评估Ang对UC小鼠的治疗效果
验证Ang是否减轻DSS和TNBS诱导的结肠炎
在DSS和TNBS诱导的UC模型小鼠中给予Ang(低、中、高剂量),检测体重、DAI评分、结肠长度、炎症因子水平和组织病理学变化。
Angelicin: A promising tricyclic aromatic agent for ulcerative colitis through cysteine-mediated proliferation of intestinal epithelial cells.
涉及DSS/TNBS小鼠模型、细胞实验、微生物组分析、代谢组学、蛋白质组学、分子生物学验证等多个独立证据层级,并包含功能及机制验证。
C57BL/6小鼠DSS诱导UC模型 C57BL/6小鼠TNBS诱导UC模型 IEC-6大鼠肠隐窝细胞 HT-29人结肠癌细胞
Ang给药剂量:低3.15mg/kg、中6.3mg/kg、高12.6mg/kg,连续9天灌胃 DSS模型:3% DSS溶于饮用水7天,每两天更换新鲜溶液 TNBS模型:5% TNBS溶液(50%乙醇配制)直肠给药,剂量0.2mL/100g 细胞实验:IEC-6和HT-29细胞,Ang浓度50、100、200μM,处理24小时 FMT实验:Abx预处理雄性C57BL/6小鼠,接受来自对照或Ang处理的DSS模型供体的粪便物质,每次200μL,每日两次灌胃
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Ang是否减轻DSS和TNBS诱导的结肠炎
在DSS和TNBS诱导的UC模型小鼠中给予Ang(低、中、高剂量),检测体重、DAI评分、结肠长度、炎症因子水平和组织病理学变化。
检测Ang是否恢复UC小鼠的肠黏膜屏障功能
通过FITC-dextran通透性实验、阿尔辛蓝染色、Western blot、IHC和IF染色评估肠道屏障功能相关蛋白(MUC2、ZO-1、occludin、claudin-1)的表达。
探究Ang是否恢复UC相关的肠道菌群失调
利用16S rRNA测序分析粪便微生物组成,结合生态网络分析和体外细菌培养,评估Ang对益生菌的影响。
确定Ang的作用是否依赖于肠道菌群
通过抗生素清除肠道菌群后进行FMT或直接给予Ang,评估Ang对结肠炎的影响。
探索Ang是否通过调节氧化应激和GSH合成来保护IECs
通过蛋白质组学、代谢组学、ROS检测和GSH测量,检测氧化应激相关蛋白和代谢物变化,并利用NAC、BSO等干预验证GSH依赖的机制。
探究Ang是否通过促进核糖体生物发生和蛋白质翻译增强细胞增殖
使用蛋白质组学分析核糖体生物发生相关蛋白,通过CETSA、分子对接和Co-IP验证Ang与GRSF1的结合,并通过嘌呤霉素标记实验检测蛋白质翻译。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型诱导 | 葡聚糖硫酸钠 | MP Biomedicals | -- |
| Ang治疗 | 欧前胡素 | Chengdu Alfa Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 阳性对照药物 | 柳氮磺胺吡啶 | Shanghai SPH Sine Pharmaceutical Laboratories Co., Ltd. | -- |
| 抗生素清除肠道菌群 | 新霉素 | Macklin | -- |
| 甲硝唑 | Macklin | -- | |
| 万古霉素 | Macklin | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Beijing Nuobeier Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| 抗生素-抗真菌溶液 | -- | -- | |
| 细胞因子检测 | ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- | |
| 细胞分级分离试剂盒 | Abcam | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 抗MUC2抗体 | Abcam | ab272692 | |
| 抗ZO-1抗体 | Abcam | ab190085 | |
| 抗occludin抗体 | Abcam | ab216327 | |
| 抗claudin-1抗体 | Abcam | ab307692 | |
| 抗HIF-1α抗体 | Proteintech | 20960-1-AP | |
| 抗GRSF1抗体 | Servicebio | GB112188-100 | |
| 抗GCLM抗体 | Servicebio | GB111827-100 | |
| 抗NRF2抗体 | Servicebio | GB11351-100 | |
| 抗NQO1抗体 | Servicebio | GB11282-100 | |
| 抗HMOX1抗体 | Proteintech | 10701-1-AP | |
| 抗乙酰化赖氨酸抗体 | Cell Signaling Technology | 9441S | |
| 抗Srx抗体 | Beijing Biodragon Immunotechnologies Co., Ltd. | BD-PN4814 | |
| 抗Prx1抗体 | Beijing Biodragon Immunotechnologies Co., Ltd. | BD-PT3874 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118S14 | |
| 兔IgG(H+L)/HRP二抗 | ZSGB-BIO | ZB-2301 | |
