动物模型建立与DNase I处理
评估DNase I对MRL/lpr小鼠狼疮样症状和肾病理损伤的影响
使用6-8周龄雌性MRL/lpr小鼠,从17周龄开始每日腹腔注射DNase I(11284932001,Roche)至21周龄处死;对照组为C57BL/6J小鼠。收集血清、尿液、肾组织,进行生化检测和组织学检查。
DNase I alleviates renal inflammatory injury in MRL/lpr mice by inhibiting NETs formation.
研究包括动物模型(MRL/lpr小鼠)、体外细胞模型(PMA诱导中性粒细胞)、患者样本(外周血中性粒细胞)以及RNA-seq、流式细胞术等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
MRL/lpr小鼠狼疮性肾炎模型 PMA诱导的中性粒细胞体外模型 狼疮性肾炎患者外周血中性粒细胞
DNase I处理剂量和时间:每日腹腔注射,从17周龄开始至21周龄处死(DNase I,11284932001,Roche) 体外PMA处理浓度:25 ng/mL 体外DNase I处理浓度:1 mg/mL 动物分组:MRL/lpr小鼠模型组(15、17、19、21周龄),DNase I治疗组,C57BL/6J对照组(15、17、19、21周龄) 样本量:每组5只(病理、免疫荧光、免疫组化、Western blot等),每组3只(流式、qRT-PCR等)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估DNase I对MRL/lpr小鼠狼疮样症状和肾病理损伤的影响
使用6-8周龄雌性MRL/lpr小鼠,从17周龄开始每日腹腔注射DNase I(11284932001,Roche)至21周龄处死;对照组为C57BL/6J小鼠。收集血清、尿液、肾组织,进行生化检测和组织学检查。
评估肾组织损伤程度和DNase I的保护作用
肾组织固定、包埋、切片(2μm),进行HE、PAS、Masson染色,半定量评分,测量胶原阳性面积。
检测肾组织和体外模型中NETs的形成情况,验证DNase I的抑制作用
用免疫荧光和免疫组化检测肾组织中MPO、CitH3、NE的表达;Western blot检测肾组织NE和CitH3蛋白水平;体外用PMA诱导健康人中性粒细胞形成NETs,加DNase I处理,免疫荧光检测MPO和CitH3。
检测炎症因子、NETs相关分子和信号通路分子的表达变化
提取肾、脾或中性粒细胞RNA,RT-PCR检测炎症因子(IL-1β, TNF-α, IL-6等)、NETs相关分子(PADI4, HMGB1, TLR4, MYD88)等表达;Western blot检测TLR4、MYD88、IL6、INOS蛋白水平。
评估DNase I对脾脏和肾脏免疫细胞亚群的影响
取脾脏制备单细胞悬液,流式细胞术分析CD3+CD4+、CD3+CD8+ T细胞、CD3-CD19+ B细胞和CD4+CD25+Foxp3+ Treg比例;用TIMER算法评估肾组织中免疫细胞浸润比例。
全面分析肾组织基因表达变化,揭示DNase I作用的分子通路
对21周龄对照组、MRL/lpr模型组和DNase I治疗组小鼠肾组织进行RNA-seq,鉴定差异表达基因,进行PCA、聚类、Reactome、GO、GSEA富集分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 脱氧核糖核酸酶I | Roche | 11284932001 |
| ELISA | 抗dsDNA ELISA试剂盒 | ADI | 5120 |
| 生化分析 | 考马斯亮蓝法试剂盒 | 南京建成 | C035-2-1 |
| 肌酐试剂盒 | 南京建成 | C011-2-1 | |
| 尿素氮试剂盒 | 南京建成 | C013-2-1 | |
| 免疫荧光/免疫组化 | 绵羊血清 | ZSGB-BIO | ZLI-9022 |
| 抗小鼠IgG抗体 | Servicebio | GB23301 | |
| 抗髓过氧化物酶(MPO)抗体 | BD PharMingen | AB_396309 | |
| 抗中性粒细胞弹性蛋白酶(NE)抗体 | Proteintech | 27642-1-AP | |
| 抗瓜氨酸化组蛋白H3(CitH3)抗体 | Abcam | ab5103 | |
| 免疫荧光 | DAPI | Sigma-Aldrich | -- |
| 体外细胞模型 | 佛波醇12-豆蔻酸酯13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | P1585 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 抗TLR4抗体 | Proteintech | 19811-1-AP | |
