体内MCAO/R模型建立及药物处理
验证3Y对脑缺血再灌注损伤的治疗效果
成年雄性C57BL/6小鼠建立MCAO/R模型(阻塞60分钟),再灌注后1小时腹腔注射3Y(5 mg/Kg)或生理盐水,每日一次。
Restricting Synaptotagmin-3 Internalization Mitigates Cerebral Ischemia/Reperfusion Injury by Curtailed Neuronal Apoptosis and Microglial Re-Programming.
研究包含体内MCAO/R模型、体外OGD/R细胞模型及snRNA-seq多层级证据,并进行了功能验证和机制验证。
C57BL/6小鼠MCAO/R模型 HT22小鼠海马神经元细胞系 BV2小鼠小胶质细胞系 snRNA-seq分析的小鼠梗死周围组织细胞
3Y给药剂量为5 mg/Kg,腹腔注射,再灌注后1小时开始,每日一次 MCAO/R模型:大脑中动脉阻塞60分钟后再灌注 体外OGD/R:缺氧2小时,复氧22小时 3Y处理浓度2 μM(体外),H89浓度10 μM(体外) snRNA-seq:在再灌注后24小时取梗死周围组织
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证3Y对脑缺血再灌注损伤的治疗效果
成年雄性C57BL/6小鼠建立MCAO/R模型(阻塞60分钟),再灌注后1小时腹腔注射3Y(5 mg/Kg)或生理盐水,每日一次。
评估3Y对神经功能缺损的影响
通过mNSS、转棒疲劳、黏附去除和足失误实验评估神经功能。
评估3Y的神经保护作用
TTC染色测定脑梗死体积,干湿重法测定脑水肿。
验证3Y对神经元和小胶质细胞的作用及机制
HT22细胞OGD 2h后复氧,在复氧1h时加入3Y(2μM)或/和H89(10μM),收集条件培养基(CM)处理OGD受损的BV2细胞。
揭示3Y对细胞类型和基因表达的影响
在再灌注后24小时分离梗死周围组织,制备单核悬液,进行3'单细胞RNA测序,分析细胞类型、差异表达基因和信号通路。
探究3Y调节小胶质细胞表型的潜在机制
利用CellPhoneDB分析细胞间配体-受体互作,评估小胶质细胞功能评分,并进行KEGG通路富集;体外验证cAMP/PKA通路。
验证凋亡和炎症相关蛋白及细胞类型
通过Western blot、qRT-PCR、ELISA、免疫荧光、TUNEL和FJC染色检测凋亡和炎症标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | 硅胶尼龙线 | -- | -- |
| PeriFlux System 5000 | Perimed | -- | |
| 药物处理 | Tat-GluA2-3Y | GL Biochem Ltd. | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Hyclone | -- | |
| 细胞处理 | 无糖DMEM培养基 | Corning | -- |
| H89 | -- | -- | |
| 蛋白提取 | 蛋白提取试剂盒 | Beyotime Biotech | -- |
| 蛋白定量 | Nanodrop分光光度计ND-2000 | ThermoFisher | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | HiScript Q RT SuperMix试剂盒 | Vazyme | -- |
| UltraSYBR Mixture | Comwin Biotech | -- | |
| CFX96实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗Syt3抗体 | Novus | NBP1-19320 | |
| 抗caspase3抗体 | Proteintech | 19677-1-AP | |
| 抗Bax抗体 | Proteintech | 50599-2-Ig | |
| 抗Bcl-2抗体 | Proteintech | 26593-1-AP | |
| 抗iNOS抗体 | CST | 13120 | |
| 抗Arg-1抗体 | CST | 93668 | |
| 抗β-actin抗体 | Affinity Biosciences | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 抗ATP1A1抗体 | Proteintech | 55187-1-AP | |
| 抗Histone H3抗体 | Proteintech | 17168-1-AP | |
| 抗磷酸化PKA抗体 | Affinity | AF7246 | |
| 抗PKA抗体 | Affinity | AF7746 | |
| 抗磷酸化CREB抗体 | CST | 9198 | |
| 抗CREB抗体 | CST | 9197 | |
| 增强化学发光试剂盒 | Millipore | -- | |
| 凝胶成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 组织学染色 | FJC试剂盒 | Biosensis | -- |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Sigma-Aldrich | -- |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 抗NeuN抗体 | CST | 24307 | |
| 抗Syt3抗体 | Novus | NBP1-19320 | |
| 抗Iba-1抗体 | Abcam | ab283319 | |
| 抗iNOS抗体 | CST | 13120 | |
| 抗Arg-1抗体 | CST | 93668 | |
| Alexa Fluor 488二抗 | Invitrogen | -- | |
| Alexa Fluor 594二抗 | Invitrogen | -- | |
| Alexa Fluor 546二抗 | Invitrogen | -- | |
| DAPI | Abcam | -- | |
| TUNEL | 一步法TUNEL原位凋亡检测试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co. Ltd. | -- |
| 显微镜 | 荧光显微镜 | Nikon | -- |
| 单核分离 | MACS组织保存液 | Miltenyi Biotech | 130-100-008 |
| 细胞核制备试剂盒 | CapitalBio | XS0100101 | |
| 杜恩斯匀浆器 | MACS | -- | |
| 裂解缓冲液 | -- | -- | |
| RNA酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 40微米过滤器 | Miltenyi Biotech | -- | |
| 自动细胞计数器 (CauntStar Rigel S2) | -- | -- | |
| snRNA-seq | Chip A单细胞试剂盒v2.0 | MobiDrop | S050100201 |
| MobiNova-100 | MobiDrop | A1A40001 | |
| MobiNovaSP-100 | MobiDrop | A2A40001 | |
| 高通量单细胞3' RNA-seq试剂盒v2.0 | MobiDrop (Zhejiang) Co. Ltd. | S050200201 | |
| 3'单索引试剂盒 | MobiDrop (Zhejiang) Co. Ltd. | S050300201 | |
| Illumina NovaSeq 6000测序系统 | CapitalBio Technology | -- | |
| ELISA | TNF-α、IL-1β、IL-10、TGF-β1 ELISA试剂盒 | Absin | -- |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MCAO/R模型 | 手术细节包括线栓直径0.21mm、阻塞时间60分钟、CBF下降75%以上作为成功标准 阅读提示:参见Material and Methods 2.1 |
| 药物处理 | 3Y剂量5 mg/Kg,腹腔注射,再灌注后1小时开始,每日一次 阅读提示:参见Material and Methods 2.1 |
| 细胞培养与OGD/R模型 | HT22和BV2细胞系来源,OGD 2小时,复氧22小时,3Y浓度2 μM,H89浓度10 μM 阅读提示:参见Material and Methods 2.2 |
| snRNA-seq | 取样时间(再灌注后24小时)、组织区域(peri-infarct)、过滤条件(线粒体基因<10%,基因数200-5000) 阅读提示:参见Material and Methods 2.3, 2.4, 2.5, 2.6 |
| 行为学测试 | mNSS评分、转棒速度加速至40rpm、黏附去除时间、足失误百分比的计算公式 阅读提示:参见Material and Methods 2.7 |