索拉非尼诱导心脏毒性的机制:内质网应激诱导ATF3上调,导致NDUFS1表达下调和线粒体功能障碍。

Mechanisms of sorafenib-induced cardiotoxicity: ER stress induces upregulation of ATF3, leading to downregulation of NDUFS1 expression and mitochondrial dysfunction.

作者信息Ming Yan, Cheng Peng, Xueyan Lang, Yilan Li, Yao Zhang
PMID40880646
发布时间2025-08-13
DOI10.3389/fphar.2025.1593290

实验完整度

包含体内小鼠模型、体外H9C2细胞实验、转录组学、蛋白质组学及机制验证(ChIP-qPCR、siRNA敲低)等多个独立证据层级,并进行了功能与机制验证。

主要模型

C57BL/6小鼠 H9C2大鼠心肌细胞系 人原代心肌细胞(GSE146096数据集)

重点核对

索拉非尼给药剂量:30 mg/kg/天,腹腔注射,持续14天 体外处理浓度:5 μM索拉非尼,处理48小时,对照组为0.1 nM DMSO PERK抑制剂GSK2606414浓度:1 μM,与索拉非尼共处理 动物分组:对照组与治疗组,每组n=3 ATF3敲低:siRNA转染,序列见补充表S3

摘要

背景:索拉非尼是一种广泛使用的酪氨酸激酶抑制剂(TKI),与心脏毒性效应相关;然而,这种毒性的确切分子基础仍未完全阐明。本研究探讨了索拉非尼对心肌细胞的影响,重点关注内质网(ER)应激信号传导,特别是PERK-eIF2α-ATF4通路及其下游网络。方法:为阐明这些机制,我们采用了综合方法,整合了体内大鼠模型、H9C2细胞实验、转录组和蛋白质组分析以及生化验证技术。结果:我们的研究表明,索拉非尼通过诱导心肌细胞中的内质网应激来损害心脏功能,从而激活PERK-eIF2α-ATF4通路,导致线粒体损伤和细胞凋亡。这些结果得到了Western blot分析和显微成像的支持,并在使用内质网应激抑制剂GSK2606414治疗后显著减轻。转录组数据强调激活转录因子3(ATF3)是处理后最显著诱导的基因。进一步富集分析确定了几个相关通路,而RT-PCR和免疫印迹证实了H9C2细胞中ATF3的上调。蛋白质组筛选揭示NDUFS1是潜在的下游效应分子。通过siRNA沉默ATF3部分恢复了线粒体功能,表明ATF3对NDUFS1的负调控作用导致索拉非尼诱导的线粒体损伤。结论:总的来说,这些结果揭示了一个关键的信号级联——PERK/eIF2α/ATF4/ATF3/NDUFS1——参与索拉非尼介导的心脏毒性,并指出调节ATF3是预防或减少该药物引起的心脏损伤的有希望的靶点。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
索拉非尼诱导心脏毒性的分子机制是什么,特别是内质网应激信号通路及其下游网络的作用。
核心机制
索拉非尼诱导内质网应激,激活PERK-eIF2α-ATF4通路,上调ATF3;ATF3结合NDUFS1启动子并抑制其表达,导致线粒体复合物I活性降低、ATP产生减少、ROS升高,进而诱发心肌细胞凋亡。
主要证据
通过体内小鼠模型、体外H9C2细胞实验、转录组分析(GSE146096)和蛋白质组学鉴定出ATF3和NDUFS1,并通过ChIP-qPCR验证ATF3与NDUFS1启动子的结合,siRNA敲低ATF3部分恢复线粒体功能。
研究意义
揭示了PERK/eIF2α/ATF4/ATF3/NDUFS1信号级联在索拉非尼介导心脏毒性中的作用,提出ATF3调节可作为预防或减少该药物引起的心脏损伤的潜在靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

体内动物模型建立

验证索拉非尼在体内是否诱导心脏功能障碍和心肌损伤。

C57BL/6小鼠腹腔注射索拉非尼(30 mg/kg/天,14天)或溶剂对照,通过超声心动图评估心功能,苏木精-伊红染色观察心肌组织学变化。

2

体外细胞活力与凋亡分析

评估索拉非尼对心肌细胞活力与凋亡的影响。

H9C2细胞用5μM索拉非尼处理48小时,通过calcein AM/PI双重染色、CCK-8检测细胞活力,Western blot检测cleaved caspase-9,Annexin V/PI染色评估凋亡。

3

内质网应激通路验证

验证索拉非尼是否激活PERK-eIF2α-ATF4通路,以及抑制该通路是否能减轻心肌细胞损伤。

Western blot和免疫荧光检测PERK、eIF2α磷酸化及GRP78、ATF4表达;用PERK抑制剂GSK2606414共处理,观察对细胞活力和凋亡的影响。

