验证Enz诱导PCa细胞铜死亡
检测Enz处理是否诱导铜死亡及其特征。
对接受AR拮抗剂治疗的患者肿瘤组织进行红氨酸染色检测铜积累,免疫组化检测LIAS表达,免疫荧光检测DLAT寡聚化;对C4-2和22Rv1细胞进行Enz处理,检测线粒体形态、铜离子水平、DLAT寡聚化、Fe-S蛋白降解等。
PDHA1-acetylation signaling suppresses cuproptosis to attenuate anti-androgen effect in prostate cancer.
包含细胞系体外实验、小鼠异种移植模型、类器官模型及PDX模型,并涵盖功能验证(敲低/过表达)与机制验证(代谢组学、ChIP-seq)。
PCa细胞系(22Rv1、C4-2) 22Rv1异种移植小鼠模型 P10P53敲除小鼠类器官模型 CRPC患者来源异种移植(PDX)模型
PDHA1敲低或过表达后Enz或ES处理下的细胞活力变化(CCK8) PDHA1敲低后细胞内铜离子水平、GSH水平及铜死亡标志蛋白(HSP70、LIAS、FDX1)变化 PDHA1过表达后H3K27ac在SLC7A11启动子区域的富集(ChIP-seq/ChIP-qPCR) 体内模型中PDHA1敲低或CPI-613与Enz联合用药对肿瘤生长的影响(肿瘤体积、重量) CPI-613与Enz联合用药的协同效应(CI<1)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测Enz处理是否诱导铜死亡及其特征。
对接受AR拮抗剂治疗的患者肿瘤组织进行红氨酸染色检测铜积累,免疫组化检测LIAS表达,免疫荧光检测DLAT寡聚化;对C4-2和22Rv1细胞进行Enz处理,检测线粒体形态、铜离子水平、DLAT寡聚化、Fe-S蛋白降解等。
评估PDHA1表达是否与Enz耐药和不良预后相关。
交叉比对三个Enz耐药GEO数据集与铜死亡相关基因,筛选出PDHA1;通过免疫组化检测Enz耐药和敏感患者组织中PDHA1表达;利用TCGA和TMA数据分析PDHA1表达与生存预后的关系;检测PCa细胞系中PDHA1表达水平及Enz处理后的变化。
确定PDHA1是否调节Enz诱导的铜死亡。
构建PDHA1敲低和过表达稳定细胞系,通过CCK8检测细胞活力,通过PI染色检测细胞死亡,通过铜离子检测试剂盒和CS1探针检测铜离子水平,通过Western blot检测铜死亡标志蛋白。
评估PDHA1敲低在体内对Enz疗效的影响。
将稳定敲低PDHA1或对照的22Rv1细胞皮下注射至裸鼠,以20 mg/kg的Enz腹腔注射给药,每三天一次,共21天,测量肿瘤体积和重量,并进行组织学分析。
阐明PDHA1通过代谢和表观遗传途径调控铜死亡的机制。
对PDHA1敲低细胞进行非靶向代谢组学分析,检测GSH和半胱氨酸水平,评估SLC7A11表达,并通过ChIP-seq和ChIP-qPCR检测H3K27ac在SLC7A11启动子区域的结合。
测试PDHA1抑制剂CPI-613联合Enz是否能协同增强抗肿瘤效果。
体外实验中,用不同浓度的Enz和CPI-613处理PCa细胞,计算组合指数;在类器官模型中观察细胞死亡;在异种移植和PDX模型中评估联合治疗的肿瘤抑制作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 恩杂鲁胺 | Selleck Chemicals | S1250 |
| 铁死亡抑制剂-1 | Selleck Chemicals | S7243 | |
| Z-VAD-FMK | Selleck Chemicals | S7023 | |
| 埃勒斯洛莫 | Selleck Chemicals | S1052 | |
| CPI-613 | APExBIO | A4333 | |
| JQAD1 | MedChemExpress | HY-145765 | |
| 铜离子检测 | 铜传感器-1 | MedChemExpress | HY-141511 |
| 药物处理 | 四硫代钼酸铵 | Sigma-Aldrich | 323446 |
| 铜 | Sigma-Aldrich | 349216 | |
| Western blot | 硫辛酸抗体 | Abcam | ab58724 |
| HSP70抗体 | Proteintech | 10995-1-AP | |
| LIAS抗体 | Proteintech | 11577-1-AP | |
| FDX1抗体 | Proteintech | 12592-1-AP | |
| DLAT抗体 | Proteintech | 13426-1-AP | |
| PDHA1抗体 | Proteintech | 18068-1-AP | |
| p-PDHA1抗体 | Proteintech | 29582-1-AP | |
| α-微管蛋白抗体 | Proteintech | 11224-1-AP | |
| H3抗体 | Proteintech | 17168-1-AP | |
| ChIP | H3K27ac抗体 | Abclonal | A7253 |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | GIBCO | C11875500BT |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | FSP500 | |
| 青霉素-链霉素 | GIBCO | 15140-122 | |
| 细胞活力检测 | CCK8检测试剂盒 | APExBIO | K1018 |
| 细胞死亡检测 | DAPI | Servicebio | G1012 |
| 碘化丙啶 | Servicebio | G1021 | |
| 倒置荧光显微镜 | Olympus | IX71 | |
