确定最佳共培养条件
建立RA-FLS与RA-PBMC共培养模型,模拟RA滑膜微环境,并优化共培养比例和时间。
将RA-FLS与RA-PBMC以不同比例(1:10、1:6、1:3、1:1)共培养不同时间(12、24、48小时),通过CCK-8检测细胞活力,并检测炎症因子IL-17和IL-1β水平。
Mechanistic study of miR‑369‑3p in regulating the Wnt/β‑catenin signaling pathway via targeting SPTBN1 in inflammatory response and bone destruction of rheumatoid arthritis.
包含体外细胞模型(RA-FLS与PBMC共培养)、功能验证(CCK-8、EdU、划痕、流式)和机制验证(双荧光素酶、RT-qPCR、Western blot、ELISA),但缺乏动物模型和临床样本验证。
RA-FLS与RA-PBMC共培养模型 293T细胞
RA-FLS与RA-PBMC共培养比例1:3,共培养时间48小时 miR-369-3p mimic、inhibitor及各自NC的转染浓度和转染时间 各组细胞功能指标(活力、周期、增殖、迁移)的检测方法 miR-369-3p靶向SPTBN1的双荧光素酶报告实验 炎症因子和骨代谢标志物的ELISA检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立RA-FLS与RA-PBMC共培养模型,模拟RA滑膜微环境,并优化共培养比例和时间。
将RA-FLS与RA-PBMC以不同比例(1:10、1:6、1:3、1:1)共培养不同时间(12、24、48小时),通过CCK-8检测细胞活力,并检测炎症因子IL-17和IL-1β水平。
验证miR-369-3p与SPTBN1的直接结合。
合成SPTBN1野生型(WT)和突变型(Mut)序列,克隆至双荧光素酶报告载体,在293T细胞中共转染miR-369-3p mimics或NC,检测荧光素酶活性。
在RA-FLS中过表达或抑制miR-369-3p,以研究其功能。
将miR-369-3p mimics、inhibitor及其阴性对照转染至RA-FLS,并与RA-PBMC共培养,设置对照组(健康PBMC)和模型组(RA-PBMC)。
评估miR-369-3p对RA-FLS活力、细胞周期、增殖和迁移的影响。
使用CCK-8检测细胞活力,流式细胞术检测细胞周期,EdU染色检测增殖,划痕实验检测迁移。
验证miR-369-3p是否调控SPTBN1、Wnt和β-catenin的表达。
通过RT-qPCR和Western blot检测各组细胞中SPTBN1、Wnt和β-catenin的mRNA和蛋白表达水平。
检测miR-369-3p对炎症因子、基质金属蛋白酶和骨代谢标志物的调节作用。
通过ELISA检测细胞培养上清中MMP-1、MMP-3、IL-17、IL-1β、IL-4、IL-10、OPG、DKK1、RANK和RANKL的水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | -- | -- | |
| 细胞共培养 | Transwell小室 | BIOFIL | TCS-001-006 |
| 细胞转染 | miR-369-3p模拟物 | General Biosystems | 20 µM |
| miR-369-3p抑制剂 | General Biosystems | 20 µM | |
| Lipo8000转染试剂 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- | |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo 8检测试剂盒 | Promega Corporation | BL1055B |
| 酶标仪 | Rayto Life and Analytical Sciences Co., Ltd. | RT6100 | |
| RT-qPCR | 总RNA提取试剂 | ShareBio | SB-MR009 |
| SYBR Green qPCR预混液 | iScience | EG20117M | |
| 引物 | Sangon Biotech Co., Ltd. | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Biosharp Life Sciences | BL504A |
| BCA蛋白定量试剂盒 | -- | -- | |
| PVDF膜 | MilliporeSigma | IPVH00010 | |
| β-actin抗体 | Zs-BIO | TA-09 | |
| SPTBN1抗体 | HUABIO | HA500014 | |
| Wnt5抗体 | Proteintech | 55184-1-AP | |
| β-catenin抗体 | Affinity | AF6266 | |
| HRP标记的二抗 | Zs-BIO | ZB-2301 | |
| 增强化学发光试剂 | GLPBIO | GK10008 | |
| 双荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶报告检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | RG027 |
| Lipofectamine 8000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 流式细胞术检测细胞周期 | 细胞周期检测试剂盒 | -- | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 流式细胞仪 | Agilent Technologies, Inc. | NovoCyte | |
| EdU增殖检测 | EdU标记培养基 | Elabscience Bionovation Inc. | E-CK-A376 |
| DAPI | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Biosharp | BS114 | |
| 倒置荧光显微镜 | OLYMPUS | CKX53 | |
| 划痕实验 | 倒置光学显微镜 | Olympus Corporation | CKX53 |
| 统计分析 | SPSS统计软件 | IBM Corp. | 26.0 |
| GraphPad Prism软件 | Dotmatics | 10.1.2 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞共培养 | RA-FLS与RA-PBMC共培养比例和时间(最佳1:3,48小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell co-cultivation; Figure 2 |
| 细胞转染 | miR-369-3p mimics、inhibitor及NC的浓度(20 µM)和转染时间(48小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell transfection |
| 细胞功能检测 | CCK-8检测的细胞密度、重复数;EdU标记浓度和时间;划痕实验的细胞密度和观察时间 阅读提示:Materials and methods: CCK-8 assay, EdU staining, Scratch wound healing assay |
| 分子机制验证 | 双荧光素酶报告基因实验的转染分组和检测方法;RT-qPCR的内参基因和引物序列;Western blot的一抗浓度和蛋白上样量 阅读提示:Materials and methods: Assay of dual-luciferase reporter genes, RT-qPCR, Western blot analysis |
| 炎症和骨破坏标志物检测 | ELISA检测的指标(MMP-1, MMP-3, IL-17, IL-1β, IL-4, IL-10, OPG, DKK1, RANK, RANKL)和重复数 阅读提示:Materials and methods: ELISA; Figure 6, 7 |