Terc-53转基因小鼠模型的建立与表型分析
研究Terc-53对机体衰老的影响
生成过表达Terc-53和表达Terc-53反义RNA的转基因小鼠,检测Terc-53水平,进行体重、运动、认知、寿命等表型分析。
Noncoding RNA Terc-53 and hyaluronan receptor Hmmr regulate aging in mice.
包含转基因小鼠模型、细胞实验、RNA pulldown、质谱、AAV介导的基因递送、行为学等多个独立证据层级,并进行了机制验证。
Terc-53转基因小鼠 Terc−/−-Terc-53转基因小鼠 N2a细胞系 原代神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞
Terc-53过表达和敲低效果需通过Northern blot验证 Hmmr蛋白水平变化需通过免疫印迹验证 Terc-53与Hmmr、Trim25的相互作用需通过RNA pulldown和免疫共沉淀验证 Hmmr的泛素化位点K265和K736需通过质谱和突变验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究Terc-53对机体衰老的影响
生成过表达Terc-53和表达Terc-53反义RNA的转基因小鼠,检测Terc-53水平,进行体重、运动、认知、寿命等表型分析。
验证Terc-53与Hmmr的相互作用及其对Hmmr蛋白稳定性的影响
通过RNA pulldown、免疫共沉淀、凝胶迁移实验检测相互作用;过表达或敲低Terc-53检测Hmmr蛋白水平和mRNA水平;使用MG132和氯喹检测降解途径。
阐明Terc-53介导Hmmr降解的分子机制
通过体外结合实验、免疫共沉淀、免疫荧光验证Terc-53、Hmmr和Trim25的相互作用;检测泛素化类型和位点。
探究Terc-53加速脑衰老的效应机制
RNA-seq比较Terc-53过表达和Hmmr敲低细胞转录组;检测炎症细胞因子表达;免疫印迹和免疫染色检测星形胶质细胞标志物Gfap和小胶质细胞标志物Iba1。
验证Hmmr在Terc-53介导的认知衰退中的作用
在16月龄Terc−/−-Terc-53小鼠海马注射AAV-Hmmr或AAV-Hmmr2KR,进行行为学测试和炎症指标检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | 文中未明确说明 | -- |
| NeuroBasal培养基 | Gibco | 21103049 | |
| B27添加剂 | Gibco | A3582801 | |
| 原代细胞分离 | 木瓜蛋白酶 | Solarbio | G8430 |
| 药物处理 | RNA酶抑制剂 | Thermo | EO0382 |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 |
| TurboFect转染试剂 | Thermo | -- | |
| 细胞衰老染色 | 衰老β-半乳糖苷酶染色试剂盒 | Sigma | CS0030 |
| ELISA | 小鼠Il-1β ELISA试剂盒 | Neobioscience | EMC001b |
| 小鼠Il-17 ELISA试剂盒 | Neobioscience | EMC008 | |
| 小鼠Ccl7 ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKM-0161 | |
| 凝胶迁移分析 | 生物素检测试剂 | Thermo | 89880 |
| 体外转录 | MEGAscript SP6试剂盒 | Thermo | AM1320 |
| 生物素RNA标记混合物 | Roche | 11685597910 | |
| RNA处理 | RNA 5'焦磷酸水解酶 | NEB | M0356S |
| RT-qPCR | PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser) | Takara | RR047B |
| 蛋白质印迹 | Hmmr抗体 | Abcam | ab124729 |
| Trim25抗体 | Proteintech | 12573-AP | |
| GluA1抗体 | CST | 13185 | |
| Bdnf抗体 | Abclonal | AP4873 | |
| p65抗体 | Abclonal | A22676 | |
| 磷酸化p65抗体 | Abclonal | AP0475 | |
| HA抗体 | Abclonal | AE008 | |
| Flag抗体 | Abcam | ab205606 | |
| Myc抗体 | Abclonal | AE010 | |
| β-Tubulin抗体 | CST | 2128 | |
| β-actin抗体 | CST | 3700 | |
| HRP标记的抗兔IgG | CST | 7074S | |
| HRP标记的抗鼠IgG | CST | 7076S | |
| 剥离缓冲液 | Beyotime | P0025 | |
| Northern blot | North2South杂交检测试剂盒 | Thermo | 17097 |
| RNA FISH | Hmmr抗体 | Santa Cruz | sc-515221 |
| 蛋白质纯化 | Ni2+ NTA树脂 | QIAGEN | 30230 |
| 泛素化检测 | MG132 | MCE | HY-13259 |
| 氯喹 | Macklin | C798394 | |
| RNA-seq | ABclonal全RNA-seq文库制备试剂盒 | ABclonal | RK20351 |
| Illumina Novaseq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 端粒酶活性检测 | TRAPeze端粒酶检测试剂盒 | Millipore | S7700 |
| 动物实验 | 脂多糖 | Amresco | AC11974 |
| 异氟烷 | 文中未明确说明 | -- | |
| 电生理 | Multi-Clamp 700B放大器 | Molecular Devices | -- |
| Digidata 1550 B数据采集系统 | Molecular Devices | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 转基因小鼠模型 | 小鼠品系、基因型、年龄、性别 阅读提示:Methods: Animals and generation of G2 Terc−/−, Terc−/−-Terc-53, and Terc−/−-Terc-53 AS mice |
| 细胞培养 | 细胞系、培养基、血清浓度、CO2浓度、温度 阅读提示:Methods: Cell culture and transfection |
| RNA pulldown | 生物素标记RNA浓度、细胞裂解液、孵育时间、洗涤条件 阅读提示:Methods: RNA pulldown |
| 泛素化检测 | MG132浓度和处理时间、cycloheximide浓度和处理时间、氯喹浓度和处理时间 阅读提示:Methods: Examination of ubiquitination types and levels |
| AAV递送 | AAV滴度、注射体积、注射速度、注射坐标 阅读提示:Methods: Generation and delivery of adeno-associated virus (AAV) |