外周血单细胞RNA测序揭示儿童ANCA相关性血管炎的中性粒细胞异质性

Single-Cell RNA-Sequencing of Peripheral Blood Reveals Neutrophil Heterogeneity in Childhood ANCA-Associated Vasculitis.

作者信息Shengsen Wei, Liwen Tan, Lin Tang, Hua-Ying Xiong, Qin Yang, Jia Jiao, Zilin Liu, Gaofu Zhang, Haiping Yang, Qiu Li, Aihua Zhang, Mo Wang
PMID41859390
发布时间2026-01-15
DOI10.2147/JIR.S545080

实验完整度

包含单细胞测序、体外HL-60细胞实验、大鼠EAV模型、临床样本分析及临床数据相关性多种独立证据层级,并有功能验证和机制验证。

主要模型

HL-60细胞系 WKY大鼠实验性自身免疫性血管炎(EAV)模型 儿童及成人AAV患者外周血样本 健康对照外周血样本

重点核对

单细胞测序样本:3例健康、12例AAV(6例MPO-ANCA阳性、3例PR3-ANCA阳性、3例治疗后)、3例治疗后样本 EAV模型:雌性WKY大鼠,MPO(1600 μg/kg)免疫,对照组为HSA HL-60分化:1.3% DMSO和0.5% FBS处理4天,再加10%血清(健康或AAV)孵育24小时 谷氨酰胺实验:含谷氨酰胺与不含谷氨酰胺的RPMI-1640培养基 流式检测CD10和CD11B表达

摘要

背景 机体对中性粒细胞抗原的不耐受驱动儿童抗中性粒细胞胞浆自身抗体相关性血管炎(AAV)的发病机制,使中性粒细胞成为该疾病潜在机制研究的核心焦点。 方法 我们对18例外周血样本(包括3例健康人样本、12例不同类型AAV患者样本和3例AAV治疗后患者样本)进行了单细胞RNA测序,以研究AAV中的中性粒细胞异质性。这些生物信息学发现随后通过综合实验方法进行了验证,包括体外细胞实验、体内动物研究、临床样本分析以及与患者临床数据的相关性分析。 结果 在AAV中,中性粒细胞被重新分类为七个不同的簇,中性粒细胞2(N2,CD10+CD11B++)显著扩增(P<0.01),而中性粒细胞5(N5,CD10−CD11B++)显示增加趋势(P>0.05)。这一现象已在实验性自身免疫性血管炎模型中得到证实(CD10+CD11B++,P<0.001;CD10−CD11B++,P<0.05)。生物信息学结果表明,CD10+CD11B++中性粒细胞和CD10−CD11B++中性粒细胞均表现出主要的促炎活性,包括中性粒细胞活化、活性氧产生、中性粒细胞胞外陷阱形成和脱颗粒。拟时间轨迹和RNA速率分析表明,CD10+CD11B++中性粒细胞直接从CD10−CD11B++中性粒细胞分化而来。使用HL-60细胞的实验表明,AAV的外周血微环境促进CD11B++中性粒细胞的产生(P<0.001)。功能相关的代谢分析显示,与对照组相比,AAV患者CD10+CD11B++中性粒细胞的谷氨酰胺代谢显著减少(P<0.001),治疗后恢复(P<0.001)。实验结果表明,增加HL-60细胞微环境中的谷氨酰胺浓度可减少CD11B++中性粒细胞的产生(P<0.001)。临床数据显示,患者治疗后外周血GGT浓度升高(P<0.01)。 结论 这些发现确定了两个新的致病性中性粒细胞亚群,并提示调节谷氨酰胺代谢是进一步研究儿童AAV潜在治疗策略的一个有前景的方向。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
儿童AAV中是否存在中性粒细胞异质性,以及谷氨酰胺代谢如何影响中性粒细胞亚群的分化和功能?
核心机制
AAV患者外周血微环境(如低谷氨酰胺)促进CD10−CD11B++未成熟中性粒细胞非经典分化成CD10+CD11B++成熟中性粒细胞,该过程涉及转录因子CEBPA和CEBPD的变化;谷氨酰胺代谢降低,导致促炎功能(ROS、NETs、脱颗粒)增强。
主要证据
单细胞测序鉴定出CD10+CD11B++和CD10−CD11B++亚群在AAV中扩增;EAV大鼠模型验证;HL-60细胞实验证明AAV血清和低谷氨酰胺促进CD11B++分化;临床血浆谷氨酰胺降低和GGT治疗后升高。
研究意义
研究提示阻断非经典中性粒细胞分化途径可能成为AAV的潜在治疗策略,增强中性粒细胞谷氨酰胺代谢可能逆转致病分化过程。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

