制备山楂益生菌后生元
获取实验所需的后生元样品。
将山楂水提物与副干酪乳杆菌共发酵72小时,离心过滤获得后生元。
The postbiotic of hawthorn-probiotic ameliorates constipation by multi-pathway inhibition of PANoptosis in intestinal epithelial cells.
包含体内小鼠模型、体外细胞实验及网络药理学分析,并进行功能验证(细胞活力、凋亡检测)和机制验证(Western blot、RT-qPCR)。
洛哌丁胺诱导的便秘小鼠模型(雄性KM小鼠,240日龄) NCM460肠上皮细胞 Caco-2肠上皮细胞 模拟肠道微环境的条件培养基
小鼠分组及给药:正常组、模型组(洛哌丁胺5 mg/kg/天,7天)、山楂组(0.2 mL/天,1 g/mL)、益生菌组(0.2 mL上清)、后生元组(0.2 mL/天,7天) 条件培养基制备:结肠内容物100 mg/mL,RPMI-1640,0.45 μm和0.22 μm过滤,1:4稀释 细胞处理:条件培养基或10 μg/mL LPS处理24小时 检测指标:细胞活力(CCK-8)、凋亡(Annexin V-FITC/PI流式)、坏死性凋亡(YO-PRO-1/PI)、mRNA和蛋白表达 统计方法:Levene检验,方差齐则one-way ANOVA,不齐则Kruskal-Wallis,P<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取实验所需的后生元样品。
将山楂水提物与副干酪乳杆菌共发酵72小时,离心过滤获得后生元。
在体内评估后生元对便秘的影响。
雄性KM小鼠(240日龄)随机分为5组(n=5),洛哌丁胺诱导便秘后,分别给予水、山楂提取物、益生菌上清或后生元灌胃7天。
在体外模拟不同小鼠肠道微环境以研究其对细胞的影响。
收集各组小鼠结肠内容物,均质后重悬于RPMI-1640,过滤获得条件培养基。
验证条件培养基对肠上皮细胞活力和凋亡、焦亡、坏死性凋亡的影响。
NCM460细胞用条件培养基或LPS处理24小时,检测CCK-8细胞活力、Annexin V-FITC/PI凋亡、YO-PRO-1/PI坏死性凋亡。
揭示后生元对凋亡、焦亡和坏死性凋亡通路分子的调控。
在体外细胞和体内结肠组织中,通过RT-qPCR和Western blot检测相关基因和蛋白表达。
评估后生元对全身免疫反应的调节。
通过流式细胞术分析小鼠脾脏中CD4+和CD8+ T细胞亚群及其细胞因子分泌。
预测后生元治疗便秘的潜在靶点和通路。
使用数据库预测HP靶点、便秘相关靶点和PANoptosis基因,取交集构建PPI网络,进行GO和KEGG富集分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 后生元制备 | 酪蛋白消化物 | -- | -- |
| 牛肉提取物 | -- | -- | |
| 酵母提取物 | -- | -- | |
| 柠檬酸三铵 | -- | -- | |
| 醋酸钠 | -- | -- | |
| 硫酸镁 | -- | -- | |
| 硫酸锰 | -- | -- | |
| 磷酸氢二钾 | -- | -- | |
| 葡萄糖 | -- | -- | |
| 吐温80 | -- | -- | |
| 动物实验 | 洛哌丁胺 | -- | -- |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| RNA提取 | FreeZol试剂 | Vazyme | -- |
| cDNA合成 | HiScript IV第一链cDNA合成试剂盒 | Vazyme | -- |
| RT-qPCR | ChamQ SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Servicebio | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| Caspase 1抗体 | Abmart | M025280 | |
| NLRP3抗体 | Abmart | P60622R3 | |
| GSDMD抗体 | Abmart | PU224937 | |
| Caspase3抗体 | GeneTex | GTX110543 | |
| Caspase9抗体 | CST | 9508S | |
| BAX抗体 | Wanleibio | WL01637 | |
| Bcl-2抗体 | Abways | CY6717 | |
| β-actin抗体 | Servicebio | GB15003-100 | |
| HRP标记二抗 | Servicebio | GB23303 | |
| 化学发光成像系统 | Tanon | -- | |
| 荧光显微镜检测 | YP1/PI工作液 | Beyotime | -- |
| 细胞活力检测 | 脂多糖 | Sigma | -- |
| CCK-8试剂 | NCM Biotech | -- | |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC/PI | Elabscience | -- |
| YO-PRO-1/PI | Beyotime | -- | |
| 流式细胞仪 | BD Accuri C5 | -- | |
| 成分鉴定 | 超高效液相色谱系统 | Thermo Vanquish Flex | -- |
| ACQUITY UPLC T3色谱柱 | Waters | -- | |
| 质谱仪 | Orbitrap Exploris 120 | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 后生元制备 | 山楂水提物浓度1 g/mL,发酵条件35°C、220 rpm、72小时,离心和过滤参数 阅读提示:本章节 Materials and methods 2.1 |
| 动物模型 | 小鼠品系(KM)、年龄(240日龄)、性别(雄性)、洛哌丁胺剂量5 mg/kg/天、给药时间7天、各组样本量n=5 阅读提示:本章节 Materials and methods 2.2 |
| 条件培养基制备 | 结肠内容物浓度100 mg/mL,过滤孔径0.45 μm和0.22 μm,稀释比例1:4 阅读提示:本章节 Materials and methods 2.3 |
| 细胞实验 | 细胞系NCM460、Caco-2,处理时间24小时,LPS浓度10 μg/mL 阅读提示:本章节 Materials and methods 2.4、2.7、2.8、2.9 |
| RT-qPCR | 引物序列(Table 1),反应条件(95°C 1分钟,40个循环95°C 15秒、60°C 30秒),参考基因GAPDH 阅读提示:本章节 Materials and methods 2.5,Table 1 |
| Western blot | 一抗稀释比例(Caspase1 1:1000等),二抗1:10000,抗体货号 阅读提示:本章节 Materials and methods 2.6 |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC/PI和YO-PRO-1/PI孵育时间15-20分钟,流式细胞仪型号BD Accuri C5 阅读提示:本章节 Materials and methods 2.9 |