检测衰老细胞中ASNS表达和Asn水平
验证衰老细胞是否存在天冬酰胺代谢异常。
使用RT-qPCR和Western blot检测多种衰老模型(2BS、MEF、HUVECs、ARPE-19)中ASNS mRNA和蛋白水平,并用LC-MS/MS检测细胞内Asn水平。
Asparaginase and Autophagy Inhibitors Effectively Remove Senescent Cells by Synergistically Limiting Asparagine Supply.
包含体外多种衰老模型、TIS肿瘤细胞、动物模型(自然衰老、骨质疏松、动脉粥样硬化、NAFLD),并有功能验证和机制验证(ASNS/ATF4、自噬、凋亡途径)。
人胚肺成纤维细胞2BS 小鼠胚胎成纤维细胞MEF 人脐静脉内皮细胞HUVECs 人视网膜色素上皮细胞ARPE-19 18月龄自然衰老C57BL/6J小鼠 SAMP6小鼠骨质疏松模型 ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型 ApoE-/-小鼠NAFLD模型 MiaPaCa-2和PANC-1胰腺癌细胞TIS模型
衰老细胞中ASNS表达下调,需确认不同衰老模型中的一致性。 ASNase和HCQ的浓度(0.5 U/mL ASNase,25 μM HCQ)及处理时间(3天)。 AH联合治疗在老年小鼠中的给药方案:ASNase腹腔注射2 U/g,HCQ口服40 μg/g,每2周连续3天,持续12周。 外源Asn补充(200 μM,每12小时)能否逆转AH诱导的凋亡。 细胞凋亡检测方法(Annexin V-APC染色)及统计方法。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证衰老细胞是否存在天冬酰胺代谢异常。
使用RT-qPCR和Western blot检测多种衰老模型(2BS、MEF、HUVECs、ARPE-19)中ASNS mRNA和蛋白水平,并用LC-MS/MS检测细胞内Asn水平。
验证ASNS下调在组织水平是否与衰老相关。
对2月龄和24月龄小鼠的肝、肺、肾、肠、肌肉进行免疫组化染色,检测ASNS和P16。
确定ASNS下调是否导致衰老表型。
在年轻2BS细胞中敲低ASNS,检测衰老标志物(P16、P21、P53)、SA-β-gal活性、SASP因子(IL1β、IL6)和增殖能力;过表达ASNS后再诱导衰老,观察是否能减轻衰老表型。
确定ASNS影响衰老是否通过天冬酰胺代谢。
在ASNS敲低细胞中补充Asn或Glu,检测衰老标志物;在博来霉素诱导衰老过程中不同时间点补充Asn,观察其对衰老进程的影响。
测试联合靶向细胞外和细胞内Asn是否能选择性杀死衰老细胞。
用ASNase和自噬抑制剂(HCQ或基因敲低BECN1/ATG7)处理年轻和衰老细胞,检测细胞内Asn水平、凋亡率和细胞存活。
测试AH是否能清除治疗诱导衰老的肿瘤细胞。
用吉西他滨诱导胰腺癌细胞(MiaPaCa-2、PANC-1)衰老,然后给予AH处理,检测ASNS表达、细胞内Asn和凋亡。
测试AH是否能清除老年小鼠体内的衰老细胞并改善生理功能。
对18月龄小鼠进行AH治疗12周,检测多个组织中的P16阳性细胞、SA-β-gal、LaminB1,血清炎症因子和抗氧化指标,并评估运动功能。
验证AH是否能减缓年龄相关疾病的进展。
在SAMP6小鼠骨质疏松模型、ApoE-/-小鼠NAFLD和动脉粥样硬化模型中,给予AH治疗,评估骨骼参数、肝脏病理和动脉粥样硬化斑块。
评估AH治疗的潜在毒性。
在体外评估AH对小鼠间充质干细胞的毒性,在体内检测血清肝肾功能、血常规和组织病理。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 内皮细胞培养基 | -- | -- | |
| 内皮细胞生长添加剂 | -- | -- | |
| Vigofect转染试剂 | Vigorous Biotechnology | -- | |
| 细胞衰老诱导 | 博来霉素 | TargetMol | T6116 |
| 吉西他滨 | Selleck | S1714 | |
| 药物处理 | L-天冬酰胺酶 | MCE | HY-P1923 |
| 羟氯喹 | TargetMol | T9287 | |
| 达沙替尼 | Aladdin | D125110 | |
| 槲皮素 | Sigma | Q4951 | |
| L-天冬酰胺 | Sigma | A0884 | |
| L-天冬氨酸 | Sigma | A6558 | |
| 谷氨酸 | Sigma | G3640 | |
| Lys05 | TargetMol | T3437 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Biorigin | BN20800 | |
| 化学发光HRP底物 | Millipore | P90720 | |
| ChemiDoc成像系统 | BioRad | -- | |
| RT-qPCR | TransZol试剂 | TransGen Biotech | ET101-01-V2 |
| TransScriptII 一链cDNA合成试剂盒 | TransGen Biotech | AH341-01 | |