单细胞转录组图谱构建

描绘AAV患者与健康对照外周血免疫细胞组成,并鉴定与AAV相关的中性粒细胞亚群。

收集18例外周血样本(3健康、12 AAV、3治疗后)进行scRNA-seq,质控后获得125350个细胞,基于标志基因注释细胞类型,并重新聚类中性粒细胞得到7个亚群。

2

致病性中性粒细胞亚群鉴定与功能分析

确定与AAV发病相关的中性粒细胞亚群及其功能特征。

分析不同中性粒细胞亚群比例,发现N2(CD10+CD11B++)显著增加,N5(CD10−CD11B++)有增加趋势;对亚群进行差异表达基因和GO/KEGG富集分析,并进行功能评分。

3

分化轨迹与转录因子分析

探索CD10−CD11B++向CD10+CD11B++分化的方向及关键转录因子。

使用Monocle2拟时间轨迹和RNA velocity分析分化方向;通过pySCENIC分析转录因子调控网络。

4

体外HL-60细胞验证实验

验证AAV外周血微环境对中性粒细胞分化的影响。

用DMSO诱导HL-60细胞向中性粒细胞分化,分别用健康儿童血清或AAV患儿血清刺激,检测CD11B++细胞比例。

5

动物模型验证

在体内验证AAV相关中性粒细胞亚群的扩增。

用MPO免疫WKY大鼠建立EAV模型,通过流式检测外周血中CD10+CD11B++和CD10−CD11B++中性粒细胞的比例。

6

代谢分析

揭示中性粒细胞亚群的代谢特征,特别是谷氨酰胺代谢的变化。

对中性粒细胞亚群进行代谢通路功能评分,比较CON、AAV和AAV-AT组间谷氨酰胺代谢得分差异。

7

谷氨酰胺代谢干预实验

验证增加谷氨酰胺代谢对致病性中性粒细胞分化的影响。

在含或不含谷氨酰胺的培养基中培养HL-60细胞,用AAV血清刺激,检测CD11B++细胞比例。

8

临床样本与临床数据验证

验证谷氨酰胺代谢和GGT水平与疾病状态的关系。

检测血浆谷氨酰胺浓度和GGT水平,比较治疗前后变化。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
红细胞裂解液Singleron--
GEXSCOPE®单细胞RNA文库构建试剂盒Singleron--
Illumina Novaseq 6000测序仪Illumina--
Countstar® Rigel自动荧光细胞计数仪Countstar--
RPMI-1640培养基GibcoC11875500BT
二甲基亚砜SolarbioD8371
胎牛血清Gibco10091148
无谷氨酰胺RPMI-1640培养基Gibco21870076
红细胞裂解液BD555899
纯化小鼠抗大鼠CD32抗体BD550270
CD45抗体BD561586
CD11B抗体BD566867
CD10抗体SantaCruzsc-46656PE
RP-1抗体BD566868
7-AADAbsinabs9104
CD11B抗体(561690)BD561690
百日咳毒素Sigma-AldrichP7208
人髓过氧化物酶(MPO)----
普鲁士蓝染色试剂盒Solarbio--
自动尿液生化分析仪(Cobas c701)Roche--
自动血液生化系统(Cobas 8000)Roche--
谷氨酰胺比色试剂盒ElabscienceE-BC-K853-M
γ-谷氨酰转移酶试剂Siemens Healthineers--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
单细胞测序
样本类型和数量(3健康、12 AAV、3治疗后);红细胞裂解和洗涤条件;建库试剂盒和测序平台;质控参数(基因数、UMI、线粒体含量)
阅读提示:Materials and Methods: Clinical Sample Collection and Single-Cell Preparation Procedures, RT & Amplification & Library Construction, Primary Analysis of Raw Read Data; Figure 1
流式细胞术
采血量和抗凝;裂解时间和温度;抗体浓度和孵育时间;7-AAD活细胞百分比阈值
阅读提示:Materials and Methods: Flow Cytometry
HL-60细胞分化实验
DMSO浓度(1.3%)、FBS浓度(0.5%)、分化时间(4天)、血清刺激浓度(10%)和时长(24小时)
阅读提示:Materials and Methods: Cell Culture
动物模型
大鼠品系、性别、周龄(雌性WKY,4周);MPO剂量(1600 μg/kg)、免疫途径(肌注和皮下)、佐剂(完全弗氏佐剂);百日咳毒素剂量(1 μg/只)和时间(第0和2天);处死时间(第8周)
阅读提示:Materials and Methods: Rat and Experimental Autoimmune Vasculitis (EAV) Model
代谢干预实验
谷氨酰胺有无的培养基;刺激血清类型(儿童AAV血清,浓度10%);处理时间
阅读提示:Materials and Methods: Cell Culture(谷氨酰胺实验)
临床生化检测
检测试剂盒;样本类型(血浆/血清);检测指标(谷氨酰胺、GGT)
阅读提示:Materials and Methods: Glutamine Concentration Test, Gamma-Glutamyl Transpeptidase Test