| 硝化纤维素膜 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Tanon-4800多功能成像系统 | Tanon Science & Technology Co., Ltd. | -- | |
| 组织染色 | H&E染色试剂盒 | -- | -- |
| 阿尔辛蓝8GX | Sigma-Aldrich | -- | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Beyotime | -- |
| 吐温20 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | -- | |
| Alexa Fluor 488偶联二抗 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- | |
| Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- | |
| Leica SP8共聚焦显微镜 | Leica Microsystems | -- | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A+G磁珠 | Beyotime | -- |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Abcam | -- |
| 代谢物提取 | Eppendorf真空浓缩仪 | Eppendorf | -- |
| 二甲基亚砜 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- | |
| 氧化应激检测 | ROS检测试剂盒 | Abbkine | -- |
| GSH检测 | GSH检测试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| MDA检测 | MDA检测试剂盒 | Solabio | -- |
| 蛋白质翻译检测 | 嘌呤霉素 | MedChemExpress | -- |
| 结晶紫染色 | 结晶紫 | Servicebio | -- |
| 肝肾功能检测 | 全自动生化分析仪 | Hitachi | 7600 |
| 肠道菌群分析 | E.Z.N.A.®土壤DNA提取试剂盒 | Omega Bio-Tek, Inc. | -- |
| NEXTFLEX文库制备试剂盒 | Illumina, Inc. | -- | |
| 肠道通透性检测 | FITC-葡聚糖 | -- | -- |
| 代谢组学检测 | 超高效液相色谱-串联质谱系统 | Waters Corporation | -- |
| TripleTOF 5600质谱仪 | AB Sciex | -- | |
| 蛋白质组学 | Q Exactive质谱仪 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- |
| Cys检测 | Cys检测试剂盒 | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | -- |
| γ-H2AX检测 | ADANTI抗体 | ADANTI | -- |
| 药物处理 | N-乙酰半胱氨酸 | -- | -- |
| 丁硫氨酸亚砜亚胺 | -- | -- | |
| 谷胱甘肽乙酯 | -- | -- | |
| 脂氧素 | -- | -- | |
| 铁抑素 | -- | -- | |
| MitoTEMPO | -- | -- | |
| 奥拉帕尼 | -- | -- | |
| CX-5461 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、周龄、来源;DSS给药浓度(3%)和时长(7天);TNBS给药浓度(5%)和剂量(0.2mL/100g);Ang剂量(3.15、6.3、12.6 mg/kg)及给药途径(灌胃);SASP剂量(0.3 g/kg) 阅读提示:Materials and methods 2.1.1, 2.1.2, Results 3.1 及图1图注 |
| 细胞实验 | 细胞系(IEC-6、HT-29)及来源;培养条件(DMEM、10% FBS、37°C、5% CO2);Ang处理浓度(50、100、200 μM)和时间(24h);CCK-8细胞数(1×10^4/孔)和检测波长(460nm) 阅读提示:Materials and methods 2.1.2, 2.12, Results 3.1 及图1图注 |
| 肠道菌群分析 | 粪便DNA提取试剂盒(E.Z.N.A. Soil DNA kit);16S rRNA V3-V4引物(338F/806R)和PCR条件;测序平台(MiSeq PE300);α/β多样性分析参数 阅读提示:Materials and methods 2.19, Results 3.3 及图3图注 |
| FMT实验 | 抗生素混合物剂量(氨苄0.2g/L、新霉素0.2g/L、甲硝唑0.2g/L、万古霉素0.1g/L)及处理时间(7天);供体粪便来源和灌胃剂量(1g/6.5mL PBS,200μL,每天两次) 阅读提示:Materials and methods 2.1.1及结果3.4,图4图注 |
| 分子机制验证 | CETSA中Ang浓度(200μM)和孵育时间(1h);分子对接所用蛋白结构(PDB 4QU6);Co-IP步骤;嘌呤霉素浓度(1mg/mL)和脉冲时间(10min) 阅读提示:Materials and methods 2.9, 2.10, 2.11, 2.16, Results 3.7 及图7图注 |