B. infantis对AIP小鼠病理的影响
验证B. infantis定植是否加重轻度AIP小鼠的胰腺炎症和纤维化。
给轻度AIP小鼠灌胃不同剂量(低、中、高)的B. infantis,通过HE染色、Picro Sirius Red染色和IHC检测胰腺炎症、纤维化及Fibronectin和α-SMA表达。
Bifidobacterium Infantis Promotes FOSL1-Mediated Transcriptional Repression of VDR to Accelerate Autoimmune Pancreatitis Progression Through Activation of Oxidative Stress.
包含小鼠AIP模型、细胞实验、转录组测序、功能验证(敲低/中和)和机制验证(ChIP-qPCR、双荧光素酶)多层级证据。
MRL/MpJ小鼠AIP模型 小鼠胰腺浸润pDCs AIP患者血液样本
B. infantis灌胃剂量(低、中、高:1×10⁷、1×10⁸、1×10⁹ CFU/mL) poly(I:C)注射剂量(10 µg诱导轻度AIP,100 µg诱导重度AIP) BST2中和抗体剂量(100 µg) sh-FOSL1和sh-VDR慢病毒敲低
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证B. infantis定植是否加重轻度AIP小鼠的胰腺炎症和纤维化。
给轻度AIP小鼠灌胃不同剂量(低、中、高)的B. infantis,通过HE染色、Picro Sirius Red染色和IHC检测胰腺炎症、纤维化及Fibronectin和α-SMA表达。
验证B. infantis对AIP的促进作用是否依赖于pDCs。
使用BST2抗体中和pDCs,检测胰腺炎症、纤维化、pDCs比例及IFN-α、IL-33、IL-13水平。
验证B. infantis是否能直接激活从AIP小鼠分离的pDCs。
从不同炎症程度小鼠分离pDCs,用B. infantis刺激,检测IFN-α、IL-33分泌、pDCA-1和Siglec-H表达,以及B. infantis与pDCs的相互作用。
通过转录组测序筛选B. infantis激活pDCs的关键转录因子。
对B. infantis灌胃或对照的轻度AIP小鼠胰腺浸润pDCs进行转录组测序,并与转录因子数据库交叉筛选。
验证FOSL1在B. infantis加重AIP中的作用。
通过尾静脉注射sh-FOSL1慢病毒敲低FOSL1,评估胰腺炎症、纤维化、pDCs活化和细胞因子水平。
确定FOSL1是否直接靶向并抑制VDR转录。
通过Western blot检测VDR蛋白表达,ChIP-qPCR检测FOSL1与VDR启动子结合,双荧光素酶报告基因检测转录活性,RT-qPCR检测VDR mRNA水平。
评估B. infantis对pDCs氧化应激的影响,以及FOSL1敲低是否改善氧化应激。
检测胰腺组织或pDCs中MDA、SOD、H2O2、GSH和ROS水平。
验证VDR是FOSL1下游的关键效应分子。
在FOSL1敲低的基础上,额外敲低VDR,观察AIP病理和氧化应激指标的逆转。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| B. infantis培养 | 婴儿双歧杆菌35624 | Shanghai Ruichu Biotech Co., Ltd. | -- |
| MRS培养基 | HuaiKai Microbial | 027319 | |
| AIP诱导 | 聚肌胞苷酸 | Merck KGaA | P9582 |
| MRL/MpJ小鼠 | CAVENS | C000117 | |
| pDCs中和 | BST2抗体 | Novus Biological | DDX0390P |
| 大鼠IgG | Novus Biological | 6-001-F | |
| pDCs分离 | 小鼠pDC分离试剂盒 | Miltenyi Biotec Inc. | 130-107-093 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Sangon | B610409 |
| RNA-seq | TruSeq RNA文库制备试剂盒v2 | Illumina | RS-122-2001 |
| NextSeq 500测序仪 | Illumina | -- | |
| HE染色 | HE染色试剂盒 | Sangon | E607318 |
| 纤维化染色 | 天狼星红染色试剂盒 | Shanghai Kang Lang Biological Technology Co., Ltd. | KL11004 |
| IHC抗体 | 纤连蛋白抗体 | Novus Biological | NBP1-91258 |
| α-平滑肌肌动蛋白抗体 | Abcam | ab5694 | |
| FOSL1抗体 | Invitrogen | PA5-76185 | |
| VDR抗体 | Bioss | bs-2987R | |
| IHC二抗 | 山羊抗兔IgG二抗,HRP | Invitrogen | 31460 |
| PMNC分离 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| HEPES缓冲液 | Gibco | 15630080 | |
| 胶原酶 | Merck KGaA | C5138 | |
| Percoll分离液 | -- | -- | |
| 流式检测 | 活/死细胞绿色染料试剂盒 | Invitrogen | L23101 |
| 流式抗体 | CD3抗体-CoraLite 594 | ProteinTech Group | CL594-65060 |
| B220抗体-APC | Invitrogen | 17-0452-82 | |