| PerfectStart绿色qPCR预混液 | TransGen Biotech | AQ602-01 | |
| 凋亡检测 | Annexin V-APC凋亡检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A217 |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| Accuri c6 Plus流式细胞仪 | BD | -- | |
| ELISA | 小鼠IL1β ELISA试剂盒 | Servicebio | GEM0002 |
| 小鼠IL6 ELISA试剂盒 | Servicebio | GEM0001 | |
| 谷胱甘肽过氧化物酶检测试剂盒 | Njjcbio | A005 | |
| 总超氧化物歧化酶检测试剂盒 | Njjcbio | A001-1 | |
| 丙二醛检测试剂盒 | Njjcbio | A003-1 | |
| 血液分析 | 自动血细胞分析仪 | Mindray | BC-2800vet |
| 生化分析仪 | Mindray | Chemray | |
| LC-MS/MS | 三重四极杆液相色谱-质谱联用系统 | Agilent | 1290/6460 |
| Micro-CT | 显微CT扫描仪 | Bruker MicroCT | SkyScan |
| 透射电镜 | 超薄切片机 | Leica | EM |
| 金刚石刀 | Diatome | -- | |
| 透射电子显微镜 | JEOL | JEM-1400 | |
| 免疫组化/免疫荧光 | ASNS抗体 | Proteintech | 14681-1-AP |
| P16抗体 | Abcam | ab108349 | |
| P16抗体 | Abcam | ab54210 | |
| Lamin B1抗体 | afantibody | AFRM0038 | |
| Western blot | P21抗体 | Abcam | ab109520 |
| P53抗体 | Santa Cruz | sc126 | |
| ATF4抗体 | ABclonal | A18687 | |
| LC3B抗体 | ABclonal | A5618 | |
| BECN1抗体 | ABclonal | A11761 | |
| ATG7抗体 | ABclonal | A19604 | |
| P62抗体 | Proteintech | 18420-1-AP | |
| PSMB5抗体 | ABclonal | A1975 | |
| PSMB6抗体 | ABclonal | A4053 | |
| PSMB7抗体 | ABclonal | A14771 | |
| p-GCN2抗体 | ABclonal | AP1428 | |
| GCN2抗体 | ABclonal | A2307 | |
| p-PERK抗体 | ABclonal | AP1501 | |
| PERK抗体 | ABclonal | A21255 | |
| p-eIF2α抗体 | ABclonal | AP0745 | |
| eIF2α抗体 | ABclonal | A21221 | |
| Bcl-XL抗体 | Proteintech | 26967-1-AP | |
| Bax抗体 | Proteintech | 60267-1-lg | |
| Caspase3抗体 | Abcam | Ab32351 | |
| 活化Caspase3抗体 | CST | 9664S | |
| 活化Caspase9抗体 | CST | 9505P |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞衰老模型 | 衰老诱导条件:博来霉素浓度(50 μg/mL)、电离辐射剂量(10 Gy)、复制性衰老传代次数(2BS 50-60次,HUVEC 10-13次,MEF 8-10次);培养时间(7天) 阅读提示:Methods 4.4 Cellular Senescence Induction |
| AH处理 | ASNase浓度(0.5 U/mL)、HCQ浓度(25 μM)、处理时间(3天);外源Asn补充浓度(200 μM)和频率(每12小时) 阅读提示:Figure 3 legend (D-H), Methods 4.2, 4.3 |
| 动物实验 | 小鼠品系和年龄(自然衰老18月龄C57BL/6J;SAMP6 4月龄;ApoE-/- 12周龄);分组和各组数量;给药剂量(ASNase 2 U/g腹腔注射,HCQ 40 μg/g口服);给药周期(每2周连续3天,共12周);处死时间 阅读提示:Figure 5A, Figure 6A,G, Methods 4.5 |
| 凋亡检测 | Annexin V-APC凋亡检测试剂盒(Elabscience)和PI染色;流式细胞仪型号(Accuri c6 Plus, BD);凋亡细胞定义为Annexin V阳性 阅读提示:Methods 4.13 Apoptosis Detection |
| 统计方法 | 单因素方差分析(Holm-Sidak多重比较)、双因素方差分析(Tukey事后比较)、未配对双尾t检验;显著性水平(*p<0.05, **p<0.01, ***p<0.001) 阅读提示:Methods 4.19 Statistical Analysis |