SCE提取与成分分析
制备菝葜乙醇提取物并鉴定其主要化学成分
采用60%乙醇回流提取菝葜根茎,利用UPLC-Q-TOF-MS分析化学成分,鉴定出多种黄酮、皂苷、多酚等化合物。
Smilax china L. Extract Alleviates Metabolic-Associated Fatty Liver Disease by Regulating Gut Microbiota and Bile Acid Metabolism.
包含高脂饮食诱导大鼠模型、16S rDNA测序、非靶向和靶向代谢组学、Western blot、RT-PCR等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
高脂饮食诱导的SD大鼠MAFLD模型
动物模型:雄性SD大鼠,180-200g,高脂饮食(含10%猪油、5%蛋黄粉、5%蔗糖、1%胆固醇、0.5%胆酸钠)诱导6周 分组与给药:HFD组、阿托伐他汀组(10 mg/kg)、SCE低中高剂量组(8.1、16.2、32.4 g/kg,灌胃),治疗6周 16S rDNA测序:选择对照组、HFD组和SCE-H组粪便样本,采用E.Z.N.A. DNA试剂盒提取,Qubit定量,Majorbio云平台分析,LEfSe LDA>4 代谢组学:非靶向(LC-MS/MS)和靶向胆汁酸代谢组学,样本为粪便,关键参数如VIP>1, p<0.05 分子检测:Western blot和RT-PCR检测肝脏FXR、PPARα、CYP7A1、CYP7B1、CYP8B1、CYP27A1表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
制备菝葜乙醇提取物并鉴定其主要化学成分
采用60%乙醇回流提取菝葜根茎,利用UPLC-Q-TOF-MS分析化学成分,鉴定出多种黄酮、皂苷、多酚等化合物。
建立高脂饮食诱导的MAFLD大鼠模型,并评估SCE的治疗效果
雄性SD大鼠高脂饮食6周诱导MAFLD,随后分为对照组、HFD组、阿托伐他汀组和SCE低中高剂量组,灌胃给药6周,检测体重、肝脏组织病理、血清和肝脏生化指标。
评估肝脏脂肪变性和炎症程度
肝脏组织固定、包埋、切片,进行HE和油红O染色,计算MAFLD活动度评分(MAS)。
评估SCE对血脂、肝功能、氧化应激和炎症水平的影响
使用生化试剂盒和ELISA试剂盒检测血清和肝脏中的TC、TG、LDL-C、HDL-C、ALT、AST、SOD、MDA、GSH-Px以及TNF-α、IL-6、IL-18、LPS水平。
比较对照组、HFD组和SCE-H组的肠道菌群组成和多样性
提取粪便DNA,扩增16S rRNA基因,进行高通量测序,分析Alpha多样性、Beta多样性以及差异菌群。
鉴定SCE对粪便代谢物的影响及涉及的代谢通路
粪便样本经溶剂提取,LC-MS/MS检测,进行PCA、OPLS-DA分析,筛选差异代谢物,进行KEGG通路富集分析。
定量分析粪便中胆汁酸谱的变化
采用UPLC-MS/MS靶向定量47种胆汁酸,比较各组粪便胆汁酸水平。
验证SCE对肝脏胆汁酸合成和脂质代谢相关蛋白和基因表达的影响
采用Western blot和RT-PCR检测肝脏中FXR、PPARα、CYP7A1、CYP7B1、CYP8B1、CYP27A1的蛋白和mRNA表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 阿托伐他汀 | Pfizer Pharma Ltd. | -- |
| 生化分析 | LDL-C、HDL-C、AST、ALT ELISA试剂盒 | Shanghai Fusheng Industrial Co., Ltd. | -- |
| 脂多糖 | Bioswamp Industrial Co., Ltd. | -- | |
| TNF-α、IL-6、IL-18试剂盒 | Elabscience Industrial Co., Ltd. | -- | |
| TC、TG、GSH-Px、SOD、MDA试剂盒 | Elascience Industrial Co., Ltd. | -- | |
| Western blot | FXR抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-25309 |
| CYP7A1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-518007 | |
| Lamin B1抗体 | Affinity Biosciences | AF5161 | |
| CYP7B1抗体 | Proteintech | 24889-1-AP | |
| PPARα抗体 | Proteintech | 66826-1-Ig | |
| CYP27A1抗体 | Proteintech | 14739-1-AP | |
| CYP8B1抗体 | ABclonal Biotechnology | A25847 | |
| 化学分析 | 超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱 | Waters | -- |
| ACQUITY UPLC HSS T3色谱柱 | Waters | -- | |
| 16S rDNA测序 | E.Z.N.A.® DNA试剂盒 | Omega Bio-tek | -- |
| AMPure® PB磁珠 | Beckman Coulter | -- | |
| Qubit 4.0荧光定量系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 代谢组学 | Wonbio-96c均质器 | Wonbio Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| Thermo UHPLC-Q Exactive HF-X质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 靶向胆汁酸代谢组学 | ExionLC AD系统 | SCIEX | -- |
| Waters BEH C18色谱柱(150×2.1 mm,1.7 μm) | Waters | -- | |
| AB SCIEX QTRAP 6500+质谱仪 | SCIEX | -- | |
| RT-PCR | Spin Column动物总RNA纯化试剂盒 | Songon Biotech | -- |
| RevertAid cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| StepOnePlus实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Elabscience | -- |
| NE-PER核浆蛋白提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 78833 | |
| ECL化学发光试剂 | Biopmk | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 雄性SD大鼠,180-200 g,高脂饲料成分(10%猪油、5%蛋黄粉、5%蔗糖、1%胆固醇、0.5%胆酸钠),喂养6周 阅读提示:见Methods 2.4 |
| SCE制备与给药 | 菝葜乙醇提取物制备方法(15 kg药材,150 L 60%乙醇,回流提取2次,每次2小时),给药剂量(8.1、16.2、32.4 g/kg对应低中高剂量),灌胃给药,治疗6周 阅读提示:见Methods 2.2和2.4 |
| 生化指标检测 | ELISA试剂盒检测血清LDL-C、HDL-C、AST、ALT、LPS、TNF-α、IL-6、IL-18;生化试剂盒检测血清/肝脏TC、TG、GSH-Px、SOD、MDA 阅读提示:见Methods 2.1和2.6 |
| 肠道菌群测序 | 16S rDNA测序样本选择(对照组、HFD组、SCE-H组),DNA提取方法,PCR引物,测序平台,LEfSe分析阈值(LDA>4) 阅读提示:见Methods 2.7 |
| 代谢组学分析 | 非靶向代谢组学样本制备(50 mg粪便,提取溶剂比例,内标浓度),LC-MS/MS条件,数据处理参数(VIP>1, p<0.05),靶向胆汁酸代谢组学样本制备(25 mg粪便)与检测条件 阅读提示:见Methods 2.8和2.9 |
| 分子表达检测 | Western blot抗体稀释比例(如FXR 1:1000),RNA提取和RT-PCR条件,内参基因(GAPDH),样本量(n=3) 阅读提示:见Methods 2.10和2.11 |