细胞大小与干性关联分析
探究白血病细胞大小是否与其干性相关
通过Wright-Giemsa染色观察细胞大小差异,利用FACS分选小细胞和大细胞,并进行集落形成实验、体内移植实验和化疗敏感性实验。
Targeting leukemic stem cell biomechanics suppresses stemness and enhances NK cell-mediated immunotherapy.
研究包含体外细胞实验、体内异种移植模型、患者样本、单细胞RNA测序、功能验证及机制验证,证据层级独立且丰富。
KG-1a白血病细胞系 U937白血病细胞系 原代AML骨髓Lin-细胞 M-NSG小鼠异种移植模型
LSC亚群鉴定:FSClow ALDH1A1+细胞的分离和功能验证 细胞力学测量:原子力显微镜(AFM)和微流控分离条件 ALDH1A1抑制处理:Disulfiram浓度(1μM)和处理时间(48小时) NK细胞杀伤实验:效靶比(5:1)、共培养时间(6小时) 体内联合治疗:Disulfiram给药方案(15 mg/kg,腹腔注射,连续5天)和NK细胞回输(5×10^6个细胞/只)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究白血病细胞大小是否与其干性相关
通过Wright-Giemsa染色观察细胞大小差异,利用FACS分选小细胞和大细胞,并进行集落形成实验、体内移植实验和化疗敏感性实验。
检测小细胞和大细胞的F-actin水平和皮层硬度,探讨细胞骨架对干性的影响
使用共聚焦显微镜和原子力显微镜(AFM)测量F-actin水平和皮层硬度,并通过Jas和Lat A处理调节肌动蛋白聚合,检测细胞功能变化。
利用微流控芯片基于细胞力学特性分离软小细胞和硬大细胞,验证其干性差异
设计和制备微流控芯片,从原代AML骨髓Lin-细胞和U937细胞中分离SSLCs和SLLCs,并进行功能验证。
通过单细胞转录组分析鉴定LSC富集的亚群
对FACS分选的小(FSClow)和大(FSChigh)AML BM Lin-细胞进行scRNA-seq,分析细胞亚群、LSC评分和差异表达基因。
验证FSClow ALDH1A1+亚群是否具有长期干性
通过FACS分选FSClow ALDH1A1+细胞,进行体外集落形成、体内连续移植实验,并检测F-actin和刚度。
验证抑制ALDH1A1是否能改变LSC的力学特性和干性
使用ALDH1抑制剂Disulfiram处理FSClow ALDH1A1+细胞,或通过shRNA敲低ALDH1A1,检测F-actin、刚度、集落形成和体内致白血病能力。
验证ALDH1A1抑制增强的细胞硬度是否能增强NK细胞介导的杀伤作用
将处理后的白血病细胞与NK细胞共培养,检测免疫突触形成、穿孔素极化、细胞毒性,并在PDX模型中评估联合治疗效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | IMDM培养基 | Biosharp | BL312A |
| RPMI 1640培养基 | Biosharp | BL303A | |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | F7524 | |
| 青霉素链霉素两性霉素B | Biosharp | BL142A | |
| 染色 | 瑞氏-吉姆萨染色液 | Biosharp | BL800A |
| 细胞分选 | Ficoll分离液 | TBDScience | LTS1077 |
| 谱系细胞去除试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-092-211 | |
| CD34磁珠分选试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-046-702 | |
| 流式分析 | ALDEFLUOR试剂盒 | STEMCELL Technologies | 01700 |
| 细胞培养 | StemSpan SFEM培养基 | STEMCELL Technologies | 09600 |
| 重组人Flt3配体 | Novoprotein | CA82 | |
| 重组人促血小板生成素 | Novoprotein | CJ95 | |
| 重组人干细胞因子 | Novoprotein | C034 | |
| 流式分析 | SiR-肌动蛋白试剂 | Cytoskeleton, Inc. | CY-SC001 |
| Hoechst 33342 | Beyotime | C1022 | |
| 派洛宁Y | Polysciences, Inc. | 18614-5 | |
| 抗人CD45-FITC抗体 | Biolegend | 304038 | |
| 抗人CD45-BV510抗体 | Biolegend | 304036 | |
| 抗人CD45-APC/Cy7抗体 | Biolegend | 304014 | |
| 抗人CD3-PE/Cy7抗体 | Biolegend | 300420 | |
| 抗人CD3-APC/Cy7抗体 | Biolegend | 344818 | |
| 抗人CD3-PerCP/Cy5.5抗体 | Biolegend | 317336 | |
| 抗人CD19-FITC抗体 | Biolegend | 302206 | |
