鉴定YM101敏感与耐药肿瘤的分子特征
探索YM101疗效异质性的分子基础。
对YM101敏感和耐药的EMT-6和CT26肿瘤进行批量RNA测序,分析差异基因和通路富集,并检测细胞因子表达。
Triple targeting of STING, TGF-β, and PD-L1 boosts CXCL16-CXCR6 signaling for potent antitumor response.
包含体外细胞实验、多种小鼠肿瘤模型、条件敲除小鼠、单细胞RNA测序、蛋白质组学等多层级验证,并明确功能与机制验证。
EMT-6小鼠乳腺癌模型 CT26小鼠结肠癌模型 B16小鼠黑色素瘤模型 MC38小鼠结肠癌模型 Cxcr6条件敲除小鼠模型 Stat1条件敲除小鼠模型
STING激动剂MSA-2与TGF-β×PD-L1双特异性抗体YM101联合使用 Cxcr6fl/flCd3e-Cre小鼠中CXCR6+T细胞的缺失 CXCL16中和抗体阻断 Stat1fl/flLyz2-CreERT2小鼠中髓系细胞STAT1的缺失
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探索YM101疗效异质性的分子基础。
对YM101敏感和耐药的EMT-6和CT26肿瘤进行批量RNA测序,分析差异基因和通路富集,并检测细胞因子表达。
评估STING激动剂MSA-2联合YM101是否能增强抗肿瘤疗效。
在EMT-6、CT26和B16模型中,用MSA-2和YM101单独或联合处理,监测肿瘤生长和生存期。
阐明联合治疗增强抗肿瘤免疫的细胞机制。
对EMT-6肿瘤进行单细胞RNA测序,分析免疫细胞亚群、T细胞状态和细胞间通讯。
在蛋白水平上验证联合治疗对CXCL16-CXCR6轴的影响。
通过流式细胞术分析肿瘤浸润CD8+ T细胞中CXCR6、颗粒酶B、穿孔素等表达,以及髓系细胞中CXCL16表达。
确证CXCR6+CD8+ T细胞和CXCL16-CXCR6轴是联合治疗疗效所必需的。
使用Cxcr6条件敲除小鼠、过继转移CXCR6+ T细胞、CXCL16中和抗体等实验,评估肿瘤生长和生存期。
阐明STING激动剂和TGF-β阻断调控CXCL16表达的分子机制。
在人巨噬细胞和DC中,用MSA-2和TGF-β1处理,检测CXCL16表达,并通过报告基因、ChIP、Western blot等验证STAT1的作用。
构建三重靶向ISAC Y101S,并评估其抗肿瘤疗效和安全性。
通过连接子将YM101与MSA-2偶联形成Y101S,在CT26、4T1和EMT-6模型中评估其抗肿瘤效果、免疫调节作用和安全性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | C11875500BT |
| DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT | |
| 胎牛血清 | Excell | FSP500 | |
| 药物处理 | MSA-2 | MCE | HY-136927 |
| 抗体治疗 | YM101 | Wuhan YZY Biopharma | -- |
| 抗TGF-β抗体 | Wuhan YZY Biopharma | -- | |
| 抗PD-L1抗体 | Wuhan YZY Biopharma | -- | |
| CXCL16中和抗体 | R&D Systems | MAB503 | |
| 大鼠IgG2A同型对照 | R&D Systems | MAB006 | |
| 细胞因子检测 | IFN-β ELISA试剂盒 | R&D Systems | MIFNB0 |
| 多重微球检测试剂盒 | BioLegend | 741043 | |
| 多重微球检测试剂盒 | BioLegend | 740451 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| RNA-seq文库制备 | KC-Digital链特异性mRNA文库制备试剂盒 | Seqhealth | DR08502 |
| 组织消化 | 胶原酶B | Roche | 11088807001 |
| 透明质酸酶 | Sigma-Aldrich | H3884 | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Absin | abs47047435 | |
| 细胞培养 | 白细胞介素-2 | Beijing Fourrings | -- |
| OVA肽SIINFEKL | GenScript | RP10611 | |
| 流式细胞术 | 抗CXCR6抗体 | BioLegend | 151109 |
| 抗CD8抗体 | Elabscience | E-AB-F1104 | |
| 细胞毒性实验 | CFSE(羧基荧光素二醋酸盐琥珀酰亚胺酯) | MCE | 150347-59-4 |
| 碘化丙啶 | MCE | 25535-16-4 | |
| NK细胞清除 | 抗NK1.1抗体 | BioXCell | BE0036 |
| IgG同型对照 | BioXCell | BE0085 | |
| 动物模型 | 他莫昔芬 | -- | -- |
| 免疫磁珠分选 | 小鼠CD8+ T细胞分离试剂盒 | STEMCELL Technologies | 19853 |
| 小鼠CD4+ T细胞分离试剂盒 | STEMCELL Technologies | 19852 | |
| 免疫荧光染色 | DAPI染色液 | CST | 4083 |
| qPCR | FastPure细胞/组织总RNA提取试剂盒V2 | Vazyme | RC112 |
| HiScript II Q Select RT SuperMix逆转录试剂盒 | Vazyme | R233 | |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Vazyme | DL101 |
| ChIP | 高灵敏度ChIP试剂盒 | Abcam | ab185913 |
| 抗STAT1抗体 | CST | 9172 | |
| 非免疫IgG | CST | 2729 | |
| ELISA | 人IFN-β DuoSet ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY814-05 |
| 人CXCL16 Quantikine ELISA试剂盒 | R&D Systems | DCX160 | |
| 小鼠CXCL16 DuoSet ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY503 | |
| 体外刺激 | 转化生长因子-β1 | GenScript | Z03411 |
| 抗IFNAR1抗体 | MCE | HY-P990439 | |
| N-乙酰半胱氨酸 | MCE | HY-B0215 | |
| 转染 | Hieff Trans 体外siRNA/miRNA转染试剂 | Yeasen | 40806ES03 |
| 蛋白质印迹 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012 |
| ECL化学发光检测试剂盒 | Thermo Fisher | 34577 | |
| ChemiDoc XRS+成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| ISAC合成 | Fmoc-Val-Cit-PAB连接子 | New Research Biosciences | Y-PE-4775 |
| Mal-PEG4-NHS连接子 | New Research Biosciences | Y-PE-2017 | |
| Traut试剂 | Bidepharm | BD75935 | |
| Amicon超滤离心管 | Millipore | UFC501096 | |
| Ellman试剂 | Yeasen | 60306ES08 | |
| ISAC表征 | 三(2-羧乙基)膦盐酸盐 | Beyotime | ST045 |
| 生化分析 | 自动生化分析仪 | Landwind | LW C400 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系培养 | 细胞系来源和培养基组成 阅读提示:Methods: Cell lines and agents |
| 动物模型建立 | 小鼠品系、周龄、接种细胞数量和部位 阅读提示:Methods: Murine tumor models for evaluating YM101 antitumor efficacy |
| 药物处理 | YM101剂量、MSA-2剂量和给药途径 阅读提示:Methods: Murine tumor models for evaluating YM101 antitumor efficacy |
| 流式细胞术 | 组织消化条件、抗体克隆号和染色方案 阅读提示:Methods: Flow cytometry assays of tumor tissues |
| CXCL16阻断 | CXCL16中和抗体剂量和给药方案 阅读提示:Methods: In vivo tumor model with CXCL16 blockade |
| 条件敲除小鼠 | 基因型、他莫昔芬诱导方案(Stat1模型) 阅读提示:Methods: Generating cKO mice |