比较EB和iTF微胶质细胞的基本特征
验证两种方案产生的iMGL是否具有小胶质细胞特征,并评估其脂滴负荷差异。
通过免疫细胞化学检测IBA1表达,qRT-PCR检测标志基因(CSF1R、CX3CR1、P2RY12、LYVE1、TMEM119等),并使用PLIN2免疫染色和Western blot评估脂滴负荷。
Comparative lipidomics of iPSC-derived microglia protocols reveal lipid droplet and immune differences mediated by media composition.
包含脂质组学、Western blot、流式细胞术、免疫细胞化学等多层级实验,并进行了培养基补充剂替换和机制验证。
EB微胶质细胞(WTC11和KOLF2.1J) iTF微胶质细胞(WTC11和KOLF2.1J)
iMGL分化方案(EB vs iTF) 培养基成分(B-27补充剂、L-肉碱) 脂质组学检测(TG、DG、FA等脂类) 小胶质细胞状态标记物(P2RY12、LGALS3等) LPS刺激反应
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证两种方案产生的iMGL是否具有小胶质细胞特征,并评估其脂滴负荷差异。
通过免疫细胞化学检测IBA1表达,qRT-PCR检测标志基因(CSF1R、CX3CR1、P2RY12、LYVE1、TMEM119等),并使用PLIN2免疫染色和Western blot评估脂滴负荷。
系统比较两种iMGL的脂质组成,确定差异脂类。
对EB和iTF微胶质细胞进行定量脂质组学分析,检测1009种脂质,涵盖16个脂类。
确定iTF微胶质细胞中甘油三酯升高是由诱导方法还是培养基成分导致。
将EB微胶质细胞在iTF培养基中成熟(EB-iTF),进行脂质组学分析,并检测PLIN2表达。
测试培养基中不同成分(如B-27)对甘油三酯水平的影响。
在EB培养基中移除B-27或在iTF培养基中添加B-27,检测脂质组和PLIN2表达。
确定B-27补充是否改变iTF微胶质细胞的免疫表型。
使用流式细胞术检测炎症和稳态标记物(CCL13、SPP1、CD9、LGALS3、CXCL10、IFIT1、P2RY12),并用LPS刺激检测脂滴反应。
测试B-27中的L-肉碱是否能模拟B-27的效果。
在iTF培养基中添加L-肉碱,进行脂质组学分析和免疫状态标记物检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Essential 8 培养基 | Gibco | A1517001 |
| Geltrex 基质胶 | Fisher Scientific | A1413302 | |
| StemPro Accutase 细胞解离试剂 | Gibco | A1110501 | |
| Advanced DMEM/F-12 培养基 | Gibco | 12634028 | |
| B-27 补充剂 | Gibco | 17504044 | |
| 左旋肉碱盐酸盐 | Sigma-Aldrich | C0283 | |
| 多西环素 | Sigma-Aldrich | D9891 | |
| 重组人IL-34 | Peprotech | 200-34 | |
| 重组人M-CSF | Peprotech | 300-25 | |
| 重组人GM-CSF | Peprotech | 300-03 | |
| 重组人TGFβ1 | Peprotech | 100-21C | |
| 重组人SCF | Peprotech | 300-07 | |
| 重组人BMP4 | Peprotech | AF-120-05ET | |
| 重组人VEGF | Peprotech | 100-20 | |
| X-VIVO 15 无血清造血细胞培养基 | Lonza | 02-060Q | |
| Neurobasal 培养基 | Gibco | 21103049 | |
| Albumax II 富脂牛血清白蛋白 | Gibco | 11021029 | |
| KnockOut 血清替代物 | Gibco | 10828028 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | D2438 | |
| 脂质组学 | ISOLATE II RNA 微量提取试剂盒 | Meridian Bioscience | BIO-52073 |
| Pierce TCEP-HCl | Thermo Scientific | 20491 | |
| 基因表达分析 | SensiFast cDNA 合成试剂盒 | Meridian Bioscience | BIO-65054 |
| SensiFast SYBR Lo-ROX 试剂盒 | Meridian Bioscience | BIO-94020 | |
| QuantStudio 5 实时荧光定量PCR仪 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 免疫细胞化学 | Triton X-100 | Fisher Chemical | 10254640 |
| 正常山羊血清 | Gibco | 11540526 | |
| 牛血清白蛋白 | Roche | 10735086001 | |
| 抗perilipin 2抗体 | Proteintech | 15294-1-AP | |
| 抗Iba1抗体 | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation | 019-19741 | |
| DAPI | Carl Roth | 6843.1 | |
| 鬼笔环肽iFluor 647试剂 | Abcam | ab176759 | |
| CellInsight CX7 LED Pro 高内涵筛选平台 | Fisher Scientific | -- | |
| Nikon Ti-Eclipse 显微镜 | Nikon | -- | |
| Western blot | Criterion TGX Stain-free 凝胶 | BIO-RAD | 5678085 |
| Trans-Blot Turbo RTA Midi 0.45 μm LF PVDF 转印试剂盒 | BIO-RAD | 1704275 | |
| Trans-blot Turbo 转印系统 | BIO-RAD | 1704150 | |
| GAPDH抗体 | elabscience | E-AB40337 | |
| ACTIN抗体 | Sigma-Aldrich | MAB1501 | |
| 多克隆HRP二抗 | Agilent | P044801 | |
| IRDye 800CW | LI-COR | 926-32210 | |
| IRDye 680RD | LI-COR | 926-68071 | |
| LI-COR Odyssey Fc 成像系统 | LI-COR | -- | |
| 流式细胞术 | TrypLE Express 酶 | Gibco | 12605-028 |
| CD9抗体 | BioLegend | 312104 | |
| P2RY12抗体 | BioLegend | 392108 | |
| LGALS3抗体 | BioLegend | 125410 | |
| Fc受体阻断剂 | BioLegend | 422302 | |
| eBioscience 细胞内固定和透化缓冲液套装 | Invitrogen | 88-8824-00 | |
| IFIT1抗体 | Cell Signaling | 20329S | |
| CXCL10抗体 | BioLegend | 519504 | |
| SPP1抗体 | eBioscience | 50-9096-42 | |
| CCL13抗体 | R&D systems | IC327G | |
| BD LSR Fortessa X14 流式细胞仪 | BD | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| iMGL分化 | 分化方案(EB或iTF)、细胞系(WTC11或KOLF2.1J)、培养基成分(B-27、L-肉碱) 阅读提示:Methods中“Human induced pluripotent stem cell-derived microglia culture and differentiation”部分 |
| 脂质组学分析 | 细胞数量(0.5-1.5百万)、样本制备方法、脂质提取和检测平台 阅读提示:Methods中“Lipidomic analysis”部分 |
| 免疫表型检测 | 抗体浓度、流式细胞仪设置、门控策略 阅读提示:Methods中“Flow cytometry”部分 |
| LPS刺激实验 | LPS浓度(文中未明确说明)、处理时间(24小时)、培养基条件(-B-27或+B-27) 阅读提示:Methods中“Human induced pluripotent stem cell-derived microglia culture and differentiation (induced transcription factor protocol)”部分 |