体外抗GSC效应评估
评估氨氯地平对GSC活力、增殖、侵袭、凋亡、细胞周期和干性的影响
采用CCK8、EdU、3D侵袭、TUNEL、Annexin V-FITC/PI、PI染色和Western blot检测GSC23和GSC11细胞活力、增殖、侵袭、凋亡、细胞周期和干性标志物。
Amlodipine exerts inhibitory effects against glioma stem cells through degrading EGFR and down-regulating its downstream pro-survival pathways.
包含体外细胞实验(CCK8、EdU、流式细胞术、Western blot、免疫荧光)、机制验证(CHX追踪、Co-IP、抑制剂)和体内颅内异种移植模型,且有多重证据支持。
GSC23胶质瘤干细胞系 GSC11胶质瘤干细胞系 颅内异种移植模型(GSC23-Luc细胞)
氨氯地平浓度0-25 μM,处理24-72小时 GSC23和GSC11细胞系来源 体内模型:GSC23-Luc细胞颅内注射,1×10^6细胞/只,BALB/c裸鼠 氨氯地平给药剂量:10 mg/kg/day,腹腔注射,持续3周 Akt激动剂SC79处理:10 μg/mL用于体外,10 mg/kg/day用于体内
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估氨氯地平对GSC活力、增殖、侵袭、凋亡、细胞周期和干性的影响
采用CCK8、EdU、3D侵袭、TUNEL、Annexin V-FITC/PI、PI染色和Western blot检测GSC23和GSC11细胞活力、增殖、侵袭、凋亡、细胞周期和干性标志物。
验证氨氯地平的作用是否依赖于钙通道阻滞,并检测其与EGFR的结合
使用其他CCB(硝苯地平、尼卡地平)和钙螯合剂BAPTA-AM处理GSCs,并检测L型钙通道激动剂Bay-K-8644是否逆转效应;通过分子对接预测氨氯地平与EGFR的结合。
确定氨氯地平诱导EGFR降解的途径(蛋白酶体或溶酶体)
使用CHX追踪实验检测EGFR稳定性,Co-IP检测泛素化,并结合蛋白酶体抑制剂MG132和溶酶体抑制剂Baf A1观察EGFR蛋白水平变化,通过免疫荧光检测EGFR与LAMP1共定位。
确定EGFR内吞是否依赖网格蛋白或脂筏
使用Pitstop2(网格蛋白抑制剂)和MβCD(脂筏破坏剂)处理GSCs,观察EGFR内吞和下游信号变化。
验证Akt激活能否逆转氨氯地平的抗GSC效应
使用Akt激动剂SC79处理GSCs,检测其对细胞活力、增殖、侵袭、干性和凋亡的影响。
评估氨氯地平对GSC来源的颅内肿瘤生长和生存的影响
建立GSC23-Luc细胞颅内异种移植模型,腹腔注射氨氯地平或联合SC79,通过生物发光成像监测肿瘤生长,记录生存期,并进行组织学分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | -- |
| B27添加剂 | Gibco | -- | |
| 表皮生长因子 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 星形胶质细胞生长添加剂 | ScienCell | -- | |
| 药物处理 | 氨氯地平 | Selleck | S1905 |
| 硝苯地平 | Selleck | S1808 | |
| 尼卡地平 | Selleck | S5255 | |
| BAPTA-AM | Selleck | S7534 | |
| (S)-(-)-Bay-K-8644 | MCE | HY-15124 | |
| SC79 | MCE | T2274 | |
| 巴佛洛霉素A1 | MCE | HY-100558 | |
| 甲基-β-环糊精 | MCE | HY-101461 | |
| MG132 | MCE | HY-13259 | |
| 细胞活力分析 | 细胞计数试剂盒-8 | Meilunbio | -- |
| 细胞增殖分析 | EdU Apollo567体外试剂盒 | RiboBio | C10310-1 |
| 细胞核染色 | DAPI | Beyotime | -- |
| 细胞周期分析 | StemPro Accutase | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 碘化丙啶 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞凋亡分析 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | MULTI Sciences | -- |
| 组织凋亡检测 | 一步法TUNEL凋亡检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| 蛋白质提取 | 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Sigma-Aldrich | -- |
| Western blot | PVDF膜 | NEN Research Products | -- |
| 化学发光试剂Plus | PerkinElmer | -- | |
| 免疫共沉淀 | 免疫沉淀缓冲液 | Thermo Fisher | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Sigma-Aldrich | -- |
