建立DIHF易感模型并评估心脏功能
验证肠道微生物群是否与DIHF易感性相关
将大鼠单独饲养诱导个体差异,腹腔注射DOX(3mg/kg,每周一次,共5次)构建DIHF模型,通过超声心动图评估LVEF和LVFS,根据LVEF下降程度分为DIHF-HS和DIHF-LS组。
Butyrate ameliorates doxorubicin-induced heart failure by inhibiting cardiomyocyte ferroptosis through the gut-heart axis.
涉及大鼠DIHF易感模型、FMT、体外心肌细胞实验、体内NaB干预、多组学分析及蛋白表达检测,并进行功能验证和机制验证。
大鼠DIHF易感模型(Sprague-Dawley大鼠) H9C2大鼠心肌细胞 AC16人心肌细胞
DOX给药剂量:3 mg/kg,每周一次,共5次(总剂量15 mg/kg),腹腔注射 NaB干预浓度:1%(w/w)饮水补充 细胞实验DOX处理浓度:250 ng/mL,处理24小时 细胞实验NaB处理浓度:100、250、500 μg/mL FMT实验:抗生素处理7天,后灌胃供体粪便上清
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证肠道微生物群是否与DIHF易感性相关
将大鼠单独饲养诱导个体差异,腹腔注射DOX(3mg/kg,每周一次,共5次)构建DIHF模型,通过超声心动图评估LVEF和LVFS,根据LVEF下降程度分为DIHF-HS和DIHF-LS组。
探索DIHF易感性与肠道微生物组成和代谢物的关系
对粪便进行16S rRNA V3-V4测序和LC-MS代谢组学分析,测定血清丁酸盐浓度,比较DIHF-HS和DIHF-LS组的微生物多样性、组成和代谢物差异。
验证肠道菌群差异是否导致DIHF易感性差异
将DIHF-LS和DIHF-HS组大鼠粪便悬液灌胃给经抗生素清除肠道菌群的受体大鼠,然后进行DOX处理,通过超声心动图评估心脏功能。
验证丁酸钠是否减轻DOX诱导的心肌细胞损伤
H9C2和AC16心肌细胞先用DOX处理24小时,再用不同浓度NaB处理,检测细胞活力、ROS水平和细胞死亡率。
验证NaB是否能改善DIHF,并探索其机制
DIHF模型大鼠在DOX处理期间饮水给予1% NaB,评估心脏功能、组织学变化和血清丁酸盐水平,并检测肠道屏障功能和心脏细菌易位。
验证NaB是否增强肠道屏障功能,减少细菌易位
通过HE染色评估结肠损伤,免疫荧光检测紧密连接蛋白Claudin-1和ZO-1,AB-PAS染色检测杯状细胞,qRT-PCR检测Muc2和Tff3表达,ELISA检测LPS。
探究NaB对心脏内细菌组成和功能的影响
利用FISH检测心脏组织细菌,采用5R 16S rRNA测序分析心脏细菌组成,并通过PICRUSt2预测功能,同时检测心脏Fe2+水平。
验证NaB是否通过GPX4/GSH通路抑制铁死亡
在H9C2细胞和心脏组织中检测GPX4表达、GSH和MDA浓度,并用Erastin诱导铁死亡观察NaB效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | 兔GPX4多克隆抗体 | beyotime | AF7020 |
| 兔抗β-肌动蛋白 | beyotime | AF5003 | |
| 免疫荧光 | 兔ZO-1多克隆抗体 | proteintech | 21773-1-AP |
| 兔Claudin 1多克隆抗体 | proteintech | 28674-1-AP | |
| 兔E-钙黏蛋白多克隆抗体 | Servicebio | GB11868-100 | |
| 兔连接蛋白43多克隆抗体 | Servicebio | GB11234-100 | |
| Western blot | 辣根过氧化物酶标记二抗 | ZSBG-Bio | 7077S |
| BeyoECL Plus化学发光试剂 | beyotime | P0018S | |
| 动物实验 | 丁酸钠 | Macklin | 156-54-7 |
| 细胞死亡检测 | 碘化丙啶 | Solarbio | C0080 |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Vivacell | C04001 |
| 铁死亡诱导 | Erastin | beyotime | SC0224-5mg |
| 细胞核染色 | DAPI试剂 | Solarbio | D1306 |
| 动物实验 | 阿霉素 | Macklin | D2975000 |
| FMT抗生素处理 | 万古霉素 | Macklin | V-200-25 |
| 新霉素 | Macklin | N-620-100 | |
| 甲硝唑 | Macklin | 443-48-1 | |
