单细胞转录组分析
鉴定肿瘤微环境中可能参与免疫逃逸的细胞类型和基因表达特征。
对来自肺腺癌患者的配对肿瘤和癌旁组织进行scRNA-seq,分析细胞聚类及WFDC2(HE4)在恶性肿瘤细胞中的表达。
HE4 drives PD-L1 expression in myeloid cells via IFN-γR-JAK-STAT3 signaling to promote tumor immune evasion.
包含体外细胞实验、小鼠肿瘤模型、人源化模型及患者样本分析,并明确功能验证和机制验证。
LLC皮下肿瘤模型 ID8腹膜转移模型 HGS-1原位卵巢癌模型 Thp-1巨噬细胞
HE4过表达或敲除对LLC和ID8肿瘤生长的影响 mHE4-Fc重组蛋白对MC38和HE4-KO LLC肿瘤生长的影响 HE4-Fc对Raw264.7细胞PD-L1 mRNA和蛋白水平的影响 IFN-γR1敲低对HE4诱导的PD-L1表达和STAT3磷酸化的影响 抗HE4单克隆抗体(克隆#117或#10)对PD-L1表达和肿瘤生长的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定肿瘤微环境中可能参与免疫逃逸的细胞类型和基因表达特征。
对来自肺腺癌患者的配对肿瘤和癌旁组织进行scRNA-seq,分析细胞聚类及WFDC2(HE4)在恶性肿瘤细胞中的表达。
验证HE4在肿瘤生长和免疫逃逸中的作用。
通过HE4过表达或敲除的LLC和ID8细胞建立小鼠肿瘤模型,评估肿瘤生长、生存期和腹水形成。
确定胞外分泌的HE4是否足以促进肿瘤生长。
使用重组mHE4-Fc蛋白腹腔注射MC38或HE4-KO LLC肿瘤小鼠,评估肿瘤生长。
研究HE4对肿瘤微环境中髓系细胞PD-L1表达的调控。
通过流式细胞术分析LLC、MC38和ID8肿瘤中巨噬细胞、树突细胞和MDSC的PD-L1表达,并检测HE4敲除或mHE4-Fc处理的影响。
阐明HE4诱导PD-L1表达的分子机制。
使用抑制剂筛选、基因敲低、免疫共沉淀、AlphaFold3结构预测和SPR分析,确定HE4通过IFN-γR-JAK-STAT3通路调控PD-L1转录。
生成能够阻断HE4功能的单克隆抗体用于治疗。
免疫大鼠或小鼠产生抗HE4单克隆抗体,筛选出能有效阻断HE4诱导PD-L1表达的克隆(#117和#10),并通过ELISA、SPR、竞争性ELISA等验证其特异性和亲和力。
评估抗HE4抗体在多个肿瘤模型中的治疗效果和安全性。
在LLC、MC38、ID8、HGS-1、4T1等小鼠肿瘤模型中,给予抗HE4抗体治疗,并评估肿瘤生长、腹水体积、肺结节等;同时检测血清细胞因子和器官炎症。
验证抗人HE4抗体在人体肿瘤模型中的疗效及HE4作为生物标志物的临床相关性。
在PBMC人源化C-NKG小鼠中,使用抗hHE4抗体治疗OVCAR3和NCI-H358肿瘤;分析患者LUAD样本中HE4表达与免疫治疗反应的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 蛋白纯化 | 抗Flag偶联琼脂糖 | Yeasen BioTech | 2058ES08 |
| 蛋白G树脂 | GenScript | L10029 | |
| Ni-TED树脂 | GenScript | L00885 | |
| 细胞培养 | 聚乙烯亚胺(25 kDa) | Beyotime | C0537 |
| 聚凝胺 | Beyotime | C0351 | |
| 嘌呤霉素 | Beyotime | ST551 | |
| 细胞刺激 | 脂多糖 | MedChemExpress | HY-D1056 |
| 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | MedChemExpress | HY18739 | |
| 干扰素-γ | MedChemExpress | HY-P70667 | |
| 白细胞介素-4 | MedChemExpress | HY-P701093 | |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | MedChemExpress | HY-P7361 | |
| 蛋白分析 | 重组HE4-Fc蛋白 | abinScience | HC595031 |
| 抑制剂处理 | Stattic | MedChemExpress | HY-13818 |
| 鲁索替尼 | MedChemExpress | HY-50856 | |
| 氟达拉滨 | MedChemExpress | HY-B0069 | |