| pDCA-1抗体-FITC | Invitrogen | 11-3172-82 | |
| Siglec-H抗体-PE | Invitrogen | 12-0333-82 | |
| pDCs培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 24孔组织培养板 | Merck KGaA | Z707791 | |
| shRNA转染 | DOTAP脂质体转染试剂 | Merck KGaA | 11202375001 |
| ELISA | 小鼠IFN-α ELISA试剂盒 | Novus Biological | NBP3-42614 |
| 小鼠IL-33 ELISA试剂盒 | Vector Laboratories | LS-F26388-1 | |
| 小鼠IL-13 ELISA试剂盒 | Vector Laboratories | LS-F255-1 | |
| 氧化应激检测 | 过氧化氢荧光检测试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | E-BC-F001 |
| 小鼠谷胱甘肽ELISA试剂盒 | Sangon | D751008 | |
| 免疫荧光 | 山羊抗大鼠IgG,Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A-11006 |
| 山羊抗兔IgG,Alexa Fluor 647 | Invitrogen | A-21245 | |
| DAPI | -- | -- | |
| 细菌标记 | CFSE | Invitrogen | C1157 |
| 山羊抗大鼠IgG二抗,Alexa Fluor Plus 647 | Invitrogen | A48265TR | |
| 细菌结合实验 | 庆大霉素 | MedChemExpress | HY-K1050 |
| 溶酶体标记 | LysoTracker Red DND-99 | Invitrogen | L7528 |
| 封片 | ProLong Gold抗淬灭封片剂 | Invitrogen | P36930 |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解缓冲液 | Merck KGaA | 20-188 |
| Western blot | SuperSignal West Pico PLUS化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific Inc. | 34580 |
| RT-qPCR | RevertAid H Minus第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | K1652 |
| Takyon ROX SYBR 2X MasterMix dTTP blue | Eurogentec | UF-RSMT-B0701 | |
| 7900HT快速实时荧光定量PCR仪 | -- | -- | |
| 氧化应激检测 | 脂质氧化(MDA)检测试剂盒 | Beyotime | S0131S |
| 总SOD活性检测试剂盒 | Beyotime | S0101S | |
| ROS检测 | DCFH-DA荧光探针 | MedChemExpress | HY-D0940 |
| ChIP-qPCR | SimpleChIP酶法ChIP试剂盒 | Cell Signaling Technologies | 9003 |
| 双荧光素酶 | 无启动子萤火虫荧光素酶基本载体 | Promega Corporation | E6651 |
| pRL海肾荧光素酶对照报告载体 | Promega Corporation | E2231 | |
| 荧光素酶检测系统 | Promega Corporation | E1500 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| AIP小鼠模型诱导 | 小鼠品系(MRL/MpJ,雌性,6周龄,24-25g)、poly(I:C)腹腔注射剂量(10µg或100µg)及频率(每周两次,共8周) 阅读提示:Materials and Methods:Induction of Experimental AIP and Treatments |
| B. infantis灌胃 | B. infantis菌株(35624)、剂量(低、中、高:1×10⁷、1×10⁸、1×10⁹ CFU/mL)、体积(0.5mL)、频率(每周两次,共8周) 阅读提示:Materials and Methods:B. infantis culture and preparation;Induction of Experimental AIP and Treatments |
| pDCs中和 | BST2抗体剂量(100µg)、注射频率(每次poly(I:C)注射前) 阅读提示:Materials and Methods:Induction of Experimental AIP and Treatments |
| FOSL1/VDR敲低 | shRNA序列(sh-FOSL1:5’-TGGATGGTGCAGCCTCATTTC-3’;sh-VDR:5’-CGTAAGTACAGGGAGCTATTC-3’)、慢病毒滴度(2×10⁷ TU)、注射途径(尾静脉) 阅读提示:Materials and Methods:Induction of Experimental AIP and Treatments |
| 体外pDCs刺激 | B. infantis浓度(1×10⁷ CFU/mL)、pDCs密度(1×10⁶ cells/mL)、刺激时间(24小时) 阅读提示:Materials and Methods:B. infantis stimulation of pDCs |