| 血清TC测量 | 大鼠总胆固醇比色检测试剂盒 | Mreda | M053567 |
| 血清丁酸盐测量 | 大鼠丁酸比色检测试剂盒 | ELK biotechnology | ELK8174774ELK8174ELK |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | beyotime | S0033S |
| LPS测量 | 大鼠LPS ELISA试剂盒 | Animaluni | LV20685 |
| GSH测量 | GSH比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K030-M |
| MDA测量 | MDA比色检测试剂盒 | Solarbio | E-BC-K025-M |
| RNA提取 | Flash细胞/组织总RNA提取试剂盒 | YEASEN | 19221ES50 |
| RT-qPCR | 2×Q3 SYBR qPCR预混液 | TOLOBIO | 22204-02 |
| cDNA合成 | ToloScript一步法逆转录预混液 | TOLOBIO | 22107 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Biosharp | BL521A |
| Fe2+染色 | Lillie's亚铁染色试剂盒 | Solarbio | G3320 |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Solarbio | Ca1210 |
| 杯状细胞染色 | AB-PAS染色试剂盒 | Solarbio | G1285 |
| 肝功能检测 | Amplex Red AST活性检测试剂盒 | beyotime | P2715S |
| Amplex Red ALT活性检测试剂盒 | beyotime | P2711S | |
| 肾功能检测 | Amplex Red肌酐检测试剂盒 | beyotime | S0291S |
| 尿素比色检测试剂盒 | beyotime | S0574S | |
| 细胞培养 | 人AC16心肌细胞 | Millipore | SCC109 |
| 大鼠H9C2(2-1)心肌细胞 | HyCyte | TCR-C607 | |
| FISH | EUB338 FISH探针 | FUBO-Biology | FBFP130 |
| Western blot | Immobilon-P PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | C11885500BT |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 大鼠品系、性别、年龄、体重、饲养条件;DOX给药剂量、频率、途径;分组标准(LVEF下降率);NaB浓度和给药方式;观测时间点 阅读提示:STAR Methods 实验模型和动物模型、易感性模型建立、NaB补充试验 |
| 细胞实验 | 细胞系、培养条件;DOX和NaB处理浓度、时间;细胞活力检测方法(CCK-8);ROS检测方法(DCFH-DA);细胞死亡检测(PI染色) 阅读提示:STAR Methods H9C2/AC16心肌细胞培养、细胞活力测量 |
| 菌群分析 | 粪便样本采集、DNA提取、16S rRNA V3-V4扩增引物和条件;测序平台;生物信息学分析流程(Chao1、Shannon、PCA、LEfSe、PICRUSt) 阅读提示:STAR Methods 16S rRNA基因测序、数据处理与分析 |
| 代谢组学分析 | 样本处理、LC-MS条件;数据预处理;PCA、OPLS-DA;差异代谢物筛选标准(VIP>1, p<0.05);KEGG富集分析 阅读提示:STAR Methods 非靶向代谢物谱分析 |
| FMT | 受体大鼠抗生素处理、供体粪便制备、灌胃剂量和时间、DOX处理方案 阅读提示:STAR Methods 粪菌移植 |
| 心脏细菌检测 | 心脏组织FISH探针EUB338序列和使用浓度;5R 16S rRNA测序操作方法;Fe2+染色试剂和方法 阅读提示:STAR Methods 荧光原位杂交、组织学和免疫组化 |
| 铁死亡检测 | GPX4和β-actin抗体稀释比例;Western blot条件;GSH、MDA检测试剂盒型号和步骤;RT-qPCR引物和条件 阅读提示:STAR Methods Western blotting、MDA/GSH测量、RNA提取和实时PCR |
| 统计分析 | 统计检验方法(t检验、ANOVA、Kruskal-Wallis等);显著性水平;数据表示(mean±SEM或SD);相关性分析(Pearson) 阅读提示:STAR Methods 定量和统计分析 |