| RT-qPCR | 逆转录cDNA试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| SYBR PrimeScript RT-PCR试剂盒 | Novoprotein | -- | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Solarbio | T8200 |
| 山羊血清 | Solarbio | SL038 | |
| 动物实验 | D-荧光素 | GoldBio | LUCK10G |
| 分子对接 | AutoDock Vina | -- | -- |
| PyMOL | -- | -- | |
| 成像系统 | IVIS成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 流式细胞术 | FACS Calibur流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- |
| 显微镜 | 荧光显微镜 | Leica | -- |
| 共聚焦显微镜 | 激光共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| 酶标仪 | 酶标仪 | FilterMax F5 | -- |
| 组织切片 | 切片机 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | GSC11和GSC23细胞系来源(MD Anderson Cancer Center),培养基DMEM/F12含B27、EGF、b-FGF;胶质母细胞瘤细胞系SNB19、T98G、LN229(ATCC)培养于DMEM+10%FBS;NHAs培养于DMEM+10%FBS+1%星形胶质细胞生长添加剂 阅读提示:Materials and methods - Cell lines and culture |
| 药物处理 | 氨氯地平浓度0-25 μM;其他CCB(硝苯地平、尼卡地平)和BAPTA-AM浓度0-25 μM;L型钙通道激动剂Bay-K-8644浓度200 nM;Akt激动剂SC79浓度10 μg/mL 阅读提示:Materials and methods - Antibodies and reagents; Figure legends |
| 细胞活力测定 | CCK8检测:每孔3×10^3细胞,处理24-72小时,孵育2小时,450 nm波长;IC50计算使用GraphPad Prism 阅读提示:Materials and methods - Cell viability analysis |
| 增殖检测 | EdU实验:50 μM EdU孵育2小时,4%多聚甲醛固定,Apollo Dye染色,DAPI复染 阅读提示:Materials and methods - 5-Ethynyl-2'-deoxyuridine (EdU) assay |
| 细胞周期分析 | 2×10^5细胞/孔于6孔板,药物处理48小时;PI(50 μg/ml)和RNase(1.0 mg/ml)染色30分钟;流式分析 阅读提示:Materials and methods - Cell cycle analysis |
| 凋亡检测 | TUNEL染色使用一步法试剂盒;Annexin V-FITC/PI染色流程 阅读提示:Materials and methods - Annexin V-fluorescein isothiocyanate/propidium iodide (Annexin V-FITC/PI) assay; TUNEL staining |
| 3D侵袭实验 | 肿瘤球直径30-50 μm;Matrigel与DMEM/F12等体积混合,每孔200 μl;药物处理48小时,每24小时拍照 阅读提示:Materials and methods - Three-dimensional (3D) spheroid invasion assay |
| 肿瘤球形成实验 | 每孔500细胞于96孔;药物处理7天;记录肿瘤球数量和大小 阅读提示:Materials and methods - Tumor sphere formation assay |
| Western blot | 蛋白上样量20-30 μg;10% SDS-PAGE;一抗孵育4°C过夜;二抗孵育;化学发光检测 阅读提示:Materials and methods - Western blot |
| qRT-PCR | 使用TRIzol提取总RNA;逆转录cDNA;SYBR PrimeScript RT-PCR Kit;引物序列(GAPDH、CD133、SOX2、EGFR) 阅读提示:Materials and methods - Quantitative reverse transcription - polymerase chain reaction (qRT-PCR) |
| 分子对接 | EGFR结构PDB:1NQL;AutoDock Vina v1.2.0;结合能-5.8 kcal/mol 阅读提示:Materials and methods - Molecular docking analysis |
| 动物实验 | GSC23-Luc细胞(1×10^6)颅内注射至右侧尾状核;氨氯地平10 mg/kg/day腹腔注射,持续3周;SC79 10 mg/kg/day;每组5只;生物发光监测在7、14、21、28天 阅读提示:Materials and methods - Intracranial xenograft model |