MK2表达及预后分析
验证MK2在LUAD组织中的表达水平及其与患者预后的关系
利用TIMER 2.0数据库分析MK2 mRNA水平;对47对LUAD及邻近正常组织进行IHC染色并定量;结合Kaplan-Meier Plotter数据库进行生存分析。
MK2-mediated AKT/MYC signaling activation promotes epithelial-mesenchymal transition in lung adenocarcinoma.
实验包括数据库分析、组织芯片IHC、细胞功能实验、Western blot、Co-IP和类器官验证,但缺乏动物模型体内验证。
A549细胞系 H358细胞系 患者来源肺腺癌类器官(PDLCOs) LUAD组织微阵列(47对肿瘤及邻近组织)
MK2抑制剂MK2-IN-1处理浓度为20 μM,处理24小时 AKT激活剂SC79浓度为20 μg/mL MK2在LUAD组织中的表达水平及与预后的关系 MK2抑制后EMT标志物(E-钙黏蛋白、波形蛋白等)的表达变化 MK2与AKT的相互作用通过Co-IP验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证MK2在LUAD组织中的表达水平及其与患者预后的关系
利用TIMER 2.0数据库分析MK2 mRNA水平;对47对LUAD及邻近正常组织进行IHC染色并定量;结合Kaplan-Meier Plotter数据库进行生存分析。
评估MK2抑制对LUAD细胞增殖和凋亡的影响
使用MK2抑制剂MK2-IN-1处理A549和H358细胞,通过EdU实验检测增殖,Annexin V-APC/7-AAD双染流式细胞术检测凋亡。
探究MK2抑制对LUAD细胞迁移、侵袭及EMT标志物的影响
通过划痕实验和Transwell侵袭实验评估迁移和侵袭能力;利用RT-qPCR和Western blot检测EMT相关标志物(E-钙黏蛋白、N-钙黏蛋白、波形蛋白、MMP2等)表达。
验证MK2是否调节AKT/MYC信号通路及其与AKT的相互作用
通过Western blot检测MK2抑制后p-AKT(Ser-473)、总AKT和C-MYC蛋白水平;Co-IP实验验证MK2与AKT的直接相互作用;并在48和72小时观察持续性抑制效应。
验证AKT/MYC通路是否为MK2调控EMT和细胞迁移侵袭的下游效应机制
在MK2抑制剂存在下,使用AKT激活剂SC79处理细胞,通过Western blot检测相关蛋白表达,并通过划痕和Transwell实验评估功能回复。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | MK2抗体 | Proteintech | 13949-1-AP |
| 牛血清白蛋白 | Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | E-IR-R107 | |
| 类器官培养 | 基质胶 | bioGenous Biotechnology Co. Ltd | M315066 |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Solarbio | -- |
| 药物处理 | MK2抑制剂 | MCE | 1314118-92-7 |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Beyotime | P1045 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Beyotime | P1081 | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| MYC抗体 | Proteintech | 10828-1-AP | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| AKT抗体 | Proteintech | 10176-2-AP | |
| 磷酸化AKT (Ser-473)抗体 | HUABIO | ET1607-73 | |
| E-钙黏蛋白抗体 | Proteintech | 60335-1-Ig | |
| 波形蛋白抗体 | Proteintech | 60330-1-Ig | |
| N-钙黏蛋白抗体 | Abcolonal | A0433 | |
| MMP2抗体 | Proteintech | 66366-1-Ig | |
| 超敏ECL化学发光试剂 | GLPBIO | GK10008 | |
| RT-qPCR | Eastep总RNA提取试剂盒 | Promega | LS1040 |
| Superscript III逆转录酶 | Applied Biosystems | -- | |
| PerfectStart® Green qPCR Super Mix | -- | -- | |
| 免疫共沉淀 | AKT抗体 | Proteintech | 10176-2-AP |
| Protein A或G磁珠 | BeaverBio™ | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-APC/7-AAD凋亡检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A218 |
| 细胞增殖检测 | EdU细胞增殖检测试剂盒(Alexa Fluor 555) | CellorLab | CX003 |
| 细胞迁移/侵袭观察 | Leica DMI8荧光显微镜 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MK2表达及预后分析 | 组织芯片样本数(原文为47对可分析);MK2抗体的稀释比例(1:200);MK2高/低表达分组阈值 阅读提示:见2.2节及图1 |
| 细胞增殖与凋亡检测 | MK2-IN-1浓度(20 μM)及处理时间(24小时);EdU孵育浓度和时间(10 μM,2小时) 阅读提示:见2.5、2.9、2.12节及图2 |
| 细胞迁移与侵袭实验 | 划痕实验细胞密度(4 × 10^5 cells/well)及检测时间点(0、24小时);侵袭实验基质胶稀释比例(1:6)及细胞浓度(5 × 10^5 cells/mL) 阅读提示:见2.10、2.11节及图3 |
| AKT/MYC通路验证 | MK2-IN-1处理时间(24、48、72小时);SC79浓度(20 μg/mL)及预处理时间(约6小时);检测抗体(p-AKT Ser-473、C-MYC) 阅读提示:见2.5节、3.4节、3.5节及图4、图5 |