| 抗MYD88抗体 | Proteintech | 67969-1-Ig | |
| 抗IL6抗体 | Servicebio | GB11117-100 | |
| 抗iNOS抗体 | Proteintech | 18985-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | HRP-60004 | |
| 流式细胞术 | 抗CD3抗体 | Elabscience | E-AB-F1013Q |
| 抗CD4抗体 | Elabscience | E-AB-F1097S | |
| 抗CD8抗体 | Elabscience | E-AB-F1104J | |
| 抗CD19抗体 | Elabscience | E-AB-F0986E | |
| 抗CD25抗体 | Elabscience | E-AB-F1102D | |
| 抗Foxp3抗体 | Elabscience | E-AB-F1238E | |
| BD FACS Melody流式细胞仪 | BD | -- | |
| RNA提取 | RNA提取试剂盒 | Promega | -- |
| RT-PCR | HiScript II Q RT SuperMix | Vazyme | -- |
| ChamQ SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- | |
| Light Cycler 480 II实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| 图像分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与处理 | MRL/lpr小鼠年龄(6-8周龄)、性别(雌性)、来源;DNase I剂量(未明确说明具体剂量,仅表述为11284932001,Roche)、给药方式(腹腔注射)、给药频率(每日)、给药期间(17周至21周);对照组C57BL/6J小鼠年龄(8周龄) 阅读提示:Methods 2.1 |
| 血清和尿液生化检测 | 采集时间(21周,上午9-11时);抗dsDNA ELISA试剂盒(ADI,5120);尿蛋白测定方法(CBB法);血清肌酐测定方法(肌氨酸氧化酶法);尿素氮测定方法(脲酶法);试剂盒来源(南京建成) 阅读提示:Methods 2.2 |
| 肾组织病理学 | 切片厚度(2μm);染色类型(HE, PAS, Masson);阳性面积量化方法(随机5个视野);病理评分标准(参考文献23) 阅读提示:Methods 2.3 |
| NETs检测 | 免疫荧光/免疫组化抗体及其稀释度:MPO (1:200, AB_396309, BD PharMingen), NE (1:200, 27642-1-AP, Proteintech), CitH3 (1:200, ab5103, Abcam);抗原修复条件(柠檬酸缓冲液高温);封闭血清(绵羊血清 ZLI-9022);DAPI核染;Western blot抗体稀释度:NE (1:1000), CitH3 (1:1000) 阅读提示:Methods 2.4, 2.5; Figure 2 |
| 体外中性粒细胞模型 | 中性粒细胞分离方法(Ficoll密度梯度离心);PMA浓度(25 ng/mL);DNase I浓度(1 mg/mL);处理时间(未明确说明);免疫荧光染色抗体与体内相同 阅读提示:Methods 2.4; Results 3.5; Figure 6 |
| 分子表达分析 | RT-PCR引物序列(补充表S1);内参基因(β-Actin或GAPDH);反应条件(95°C 30s, 40循环 95°C 10s, 60°C 30s, 72°C 30s);每次反应三次重复;Western blot抗体列表及稀释度(见方法2.5) 阅读提示:Methods 2.8, 2.5 |
| RNA-seq | 样本量:Ctr 3, Lpr 4, DNase 4;测序平台(Illumina HiSeq X Ten);DEG筛选标准(q<0.05 且 log2|FC|>2);比对软件(HTSeq);数据可访问性(GSE301237) 阅读提示:Methods 2.6; Results 3.3 |
| 流式细胞术 | 脾脏单细胞制备方法(70μm滤网);密度梯度离心分离淋巴细胞;抗体及荧光标记(见方法2.7);孵育条件(室温暗处30分钟);仪器(BD FACS Melody) 阅读提示:Methods 2.7; Results 3.4; Figure 4 |