生成K296E敲入小鼠
建立携带K296E突变的敲入小鼠模型以研究突变体在体内的致病机制。
使用CRISPR/Cas9基因编辑技术将K296E突变引入小鼠基因组,生成三个品系(K29-1、K29-4、K29-21),并通过测序确认突变。
Aggregation of the Constitutively Active K296E Rhodopsin Mutant Contributes to Retinal Degeneration.
包含CRISPR/Cas9敲入小鼠模型、体外FRET聚集检测、免疫组化、TUNEL凋亡检测等多层级证据,且进行了功能验证(ERG)和机制验证(聚集与细胞死亡关系)。
K296E视紫红质敲入小鼠(RhoK296E/+和RhoK296E) HEK293T/17细胞 G90D视紫红质转基因小鼠(RhoTgG90D)
小鼠品系:C57Bl/6J背景,RhoK296E敲入小鼠由CRISPR/Cas9生成,K29-1、K29-4、K29-21三个品系 感光细胞计数:H&E染色后计数外核层细胞核数量 ERG评估:1月龄小鼠暗适应后记录暗视和明视ERG反应 蛋白聚集检测:PROTEOSTAT标记视网膜切片和FRET分析(DM敏感和非敏感信号) 细胞凋亡检测:TUNEL染色与PROTEOSTAT共标记
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立携带K296E突变的敲入小鼠模型以研究突变体在体内的致病机制。
使用CRISPR/Cas9基因编辑技术将K296E突变引入小鼠基因组,生成三个品系(K29-1、K29-4、K29-21),并通过测序确认突变。
量化K296E敲入小鼠中感光细胞随时间丢失的程度和速率。
对H&E染色的视网膜切片计数外核层细胞核数量,并进行ERG检查评估视功能。
确定K296E突变体在感光细胞中的定位是否异常以及是否发生聚集。
使用免疫组化检测视紫红质定位,使用PROTEOSTAT标记检测蛋白聚集,并通过共聚焦显微镜观察。
评估PROTEOSTAT阳性聚集与感光细胞死亡(TUNEL阳性)之间的时间关联。
定量不同年龄小鼠中PROTEOSTAT和TUNEL阳性细胞核数量,并分析共标记比例。
验证K296E突变在不同物种视紫红质背景下的聚集倾向,并评估突变体与WT的相互作用。
在HEK293细胞中共表达YFP和mTq2标记的野生型或突变体视紫红质,通过FRET检测DM敏感和DM非敏感信号。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 小鼠基因编辑 | Cas9核酸酶 | PNA Bio | -- |
| sgRNA | PNA Bio | -- | |
| 单链DNA替换寡核苷酸 | Integrated DNA Technologies | -- | |
| 测序 | MiSeq测序系统 | Illumina | -- |
| 组织学分析 | Axio Scan.Z1玻片扫描仪 | Carl Zeiss Microscopy | -- |
| 日立HV-F203相机 | Hitachi | -- | |
| 徕卡DME复合显微镜 | Leica Microsystems | -- | |
| EC3数字相机 | Leica Microsystems | -- | |
| 数据分析 | Prism 10 | GraphPad Software | -- |
| 电生理检查 | Celeris啮齿动物ERG系统 | Diagnosys | -- |
| 基因表达分析 | LightCycler 96实时荧光定量PCR系统 | Roche Diagnostics | -- |
| 蛋白质印迹 | Novex 4%-12% Tris-甘氨酸凝胶 | Invitrogen | -- |
| Odyssey Fc成像系统 | LI-COR Biosciences | -- | |
| anti-1D4抗体 | -- | -- | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| GNAT1抗体 | Gene Tex Inc. | GTX105960 | |
| IRDye 800CW驴抗小鼠二抗 | LI-COR Biosciences | 926-32212 | |
| IRDye 680LT驴抗兔二抗 | LI-COR Biosciences | 925-68023 | |
| 免疫组织化学 | anti-4D2抗体 | MilliporeSigma | MABN15 |
| Alexa Fluor 647山羊抗小鼠二抗 | Thermo Fisher Scientific | A21237 | |
| anti-PRPH2一抗 | Proteintech | 18109-1-AP | |
| anti-ATP1A3一抗 | Proteintech | 10868-1-AP | |
| Alexa Fluor 568山羊抗兔二抗 | Thermo Fisher Scientific | A-11011 | |
| 凋亡检测 | 一步法TUNEL原位凋亡试剂盒 | Elabscience | E-CK-A324 |
| 蛋白聚集检测 | PROTEOSTAT聚集体检测试剂盒 | Enzo Life Sciences | -- |
| 显微镜检查 | 奥林巴斯FV1200 IX83激光扫描共聚焦显微镜 | Evident Scientific | -- |
| UPlanXApo 40x/1.40 NA油镜 | Olympus | -- | |
| UPLXAPO 100x/1.45 NA物镜 | Olympus | -- | |
| 切片封片 | DAPI Fluoromount-G封片剂 | Southern Biotech | -- |
| ProLong Glass抗淬灭封片剂(含NucBlue染料) | Invitrogen | -- | |
| 图像处理 | Huygens Essential 23.10软件 | Scientific Volume Imaging | -- |
| 图像分析 | ImageJ | -- | 版本1.53n |
| Fiji | -- | 版本2.1.0/1.53c | |
| 细胞培养与转染 | HEK293T/17细胞 | American Type Culture Collection | CRL-11268 |
| 体外聚集检测 | FluoroMax-4或FluoroMax Plus荧光分光光度计 | Horiba Jobin Yvon | -- |
| 正十二烷基-β-D-麦芽糖苷 | -- | -- | |
| 定点突变 | QuickChange II定点突变试剂盒 | Agilent Technologies | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | K296E敲入小鼠的构建:C57Bl/6J背景,CRISPR/Cas9靶向,三个品系; 阅读提示:Materials and Methods 2.1 |
| 感光细胞计数 | H&E染色切片的外核层细胞核计数方法; 阅读提示:Materials and Methods 2.2 |
| ERG | 小鼠年龄(1月龄)、暗适应条件、刺激强度范围 阅读提示:Materials and Methods 2.3 |
| 免疫组化与共聚焦 | 使用抗4D2抗体、PROTEOSTAT试剂盒、切片厚度、抗原修复步骤 阅读提示:Materials and Methods 2.5 |
| 体外FRET | HEK293T/17细胞共转染YFP和mTq2标记的视紫红质,FRET测量和DM处理 阅读提示:Materials and Methods 2.6 |