4

转录组学分析与验证

鉴定索拉非尼处理后的差异表达基因,尤其是内质网应激相关基因。

分析GSE146096数据集(人原代心肌细胞,索拉非尼处理)的转录组数据,筛选DEGs,进行GO、KEGG和GSEA富集分析;在H9C2细胞中通过RT-qPCR和Western blot验证ATF3 mRNA和蛋白表达上调。

5

蛋白质组学分析与下游靶点鉴定

确定ATF3下游靶蛋白,并验证ATF3对NDUFS1的调控作用。

对索拉非尼处理的细胞进行蛋白质组学分析,鉴定差异表达蛋白,重点关注NDUFS1;通过JASPAR预测结合位点,并用ChIP-qPCR验证ATF3与NDUFS1启动子结合。

6

线粒体功能与氧化应激评估

评估ATF3敲低对索拉非尼诱导的线粒体功能障碍和氧化应激的影响。

在H9C2细胞中敲低ATF3,检测线粒体复合物I活性、ATP水平、线粒体膜电位(JC-1)、线粒体ROS(MitoSOX)和细胞内ROS(DCFH-DA)及超氧阴离子(DHE)。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
索拉非尼MedChemExpress LLCHY-10201
达尔伯克改良伊格尔培养基GIBCO--
胎牛血清GIBCO--
GSK2606414MedChemExpress--
Calcein AM/PI双染色试剂盒ElabscienceE-CK-A354
细胞计数试剂盒-8BiosharpBS350A
RIPA裂解液(含蛋白酶抑制剂)BeyotimeP0013B
BCA蛋白定量试剂盒BeyotimeP0012
PVDF膜Millipore--
Cleaved caspase-9 p35 (D315)抗体ImmunowayYC0014
P-PERK抗体WanleibioWL05295
PERK抗体WanleibioWL03378
EIF2S1 (P-eIF2α)抗体Abcamab32157
eIF2α抗体WanleibioWL01909
GRP78/BiP抗体WanleibioWL03157
ATF-4抗体WanleibioWL02330
GAPDH抗体Abcamab181602
ATF-3抗体ImmunowayYT0387
cleaved caspase-3抗体WanleibioWL01992
HRP标记二抗ImmunowayYT3017
ECL发光检测系统Tanon5100
Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒Seven BiotechSC123
TRIzol试剂Invitrogen--
Transcriptor第一链cDNA合成试剂盒Roche--
SYBR Green I预混液Roche--
CFX96 Touch实时荧光定量PCR检测系统Bio-Rad--
MitoTracker Green线粒体绿色荧光探针Beyotime Institute of Biotechnology--
ER-Tracker Red内质网红色荧光探针Beyotime Institute of Biotechnology--
ChIP试剂盒BersinBioBes5001
ATF3抗体Abcamab207434
Lipofectamine 3000转染试剂Invitrogen--
线粒体复合物I活性检测试剂盒Solarbio--
增强型ATP检测试剂盒Beyotime BiotechnologyS0027
JC-1试剂盒BeyotimeC2006
MitoSOX Red线粒体超氧化物指示剂MCE1003197-00-9
DCFH-DA荧光探针BeyotimeS0033S
二氢乙锭Beyotime Institute of Biotechnology--
H9C2大鼠心肌细胞系ATCCCRL-1446
GE Vivid E9 ML6-15-D线阵探头GE--
Leica DMi8光学显微镜Leica--
奥林巴斯显微镜Olympus--
卡尔蔡司共聚焦显微镜Carl Zeiss--
DMi8自动细胞成像系统Leica--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物模型
索拉非尼剂量、给药途径、给药持续时间、溶剂组成、动物品系、性别、周龄、每组样本量、饲养环境
阅读提示:见Methods 2.1 Animals and animal models
体外细胞实验
细胞系、培养条件(DMEM、10% FBS、5% CO2)、血清饥饿处理(0.5% FBS 12小时)、索拉非尼浓度(5μM)、处理时间(48小时)、对照组(0.1 nM DMSO)、PERK抑制剂浓度(1μM)
阅读提示:见Methods 2.4 Culture and cell line maintenance;2.5 Calcein AM/PI dual staining;2.6 Cell viability assay
分子表达检测
Western blot抗体及稀释比例、上样量、电泳条件、转膜条件;RT-qPCR引物序列、内参基因(GAPDH)、分析方法(2^-ΔΔCt)
阅读提示:见Methods 2.7 Western blotting;2.11 RealTime-qPCR
转录组分析
数据集GSE146096的具体分组(A、B、D、E)及样本量、差异表达阈值、统计方法(DESeq2)
阅读提示:见Methods 2.22 Data acquisition;2.23 Bioinformatics analysis
ATF3功能验证
siRNA序列、转染试剂(Lipofectamine 3000)、ATF3敲低效率、ChIP-qPCR条件和引物
阅读提示:见Methods 2.14 ChIP-qPCR;2.15 siRNA transfection