ELMO1表达分析
评估ELMO1在ESCC细胞系中的表达水平。
通过GEPIA2数据库分析ELMO1在ESCC组织中的表达;通过RT-qPCR和Western blot检测KYSE150和Het-1A细胞中ELMO1的mRNA和蛋白水平。
TFAP2A-mediated Transcriptional Activation of ELMO1 Inhibits Ferroptosis and Promotes Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression.
包含细胞实验、分子机制验证(ChIP、双荧光素酶)及体内异种移植模型,多层次验证功能与机制。
KYSE150细胞 Het-1A细胞 BALB/c裸鼠异种移植模型
ELMO1和TFAP2A在KYSE150细胞中的表达水平 sh-ELMO1和sh-TFAP2A的敲低效率及其对细胞功能的影响 TFAP2A对ELMO1启动子的直接结合(ChIP-qPCR) 铁死亡指标(ROS、MDA、GSH、Fe2+)及GPX4/SLC7A11蛋白表达 体内肿瘤生长及铁死亡标志物(肿瘤体积、重量、Ki67等)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ELMO1在ESCC细胞系中的表达水平。
通过GEPIA2数据库分析ELMO1在ESCC组织中的表达;通过RT-qPCR和Western blot检测KYSE150和Het-1A细胞中ELMO1的mRNA和蛋白水平。
探究ELMO1对ESCC细胞活力、迁移、侵袭及铁死亡的影响。
使用慢病毒介导的shRNA敲低KYSE150细胞中的ELMO1,通过CCK-8、伤口愈合、Transwell实验检测细胞功能,并检测铁死亡相关指标。
验证TFAP2A是否直接转录调控ELMO1。
通过双荧光素酶报告基因实验和ChIP-qPCR检测TFAP2A对ELMO1启动子活性和结合能力。
探究TFAP2A是否通过ELMO1影响ESCC细胞功能和铁死亡。
敲低TFAP2A并过表达ELMO1,检测细胞活力、迁移、侵袭及铁死亡指标。
在体内验证TFAP2A/ELMO1轴对肿瘤生长和铁死亡的影响。
将KYSE150细胞(对照、sh-TFAP2A、sh-TFAP2A+ELMO1过表达)皮下注射到裸鼠,测量肿瘤体积和重量,并通过RT-PCR、免疫组化、HE染色和生化检测评估相关指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Hyclone | -- | |
| Het-1A细胞 | ATCC | -- | |
| RNA提取 | 快速RNA提取试剂盒 | Tiangen | DP419 |
| RT-qPCR | SYBR Green RT-qPCR试剂盒 | Sigma-Aldrich | QR0100 |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解缓冲液 | Abcam | ab170197 |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 |
| Western blot | PVDF膜 | Abcam | ab133411 |
| 抗ELMO1抗体 | Abclonal | A5169 | |
| 抗TFAP2A抗体 | Sangon | D151771 | |
| 抗GPX4抗体 | Abclonal | A13309 | |
| 抗SLC7A11抗体 | Proteintech | 26864-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab181602 | |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | Abcam | ab6702 | |
| 增强化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | A38554 | |
| CCK-8实验 | CCK-8溶液 | MedChemExpress | HY-K0301 |
| Transwell侵袭实验 | Transwell小室 | Corning | 353097 |
| 基质胶 | BD Biosciences | 356234 | |
| 结晶紫 | Sigma-Aldrich | C0775 | |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Meilunbio | MB4682 |
| MDA检测 | 脂质过氧化检测试剂盒 | Jiancheng | A003-1 |
| GSH检测 | 还原型谷胱甘肽检测试剂盒 | Beyotime | S0053 |
| Fe2+检测 | 比色法检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K304-S |
| 铁检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | EEA009 | |
| 双荧光素酶报告基因实验 | pGL3荧光素酶报告载体 | Promega | -- |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- | |
| ChIP-qPCR | SimpleChIP酶解染色质IP试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9003 |
| 抗TFAP2A抗体 | Abcam | ab108311 | |
| 对照IgG | Beyotime | A7016 | |
| 免疫组织化学 | 抗Ki67抗体 | Abcam | ab15580 |
| HRP二抗 | Abcam | ab205718 | |
| 显微镜观察 | 光学显微镜 | Olympus | CX43 |
| 图像分析 | ImageJ软件 | NIH | v1.8.0.112 |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9软件 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源:KYSE150(ESCC)和Het-1A(正常食管上皮);培养基:RPMI 1640(KYSE150)和DMEM(Het-1A),均含10% FBS;培养条件:37°C,5% CO2 阅读提示:Materials and Methods: Cell Treatment |
| 基因敲低/过表达 | 慢病毒载体构建;shRNA序列(sh-ELMO1-3, sh-TFAP2A-1等);感染条件:细胞接种密度1×10^5/孔,感染时细胞融合度60%,感染时间48小时 阅读提示:Materials and Methods: Cell Treatment |
| 细胞功能检测 | CCK-8实验:细胞数5000/孔,CCK-8浓度10%,孵育时间3小时;伤口愈合:细胞数5×10^5/孔,划痕后0和24小时拍照;Transwell:细胞数4×10^4,基质胶包被,孵育时间未明确说明 阅读提示:Materials and Methods: Cell Counting kit-8 (CCK-8) Assay, Wound Healing Assay, Transwell Assay |
| 铁死亡指标检测 | ROS检测:使用ROS检测试剂盒(MB4682)按说明书;MDA检测:使用脂质过氧化试剂盒(A003-1);GSH检测:使用还原型谷胱甘肽试剂盒(S0053);Fe2+检测:组织用比色试剂盒(E-BC-K304-S),细胞用铁试剂盒(EEA009),具体步骤按说明书 阅读提示:Materials and Methods: Reactive Oxygen Species (ROS) Detection, Malondialdehyde (MDA) and Glutathione (GSH) Assays, Ferrous Ion (Fe2+) Detection |
| 转录调控验证 | 双荧光素酶报告基因:ELMO1启动子克隆至pGL3载体,共转染TFAP2A/NC,转染试剂Lipofectamine 3000,检测时间48小时;ChIP-qPCR:交联时间15分钟,使用SimpleChIP试剂盒,抗体anti-TFAP2A (ab108311)或对照IgG (A7016) 阅读提示:Materials and Methods: Dual-luciferase Reporter Assay, Chromatin Immunoprecipitation-qPCR (ChIP-qPCR) |
| 动物实验 | 动物:6周龄雄性BALB/c裸鼠;随机分组;接种细胞数6×10^5/只,皮下注射于右侧;肿瘤体积每两天测量一次 阅读提示:Materials and Methods: Animal Treatment |
| 体内指标检测 | HE染色:组织固定于4%多聚甲醛24小时,石蜡包埋,切片厚度4μm;IHC:抗体稀释比例(ELMO1 1:100, TFAP2A 1:50, Ki67 1:200, GPX4 1:50, SLC7A11 1:50),二抗1:2000;MDA、GSH、Fe2+检测方法同体外 阅读提示:Materials and Methods: Hematoxylin–eosin (HE) Staining, Immunohistochemistry (IHC), Ferrous Ion (Fe2+) Detection |