-50935 | |
| 氯丙嗪 | Selleck | S5749 | |
| 双氯芬酸 | MedChemExpress | HY-15036 | |
| 环孢素A | MedChemExpress | HY-B0579 | |
| 奈法唑酮 | MedChemExpress | HY-B1396 | |
| 托卡朋 | MedChemExpress | HY-17406 | |
| 波生坦 | MedChemExpress | HY-A0013 | |
| 染色分析 | 5(6)-羧基-2',7'-二氯荧光素二乙酸酯 | Sigma | 21884 |
| PCR | RNAiso Plus | Takara | 9109 |
| PrimeScript逆转录预混液 | Takara | RR036B | |
| PowerUp SYBR Green | Thermo | A25742 | |
| 流式分析 | 转录因子染色缓冲液套装 | Invitrogen | 00-5523-00 |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| DAPI | Beyotime Biotechnology | C1006 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | R0020 |
| 蛋白酶抑制剂 | Beyotime Biotechnology | P1005 | |
| 磷酸酶抑制剂 | Beyotime Biotechnology | P1081 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Biosharp | BL521A | |
| 功能检测 | 人白蛋白ELISA定量试剂盒 | Bethyl | E88-129 |
| 总胆汁酸检测试剂盒 | NjjcBio | E003-2-1 | |
| 氯化铵 | Sigma | A9434 | |
| 尿素检测试剂盒 | Solarbio | BC1535 | |
| PAS染色试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C0142S | |
| 吲哚菁绿 | MedChemExpress | HY-D0711 | |
| 利福平 | Sigma | R3501 | |
| 奥美拉唑 | Sigma | O104 | |
| P450-Glo检测试剂盒 | Promega | V9002, V8422, V8791 | |
| 细胞周期分析 | 细胞周期分析试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C1052 |
| 衰老检测 | SA-β-gal染色试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C0602 |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C1062M |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | NjjcBio | E004-1-1 |
| 溶酶体检测 | Lyso-Tracker Red | Beyotime Biotechnology | C1046 |
| 凋亡检测 | 一步法TUNEL凋亡检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C1086 |
| RNA-seq | NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒 | NEB | E7530 |
| 抑制剂处理 | GRGDSP肽 | -- | -- |
| AICAR | -- | -- | |
| SR9242 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与分化 | H9细胞培养条件(饲养层、培养基),分化过程中细胞密度、培养基成分、生长因子浓度 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture; Differentiation of HB-orgs |
| 类器官扩增 | Matrigel浓度(5% vol/vol),细胞密度,培养基成分(HB-expansion medium),传代比例和频率 阅读提示:Materials and Methods: Differentiation of HB-orgs |
| 极化诱导 | 分化培养基成分,Matrigel添加,分化时间(至少6天) 阅读提示:Materials and Methods: Differentiation of HB-orgs into P-hep-orgs |
| 功能检测 | 检测试剂盒型号,培养时间点,诱导剂浓度(rifampicin 25μM, omeprazole 100μM) 阅读提示:Materials and Methods: Analysis of liver function |
| 药物毒性检测 | 细胞数量(10-20个类器官/孔),药物浓度梯度,处理时间(48小时),细胞活力测定方法 阅读提示:Materials and Methods: Assessment of the cytotoxicity of drugs |