| 化疗药物 | 紫杉醇 | MedChemExpress | HY-B0015 |
| RNA提取 | E.Z.N.A.总RNA提取试剂盒I | Omega Biotek | D6915-04 |
| 逆转录 | Hiscript III逆转录试剂盒 | Vazyme | R302-01 |
| qPCR | SYBR Green qPCR预混液 | Vazyme | Q311 |
| ELISA | 小鼠IFN-γ ELISA试剂盒 | BioLegend | 430804 |
| 人IFN-γ ELISA试剂盒 | BioLegend | 430104 | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | BioLegend | 430904 | |
| 人HE4 ELISA试剂盒 | Cusabio | CSB-E12923h | |
| 小鼠HE4 ELISA试剂盒 | Cusabio | CSB-EL026092MO | |
| 人颗粒酶B ELISA试剂盒 | Cusabio | CSB-E08718h | |
| 小鼠心肌肌钙蛋白I ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKM-0153 | |
| 小鼠颗粒酶B ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0594 | |
| 小鼠C反应蛋白ELISA试剂盒 | Beyotime | PC186 | |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0044 | |
| 生化检测 | 小鼠ALT试剂盒 | Elabscience | E-BC-K235-S |
| 小鼠AST试剂盒 | Elabscience | E-BC-K236-M | |
| Amplex Red肌酐检测试剂盒 | Beyotime | S0291S | |
| 流式细胞术 | Zombie Violet细胞活力检测试剂盒 | BioLegend | 423114 |
| 细胞增殖 | 细胞计数试剂盒-8 | MedChemExpress | HY-K0301 |
| 流式细胞术 | NovoCyte Quanteon流式细胞仪 | Agilent | -- |
| SPR分析 | WeSPR 100系统 | XLement | -- |
| 细胞培养 | HEK293T细胞 | ATCC | CRL-11268 |
| LLC细胞 | ATCC | CRL-1642 | |
| ID8细胞 | Quicell Biotech | I451 | |
| RAW264.7细胞 | ATCC | TIB-71 | |
| THP-1细胞 | ATCC | TIB202 | |
| 4T1细胞 | ATCC | CRL-2539 | |
| MC38细胞 | ATCC | CRL-2640 | |
| HGS-1细胞 | CancerTools.org | 160537 | |
| 动物实验 | C57BL/6JGpt小鼠 | GemPharmatech | N000013 |
| BALB/cJGPT小鼠 | GemPharmatech | N000020 | |
| FVB/NJGpt小鼠 | GemPharmatech | N000026 | |
| Cd274基因敲除小鼠 | GemPharmatech | T009724 | |
| Rag1基因敲除小鼠 | Cyagen Biosciences | C001197 | |
| C-NKG小鼠 | Cyagen Biosciences | C001316 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外细胞实验 | 细胞系、处理浓度、处理时间 阅读提示:STAR★Methods, Cell stimulation |
| 小鼠肿瘤模型 | 细胞系、接种数量、接种途径、小鼠品系 阅读提示:STAR★Methods, Murine syngeneic tumor models |
| HE4-Fc处理 | 给药剂量、频率、时间 阅读提示:STAR★Methods, Murine syngeneic tumor models |
| 流式细胞术 | 抗体克隆、稀释度、染色条件 阅读提示:STAR★Methods, Flow cytometry |
| 临床样本分析 | 患者队列、治疗反应标准 阅读提示:STAR★Methods, Human specimen collection |