建立缺血再灌注模型并检测Trim7表达
验证缺血再灌注后Trim7的表达变化。
使用小鼠tMCAO-R模型和原代神经元OGD/R模型,通过HE染色、qRT-PCR和Western blot检测Trim7及炎症因子表达。
Trim7 aggravates ischemic stroke-associated ferroptosis by promoting ubiquitin-mediated degradation of HSPA5.
包含小鼠tMCAO-R模型和原代神经元OGD/R模型,涵盖基因敲除、过表达、药物抑制、Co-IP、GST pull-down、泛素化分析等多层次验证。
小鼠tMCAO-R模型 大鼠原代皮层神经元OGD/R模型
Trim7 KO和WT小鼠在tMCAO-R后24小时的神经功能评分、TTC和HE染色结果 OGD/R处理的原代皮层神经元中Trim7敲低和过表达的效率及细胞活性(CCK-8) Ferrostatin-1(5 μM)处理对Trim7过表达诱导的铁死亡和炎症的逆转 HEK293T细胞中Co-IP和GST pull-down验证Trim7与HSPA5的相互作用及结构域 蛋白酶体抑制剂MG132(而非CQ)阻断Trim7诱导的HSPA5降解
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证缺血再灌注后Trim7的表达变化。
使用小鼠tMCAO-R模型和原代神经元OGD/R模型,通过HE染色、qRT-PCR和Western blot检测Trim7及炎症因子表达。
确定Trim7缺失是否减轻缺血再灌注损伤和炎症。
对Trim7 KO和WT小鼠进行tMCAO-R手术,进行神经功能评分、TTC和HE染色、F4/80免疫荧光、p-p65免疫组化、qRT-PCR和ELISA检测炎症因子。
检测Trim7敲除是否抑制铁死亡标志物。
测定脑组织中MDA、GSH、GSSG、NADPH/NADP+水平,GPX4蛋白表达和活性。
验证Trim7敲低和过表达在体外的功能效应。
用AdshTrim7或AdTrim7感染原代皮层神经元,进行OGD/R处理,检测细胞活性(CCK-8)、炎症因子mRNA、铁死亡标志物和GPX4表达活性。
验证Trim7的促损伤作用是否通过铁死亡介导。
在Trim7过表达的神经元OGD/R模型中,给予5 μM Fer-1,检测铁死亡标志物、GPX4活性、细胞活性和炎症因子。
确定Trim7的互作蛋白及结合结构域。
通过质谱鉴定,Co-IP、GST pull-down和截短突变体映射实验确定Trim7的PRY/SPRY结构域和HSPA5的SBD结构域介导相互作用。
证明Trim7通过K48泛素化促进HSPA5降解。
用CHX追踪蛋白降解,使用MG132和CQ抑制蛋白酶体和溶酶体,通过泛素化实验和突变分析确定K48连接。
验证HSPA5是Trim7功能的关键下游。
在OGD/R神经元中共同感染AdTrim7和AdHSPA5,检测HSPA5和GPX4蛋白水平、活性、细胞活性、炎症因子和铁死亡标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | 6-0硅胶包被单丝线栓 | Doccol | 602156PK10Re |
| 组织学 | 伊红 | Baso | BA-4024 |
| 免疫荧光 | 抗F4/80抗体 | Servicebio | GB11027 |
| Alexa Fluor® 568山羊抗兔IgG(H+L)二抗 | Invitrogen | A11036 | |
| 免疫组化 | 抗磷酸化p65抗体 | CST | 3033 |
| 兔二步法检测试剂盒 | ZSGB-BIO | PV-9001 | |
| DAB显色液 | ZSGB-BIO | ZLI-9018 | |
| ELISA | TNF-α、IL-6、IL-1β ELISA试剂盒 | ELK | ELK1387-1, ELK1157-1, ELK1271-1 |
| 铁死亡指标检测 | MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131 |
| NADPH/NADP+检测试剂盒 | Beyotime | S0180 | |
| GPX4活性检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K883-M | |
| 细胞培养 | 胰蛋白酶 | GIBCO | 27250018 |
| DMEM-F12培养基 | Pricella | PB150315-500 | |
| 胎牛血清 | Newzerum | FBS-S500 | |
| DNase | Roche | 10104159001 | |
| 40 μm细胞筛网 | Corning | 352340 | |
| 青霉素-链霉素 | Pricella | PB180120 | |
| 多聚L-赖氨酸 | Sigma | 10 mg/ml | |
| Neurobasal培养基 | GIBCO | 10888022 | |
| L-谷氨酰胺 | Beyotime | ST083 | |
| B27添加剂 | GIBCO | 17504044 | |
| 药物处理 | Ferrostatin-1 | MCE | HY-1005791 |
| 腺病毒包装 | pAd/PL-DEST™载体 | ThermoFisher | V49420 |
| Gateway LR Clonase II酶混合物 | ThermoFisher | 2484478 | |
| PEI转染试剂 | Polysciences | 24765-100 | |
| Adeasy腺病毒系统 | Agilent Technologies | 240009 | |
| 细胞活性检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0039 |
| 蛋白提取 | 蛋白酶抑制剂 | Roche | 0469312001 |
| 磷酸酶抑制剂 | Roche | 4906837001 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo | 23225 |
| Western blot | PVDF膜(0.45 μm) | Millipore | IPVH00010 |
| ECL底物 | Bio-Rad | 1705062 | |
| 抗β-actin抗体 | Abclonal | AC026 | |
| 抗Trim7抗体 | Proteintech | 26285-1-AP | |
| 抗GPX4抗体 | Abclonal | A25009 | |
| 抗Flag抗体 | MBL | M185-3L | |
| 抗HA抗体 | Abclonal | AE105 | |
| 抗Myc抗体 | MBL | M047-3 | |
| 抗HSPA5抗体 | CST | 3177 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、周龄、体重、麻醉方案、缺血时间(45分钟)、再灌注时间(24小时)、血流监测标准 阅读提示:Materials and methods: Experimental animals, Establishment of t/MCAO-R model |
| 原代神经元培养和OGD/R | 大鼠年龄、细胞培养条件、OGD/R时间(缺氧3小时复氧6小时)、培养基成分 阅读提示:Materials and methods: Isolation and culture of primary rat neurons, OGD/R stimulation |
| 腺病毒感染 | 腺病毒构建方法、感染复数或滴度、感染时间 阅读提示:Materials and methods: Construction and infection of knockdown and overexpression adenoviruses |
| 铁死亡指标检测 | 各检测试剂盒的操作步骤、样本处理、波长等 阅读提示:Materials and methods: Measurement of MDA, GSH, GSSG, NADPH/NADP+ levels and GPX4 activity |
| 蛋白相互作用验证 | 质粒构建、转染条件、裂解液成分、IP洗涤条件 阅读提示:Materials and methods: Co-immunoprecipitation, GST pull-down, Mapping, Ubiquitination assay |