临床样本检测
评估SFI对脓毒症患者肠损伤标志物水平的影响。
收集脓毒症患者血浆,其中20例接受SFI治疗(50 mL,每6小时静脉输注,持续5天),21例未接受。检测血浆D-乳酸和I-FABP水平。
Shenfu injection promotes self-renewal of intestinal stem cells in sepsis-induced intestinal injury via inducing ATF4 expression.
包含患者血浆标志物分析、小鼠CLP模型,涉及表型评估、功能验证(增殖迁移)、机制验证(ATF4-Sox9通路、ERK1/2)及16S rRNA菌群测序等独立证据层级。
CLP小鼠模型(C57BL/6J,雄性,8-10周龄) 脓毒症患者血浆样本(41例,其中20例接受SFI)
SFI剂量:低剂量(LSF)10 mL/kg,高剂量(HSF)20 mL/kg,腹腔注射,CLP术后1小时 CLP造模细节:盲肠结扎穿刺,20号针头,距盲肠末端15 mm结扎 观察时间:CLP术后48小时取样(部分细胞因子检测为16小时) 动物分组:sham、CLP、CLP+LSF、CLP+HSF,每组n=6 患者纳入标准:年龄18-90岁,符合Sepsis 3.0定义,住院>24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估SFI对脓毒症患者肠损伤标志物水平的影响。
收集脓毒症患者血浆,其中20例接受SFI治疗(50 mL,每6小时静脉输注,持续5天),21例未接受。检测血浆D-乳酸和I-FABP水平。
建立CLP脓毒症小鼠模型,并评估SFI(低/高剂量)对肠损伤的保护作用。
对C57BL/6J小鼠施行CLP手术诱导脓毒症,术后1小时腹腔注射低剂量或高剂量SFI,48小时后收集肠道、血液和粪便样本。通过H&E染色、DAO和乳酸水平检测评估肠损伤程度。
评估SFI对脓毒症小鼠肠道隐窝细胞增殖和肠上皮细胞迁移的影响。
通过EdU标记实验,分别在处死前或CLP前注射EdU,利用免疫荧光共染(EdU/OLFM4/EpCAM)检测隐窝增殖和迁移情况。
探究SFI促进隐窝干细胞自我更新的分子机制。
通过免疫荧光共染(ATF4/OLFM4)和Western blot检测肠道组织中ATF4、Sox9和OLFM4蛋白表达水平。
评估SFI对脓毒症小鼠肠道屏障功能和上皮细胞凋亡的影响。
通过免疫组化(IHC)检测紧密连接蛋白ZO-1和Occludin的表达,并通过TUNEL染色检测肠道组织凋亡情况。
评估SFI对脓毒症小鼠系统性及局部炎症反应的影响。
通过ELISA检测血浆中IL-1β、IL-6、TNF-α水平,通过RT-qPCR检测肠道组织中细胞因子mRNA表达,并通过Western blot检测磷酸化ERK1/2水平。
评估SFI对脓毒症小鼠肠道菌群组成和多样性的影响。
提取粪便DNA,进行16S rRNA基因测序(Illumina NovaSeq6000),分析Alpha多样性、Beta多样性及差异菌群。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 患者血浆D-乳酸检测 | D-乳酸检测试剂盒 | Abcam | ab83429 |
| 参附注射液 | 参附注射液 | Huarun Sanjiu Pharmaceutical Co., Ltd. | 221101AK01 |
| 免疫荧光共染 | 抗EpCAM抗体 | Abcam | ab221552 |
| 抗OLFM4抗体 | CST | 39141 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific | #89901 |
| PVDF膜 | BioRad | 162-0177 | |
| 抗ATF4抗体 | CST | 11815 | |
| 抗Sox9抗体 | CST | 3579 | |
| 抗磷酸化ERK1/2抗体 | CST | 9101 | |
| HRP底物 | Millipore | WBLUF0500 | |
| IHC染色 | 抗ZO-1抗体 | Abcam | ab221547 |
| 抗Occludin抗体 | Abcam | ab216327 | |
| 抗裂解caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| TUNEL染色 | 蛋白酶K | Vazyme | A113-03 |
| 重组TdT酶 | Vazyme | -- | |
| ELISA | I-FABP ELISA试剂盒 | CUSABIO Technology | CSB-E08024h |
| L-乳酸检测试剂盒 | Eton Bioscience | 1200011002 | |
| DAO检测试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0412c | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Vazyme | R401 |
| RT-qPCR | HiScript III逆转录预混液 | Vazyme | R323 |
| ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q711 | |
| Gen5酶标仪 | BioTek | -- | |
| 16S rRNA测序 | Illumina NovaSeq6000测序仪 | Illumina Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本收集 | 患者纳入标准(年龄18-90岁,Sepsis 3.0,住院>24小时)、SFI给药方案(50 mL静脉输注,每6小时一次,持续5天)、血浆采集时间(诊断第5天) 阅读提示:Methods 2.1 Patients |
| 动物模型建立 | 小鼠品系(C57BL/6J,雄性,8-10周龄)、CLP手术细节(20号针头,盲肠结扎距末端15 mm)、SFI剂量(LSF 10 mL/kg, HSF 20 mL/kg)及给药时间(CLP后1小时) 阅读提示:Methods 2.3 Animals |
| 隐窝增殖和迁移检测 | EdU注射时间(处死前90分钟或CLP前)、免疫荧光染色条件(OLFM4, EpCAM抗体稀释度) 阅读提示:Methods 2.4 Immunofluorescent co-staining of EdU/OLFM4/EpCAM; Figure legends 2A-D |
| 机制研究 | Western blot抗体(ATF4, Sox9, OLFM4)、蛋白提取和裂解方法(RIPA缓冲液)、内参(GAPDH) 阅读提示:Methods 2.6 Western blotting; Figure 3 |
| 炎症检测 | ELISA检测血浆细胞因子(IL-1β, IL-6, TNF-α)、RT-qPCR检测组织mRNA、Western blot检测p-ERK1/2 阅读提示:Methods 2.10, 2.11, 2.6; Figure 5 |
| 肠道菌群分析 | 粪便样本来源(盲肠)、16S rRNA测序平台(NovaSeq6000)、分析软件(Uparse, Cutadapt)、LEfSe阈值(LDA>4) 阅读提示:Methods 2.12 16S rRNA gene sequencing; Figure 6, 7 |