DOX诱导心肌细胞铁死亡和凋亡的验证
确定DOX在心肌细胞中诱导的主要细胞死亡形式。
使用CCK-8检测细胞活力,Western blot检测GPX4、Bax、Cleaved Caspase3,流式检测ROS、MDA、C11-BODIPY、Fe2+及凋亡。
NEDD4L-Mediated Ubiquitination of GPX4 Exacerbates Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity.
包含体外细胞实验(H9C2、HEK293T)和体内动物模型(小鼠DIC模型),并进行了功能验证(敲低/过表达)和机制验证(泛素化、结构域分析)。
H9C2心肌细胞 HEK293T细胞 C57BL/6小鼠DIC模型(DOX诱导)
DOX处理浓度2 μM,处理时间24 h(体外) DOX处理剂量15 mg/kg,单次腹腔注射,7天后检测(体内) AAV9-shNedd4l敲低NEDD4L,尾静脉注射,2周后DOX处理 siNedd4l-2用于体外敲低NEDD4L,siGpx4-1用于敲低GPX4
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定DOX在心肌细胞中诱导的主要细胞死亡形式。
使用CCK-8检测细胞活力,Western blot检测GPX4、Bax、Cleaved Caspase3,流式检测ROS、MDA、C11-BODIPY、Fe2+及凋亡。
检测DOX是否通过蛋白酶体途径促进GPX4降解。
使用CHX追踪GPX4半衰期,MG132和CQ处理确定降解途径,免疫沉淀检测GPX4泛素化。
筛选并验证与GPX4泛素化相关的E3连接酶。
用UbiBrowser预测候选E3,Western blot检测表达变化,co-IP验证相互作用,截短突变体确定结构域。
评估NEDD4L在DIC发病中的功能作用。
使用AAV9-shNedd4l敲低心肌细胞NEDD4L,DOX处理建立DIC模型,检测心功能、心肌损伤标志物和组织学变化。
验证NEDD4L敲低对DOX诱导的铁死亡和凋亡的抑制作用。
检测GPX4表达、Fe2+、MDA、TEM线粒体形态、凋亡相关蛋白及TUNEL染色;体外用siNedd4l敲低后检测ROS、脂质ROS、Fe2+、MDA、凋亡。
阐明NEDD4L对GPX4泛素化及降解的具体机制。
在HEK293T细胞中过表达NEDD4L或C943A突变体检测GPX4稳定性及泛素化;在H9C2细胞和心肌组织中敲低NEDD4L后检测GPX4泛素化类型。
证明NEDD4L通过抑制GPX4促进铁死亡和凋亡。
同时敲低NEDD4L和GPX4,检测铁死亡标志物(ROS、脂质ROS、Fe2+、MDA)和凋亡相关蛋白及流式凋亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 阿霉素 | MCE | HY-15142 |
| Trolox | MCE | HY-101445 | |
| Z-VAD-FMK | MCE | HY-16658B | |
| Ferrostatin-1 | MCE | HY-100579 | |
| MG132 | MCE | HY-13259 | |
| 氯喹 | MCE | HY-17589 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | APExBIO | K1018 |
| Western blot | GPX4抗体 | Zhengneng | R381958 |
| Bcl2抗体 | Immunoway | YM8319 | |
| Bax抗体 | Immunoway | YM8175 | |
| Caspase3抗体 | Immunoway | YT0656 | |
| Cleaved Caspase3抗体 | Immunoway | YC0006 | |
| 免疫沉淀 | 泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 43124 |
| Flag抗体 | Cell Signaling Technology | 70586 | |
| Myc抗体 | Cell Signaling Technology | 2276 | |
| 免疫荧光 | DAPI | Cell Signaling Technology | 4083S |
| 免疫沉淀 | K48连接特异性多聚泛素抗体 | Abclonal | A3606 |
| K63连接特异性多聚泛素抗体 | Abcam | ab179434 | |
| Western blot | NEDD4L抗体 | Proteintech | 13690-1-AP |
| β-微管蛋白抗体 | Proteintech | 66240-1-Ig | |
| 脂质过氧化检测 | BODIPY™ 581/591 C11 | Thermo Fisher Scientific | D3861 |
| 铁离子检测 | FerroOrange | Dojindo | F374 |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Beyotime | S0033S |
| MDA检测 | MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131S |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Lianke | AT101 |
| 心肌损伤标志物检测 | CK-MB ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0355 |
| LDH ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0419 | |
| 铁含量检测 | 铁检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K773-M |
| 免疫荧光 | cTnT抗体 | Sigma-Aldrich | SAB5702554 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | -- | |
| BCA定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0011 |
| 透射电镜 | 电镜固定液 | Servicebio | G1102 |
| 免疫沉淀 | Protein A/G Plus-琼脂糖 | Santa Cruz | sc-2003 |
| 蛋白电泳 | 凝胶电泳仪 | Bio-Rad | -- |
| 超声心动图 | Vevo 2100成像系统 | FUJIFILM VisualSonics | -- |
| MyLabOmegaVet成像系统 | Esaote | 24.00.13 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | H9C2和HEK293T细胞培养条件(DMEM+10%FBS,37°C,5%CO2);DOX处理浓度2 μM,时间24小时;siRNA转染效率(siNedd4l-2,siGpx4-1)。 阅读提示:4.2 Cell Culture and Treatment; 4.4 Transfection of Small Interfering RNA (siRNA) and Plasmid |
| 动物模型 | C57BL/6小鼠(6-8周龄);DOX单次腹腔注射15 mg/kg;AAV9-shNedd4l尾静脉注射剂量2×10^12颗粒,注射后2周再给DOX;实验分组(SAL+AAV9-NC,DOX+AAV9-NC,DOX+AAV9-shNedd4l) 阅读提示:4.8 Animals; 4.9 Adenovirus and Adeno-Associated Virus; Figure 2A |
| 泛素化检测 | MG132(10 μM)和CQ(10 μM)预处理30分钟;CHX(10 μM)处理时间点;免疫沉淀用抗GPX4抗体,检测总、K48、K63连接泛素化。 阅读提示:Figure 1A-C; 4.18 Immunoblots (IBs) and Immunoprecipitation (IP) |
| 功能验证 | siNedd4l和siGpx4共处理,DOX 2 μM处理24小时;检测ROS(DCFH-DA 5 μM)、脂质ROS(C11-BODIPY 5 μM)、Fe2+(FerroOrange 1 μM)、MDA;凋亡检测(Annexin V-FITC/PI)。 阅读提示:4.5 Ferrous Iron, Lipid Peroxidation, and ROS Detection; 4.6 Malondialdehyde (MDA) Detection; 4.7 Apoptosis Detection; Figure 6 |
| 统计分析 | 数据以均值±标准差表示;两组比较用Student's t检验,多组比较用单因素方差分析;p<0.05为显著。 阅读提示:4.19 Statistical Analysis |