| 抗人CD19-APC/Cy7抗体 | Biolegend | 302218 | |
| 细胞分选 | ALDH1A1抗体 | Cell Signaling Technology | 36671 |
| 流式分析 | Alexa Fluor 488标记二抗 | Biolegend | 406416 |
| CD11b-FITC抗体 | Biolegend | 101206 | |
| CD14-PE抗体 | Biolegend | 325606 | |
| 集落形成实验 | MethoCult H4434培养基 | STEMCELL Technologies | H4434 |
| 小动物成像 | D-荧光素底物 | YEASEN | 40902ES03 |
| 免疫荧光 | 肌动蛋白示踪剂红色-555 | Beyotime | C2203S |
| 肌动蛋白示踪剂绿色-488 | Beyotime | C2201S | |
| DAPI | Biosharp | BL105A | |
| 原子力显微镜测量 | 层粘连蛋白 | Nuwacell | RP01025 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596018 |
| RT-qPCR | HiScript III反转录预混液 | Vazyme | R323-01 |
| ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q711-02 | |
| 免疫印迹 | 细胞裂解液 | Beyotime | P0013F |
| 4-12% SDS-PAGE凝胶 | Epizyme | LK307 | |
| NK细胞分离 | NK细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-092-657 |
| NK细胞培养 | 重组人白细胞介素-12 | PeproTech | 210-12 |
| 重组人白细胞介素-15 | PeproTech | 210-15 | |
| 免疫突触实验 | 抗穿孔素-FITC抗体 | Biolegend | 353310 |
| Alexa Fluor 488偶联抗鼠二抗 | Biolegend | 4408 | |
| NK细胞功能实验 | CellTrace Violet细胞增殖试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | C34557 |
| Annexin V/PI凋亡检测试剂 | Elabscience | E-CK-A217 | |
| 抗人CD56-BV421抗体 | BD | 562751 | |
| 抗CD107a-PE抗体 | Biolegend | 328608 | |
| 抗IFN-γ抗体 | Biolegend | 506528 | |
| 抗TNF-α抗体 | Biolegend | 502912 | |
| 抗颗粒酶B抗体 | Biolegend | 372222 | |
| NK细胞增殖实验 | CCK-8试剂盒 | MCE | HY-K0301 |
| 活细胞成像 | 多聚赖氨酸 | Beyotime | ST508 |
| 质粒转染 | 聚乙烯亚胺 | Polysciences | 23966 |
| 病毒转导 | 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | H9268 |
| 细胞处理 | 双硫仑 | -- | -- |
| Jasplakinolide | -- | -- | |
| Latrunculin A | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞分选 | 小细胞和大细胞分选的FSC-A和SSC-A门控(底部和顶部10-15%),ALDH1A1+细胞的分选策略 阅读提示:Methods:Cell sorting and flow cytometry analysis |
| 药物处理 | Jasplakinolide和Latrunculin A的使用浓度(1μM)和处理时间(6小时) 阅读提示:Methods:Cell sorting and flow cytometry analysis及图2图注 |
| 原子力显微镜测量 | AFM探针的弹性常数(0.06 N/m)、最大力(0.7 nN)和压入深度(<500 nm) 阅读提示:Methods:Measurement of cell cortical stiffness by AFM |
| 体内移植模型 | M-NSG小鼠的周龄和性别(6-8周龄雌性)、亚致死辐照剂量(250 cGy)、移植细胞数和时间 阅读提示:Methods:Xenotransplantation of human AML |
| NK细胞杀伤实验 | NK细胞效靶比(5:1)、共培养时间(6小时)、靶细胞处理(1μM Disulfiram 48小时) 阅读提示:Methods:NK cell functional assays |
| 体内联合治疗 | Disulfiram给药剂量(15 mg/kg,腹腔注射)、给药方案(每天一次,连续5天)、NK细胞输注剂量(5×10^6个细胞/只)、rhIL-15支持剂量(1 μg/只,每3天一次) 阅读提示:Methods:Treatment regimens for AML xenografts |