网络药理学靶点筛选
预测木犀草素治疗Ph+ALL的潜在靶点和通路
从多个数据库收集木犀草素和Ph+ALL相关靶点,取交集,构建PPI网络,进行GO和KEGG富集分析,筛选核心靶点和关键通路(PI3K/AKT)。
Luteolin induces apoptosis in Philadelphia chromosome-positive acute lymphoblastic leukemia cell by regulating the PI3K/AKT signaling pathway.
包含网络药理学分析、细胞活力、凋亡、ROS、MMP、ATP检测及Western blot机制验证,但仅使用单一细胞系,缺乏动物和临床样本验证。
SUP-B15细胞系(Ph+ALL细胞系) HK-2细胞系(人工常肾小管上皮细胞,毒性对照)
SUP-B15细胞系,BCR-ABL p190亚型 木犀草素浓度梯度:0-100μM 处理时间:24h, 48h, 72h(活力);24h(凋亡、ROS、MMP、ATP) 蛋白表达验证:p-PI3K, p-AKT, p-STAT3, BCL-2, BAX, cleaved caspase-3, cleaved caspase-9 ROS抑制剂NAC预处理(2mM,1h)和PI3K抑制剂HY-144806的作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
预测木犀草素治疗Ph+ALL的潜在靶点和通路
从多个数据库收集木犀草素和Ph+ALL相关靶点,取交集,构建PPI网络,进行GO和KEGG富集分析,筛选核心靶点和关键通路(PI3K/AKT)。
评估木犀草素对SUP-B15细胞增殖的影响及正常细胞毒性
用不同浓度木犀草素(0-100μM)和伊马替尼处理SUP-B15细胞,CCK-8法检测活力,计算IC50;同时检测HK-2细胞活力。
验证木犀草素是否诱导SUP-B15细胞凋亡
用Annexin V-APC/PI双染后流式细胞术检测凋亡率,比较单药和联合用药的效果。
探究木犀草素对线粒体功能的影响,包括ROS、MMP和ATP
使用DCFH-DA探针检测ROS,JC-1染色检测MMP,并使用ATP检测试剂盒定量ATP水平。
验证木犀草素对PI3K/AKT和JAK/STAT通路及凋亡相关蛋白表达的影响
通过Western blot和RT-qPCR检测通路蛋白和mRNA表达。
确证ROS和PI3K/AKT通路在木犀草素诱导凋亡中的作用
使用ROS抑制剂NAC和PI3K抑制剂HY-144806预处理细胞,检测凋亡、MMP、ROS和蛋白表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 木犀草素 | MedChemExpress | 491-70-3 |
| 伊马替尼 | MedChemExpress | 152459-95-5 | |
| 细胞培养 | IMDM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | TargetMol | C0005 |
| SpectraMax M5多功能酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-APC/PI凋亡检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A217 |
| BD FACS Lyric流式细胞仪 | BD | -- | |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | S0026 |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Servicebio | G1706 |
| DCFH-DA | -- | -- | |
| Leica DMI3000荧光显微镜 | Leica | -- | |
| MMP检测 | 增强型线粒体膜电位检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C2003S |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Sangon Biotech | B610409 |
| 紫外分光光度计(Nanodrop 2000) | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 反转录系统 | ABclonal | RK20429 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂 | APE×BIO | K1007 | |
| 磷酸酶抑制剂 | APE×BIO | K1015 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Epizyne Biotech | ZJ102 | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| 快速封闭液 | Meilunbio | MA0406 | |
| 全自动化学发光成像平台(Tanon-5200) | Tanon | -- | |
| GAPDH抗体 | Abmart | P60037F | |
| Bcl-2抗体 | Abmart | T40056F | |
| Bax抗体 | Abmart | T40051 | |
| Cytochrome C抗体 | Abmart | T55734 | |
| STAT3抗体 | Abmart | T56566 | |
| p-STAT3抗体 | Abmart | T55016 | |
| PI3K抗体 | Abcolnal | RC6350 | |
| p-PI3K抗体 | Abcolnal | AP0427 | |
| AKT抗体 | Abcolnal | A22770 | |
| p-AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060T | |
| Cleaved caspase-3抗体 | Selleck | F0135 | |
| Cleaved caspase-9抗体 | Selleck | F0326 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | SUP-B15细胞系来源、培养基IMDM、20%FBS、1%青霉素-链霉素、37°C、5%CO2 阅读提示:Materials and methods 2.7 Cell culture |
| 药物处理 | 木犀草素浓度(0-100μM)、伊马替尼浓度(0-40μM)、处理时间(24-72h) 阅读提示:Results 3.4 和 Materials and methods 2.8 Cell viability assay |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒(TargetMol, C0005)、接种密度5×10^4细胞/孔、处理时间24/48/72h、每组5个重复,检测波长450nm 阅读提示:Materials and methods 2.8 Cell viability assay |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-APC/PI试剂盒(Elabscience, E-CK-A217)、处理浓度(30,50μM木犀草素;30μM伊马替尼)、处理时间24h、流式细胞仪BD FACS Lyric 阅读提示:Materials and methods 2.9 Cell apoptosis |
| 线粒体功能检测 | ROS检测试剂盒(Servicebio, G1706)、DCFH-DA浓度20μM、MMP试剂盒(Beyotime, C2003S)、ATP试剂盒(Beyotime, S0026)、处理浓度(0,30,50,100μM)、处理时间24h 阅读提示:Materials and methods 2.10, 2.11, 2.12 |
| 分子表达检测 | Western blot抗体:p-PI3K, p-AKT, p-STAT3, BCL-2, BAX, cleaved caspase-3/9;处理浓度(0,30,50,100μM)处理48h;RT-qPCR处理24h 阅读提示:Materials and methods 2.13 RT-qPCR 和 2.14 Western blot |
| 机制干预 | NAC预处理2mM 1h,PI3K抑制剂HY-144806浓度未明确 阅读提示:Results 3.8 和 3.10 |