| 克隆形成实验 | 结晶紫 | -- | -- |
| Quantity One 1-D分析软件 | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Cwbiotech | CW2200S | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Cwbiotech | CW2383S | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0011 | |
| 5× SDS-PAGE蛋白上样缓冲液 | Beyotime | P0286 | |
| PVDF膜 | Millipore | ISEQ00010 | |
| RT-qPCR | RNA快速纯化试剂盒 | ESscience | #RN001 |
| qPCR SYBR Green预混液 | Vazyme | Q711 | |
| cDNA SuperMix试剂盒 | Vazyme | R333 | |
| ABI QuantStudio DX实时PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 慢病毒包装 | pLVX-puro载体 | Youbio | -- |
| 铜离子检测 | 细胞铜比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K775-M |
| 铜离子检测(组织) | 铜比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K300-M |
| 荧光成像 | 徕卡SP8 STED 3X共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| 半胱氨酸检测 | CheKine™微量半胱氨酸检测试剂盒 | Abbkine | KTB1450 |
| GSH检测 | 单氯二胺 | MedChemExpress | HY-101899 |
| 贝克曼流式细胞仪 | Beckman | -- | |
| FlowJo v10软件 | FlowJo | -- | |
| 非靶向代谢组学 | Pegasus HT飞行时间质谱 | Leco Corp. | -- |
| 安捷伦7890B气相色谱 | Agilent | 7890B | |
| Gerstel MPS2多功能自动进样器 | Gerstel | -- | |
| ChIP | ChIP检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Protein A/G磁珠 | -- | -- | |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | GemPharmatech LLC | -- |
| NSG小鼠 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | PCa细胞系(22Rv1、C4-2)和正常前列腺细胞RWPE1的来源;培养基(RPMI-1640)添加10% FBS和1%青霉素-链霉素;常规进行支原体检测。 阅读提示:Materials and Methods - Cell Culture |
| 药物处理 | Enz处理浓度(20或40 μM)、时间(24或48 h);TTM浓度(5 μM);Fer-1浓度(5 μM);Z-VAD浓度(10 μM);ES浓度(2 nM);CPI-613浓度。 阅读提示:Materials and Methods - Materials; Cell Viability Assay |
| 细胞活力检测 | CCK8实验的细胞密度(5×10^3)、处理时间、CCK8试剂添加时间(结束前1-2小时),以及OD450的读取。 阅读提示:Materials and Methods - Cell Viability Assay |
| PDHA1敲低和过表达 | shRNA靶向序列(#1: GGAUUGCUCUAGCCUGUAATT; #2: GCUGCUGCCUAUUGUAGAUTT);慢病毒感染时间和筛选条件(嘌呤霉素10 μg/mL,14天)。 阅读提示:Materials and Methods - Establishment of PDHA1 Knockdown and Overexpression Cell Lines |
| 铜离子检测 | 细胞数量(2×10^6)、处理时间(24 h);组织样本处理(0.1 g制备10%匀浆)。 阅读提示:Materials and Methods - Copper Ion Detection |
| GSH检测 | 单氯二胺浓度(20 μM)、孵育时间(2 h)、温度(25°C);流式细胞仪和分析软件。 阅读提示:Materials and Methods - Glutathione (GSH) Detection |
| ChIP实验 | 抗体(H3K27ac和IgG)、交联条件(1%甲醛)、超声条件、磁珠孵育时间和温度。 阅读提示:Materials and Methods - ChIP Assay and ChIP-sequence Analysis |
| 体内动物实验 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠和NSG小鼠)、注射细胞数量(3×10^6)、给药方式(腹腔注射)、剂量(Enz 20 mg/kg,CPI-613 20 mg/kg)、频率(每3天一次)、治疗周期(21天)和每组样本量(n=5或n=3)。 阅读提示:Materials and Methods - Xenograft Mouse Model |