临床样本分析
比较SLE患者与健康对照中咽峡炎链球菌丰度、NK细胞数量/功能及细胞因子水平,并分析其与疾病活动度的相关性。
收集SLE患者和HC的粪便、血液和血清样本,通过qPCR检测咽峡炎链球菌丰度,流式细胞术检测NK细胞亚群和活化标志物,ELISA检测血清细胞因子。
Extracellular Vesicles Derived From Streptococcus anginosus Aggravate Lupus Nephritis by Triggering TLR2-MyD88-NF-κB Signalling in NK Cells.
包含患者样本分析(SLE vs HC)、体外NK细胞功能实验、机制验证(TLR2-MyD88-NF-κB通路)及MRL/lpr小鼠体内模型,多层证据验证SA-EVs的作用。
人原代NK细胞 MRL/lpr狼疮小鼠模型 肾小管上皮细胞系HK-2和RPTEC/TERT1 SLE患者及健康对照外周血和粪便样本
SLE患者(n=54)和健康对照(n=43)的粪便、血液和血清样本 SA-EVs口服剂量为20 µg(溶于100 µL PBS),每3天一次,持续4周 NK细胞与靶细胞共培养的效靶比(0.5:1, 1:1, 2:1, 4:1)及共培养时间4小时 TLR2抑制剂C29和MyD88抑制剂MyD88-IN-1的使用浓度(文中未明确说明) NK细胞耗竭使用抗NK1.1抗体(文中未明确说明剂量和方案)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较SLE患者与健康对照中咽峡炎链球菌丰度、NK细胞数量/功能及细胞因子水平,并分析其与疾病活动度的相关性。
收集SLE患者和HC的粪便、血液和血清样本,通过qPCR检测咽峡炎链球菌丰度,流式细胞术检测NK细胞亚群和活化标志物,ELISA检测血清细胞因子。
提取并表征咽峡炎链球菌来源的EVs(SA-EVs),并与唾液链球菌EVs(SS-EVs)进行比较,评估其物理特性和LTA含量。
从咽峡炎链球菌和唾液链球菌中提取EVs,通过TEM观察形态,NTA分析粒径,Western blot和ELISA检测LTA,DIA-MS分析肽谱。
评估SA-EVs对人原代NK细胞的活化作用,包括促炎因子产生、表面标志物变化和细胞毒性。
将人原代NK细胞与SA-EVs共培养,通过RT-qPCR和ELISA检测促炎因子mRNA和蛋白水平,流式细胞术检测活化标志物(CD25、CD69)和抑制性受体(NKG2A、TIM-3、TIGIT),以及细胞毒性实验。
验证SA-EVs通过TLR2-MyD88-NF-κB通路激活NK细胞。
通过免疫共沉淀验证LTA与TLR2结合,Western blot检测MyD88、磷酸化p65和IκBα水平,并使用TLR2、MyD88、TLR4、TLR7、TLR9抑制剂进行功能阻断实验。
评估口服SA-EVs对MRL/lpr狼疮小鼠疾病严重程度、肾脏病理和NK细胞活化的影响。
对MRL/lpr小鼠口服SA-EVs、SS-EVs或PBS,持续4周,监测生存率、体重、蛋白尿、血清肾功能指标和自身抗体,分析肾脏组织病理和免疫细胞浸润。
确定NK细胞和B细胞在SA-EVs诱导的小鼠死亡中的贡献。
使用抗NK1.1抗体或抗CD20抗体分别耗竭NK细胞或B细胞,观察SA-EVs处理后小鼠的生存期变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | BD BACTO脑心浸液肉汤 | BD Bioscience | 237500 |
| 流式分析 | 抗颗粒酶B-PE抗体 | BioLegend | 372208 |
| 抗人TNF-α-BV605抗体 | BioLegend | 502936 | |
| 抗人NKG2A-PE/Cyanine7抗体 | BioLegend | 375113 | |
| Western blot | 革兰氏阳性菌脂磷壁酸单克隆抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA1-7402 |
| 细胞标记 | 细胞染色DIL染料 | Thermo Fisher Scientific | D282 |
| 细胞刺激 | 细胞刺激混合物 | Thermo Fisher Scientific | 00-4970-03 |
| ELISA | 人IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H6156 |
| 人IL-17A ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H5812 | |
| 人IL-22 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H0106 | |
| 人TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H0109 | |
| 人颗粒酶B ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H1617 | |
| 人MIP-1α ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H6213 | |
| 人MCP-1 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H6005 | |
| 人CXCL8 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H6008 | |
| 小鼠MIP-1α ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0007 | |
| 细胞固定/透化 | BD Cytofix/Cytoperm固定/透化试剂盒 | BD Bioscience | 554714 |
| 流式分析 | 抗人TIM3-BV605抗体 | BD Bioscience | 569245 |
| 抗人TIGIT-BV421抗体 | BD Bioscience | 747844 | |
| 抗人CD69-PEcy7抗体 | BD Bioscience | 335792 | |
| 抗人CD25-PEcy7抗体 | BD Bioscience | 557741 | |
| 抗人CD56-APC抗体 | BD Bioscience | 341025 | |
| 抗人CD3-BV510抗体 | BD Bioscience | 564713 | |
| 抗人TLR2-PE抗体 | BioLegend | 392306 | |
| TLR4-PE抗体 | BioLegend | 312806 | |
| TLR6-PE抗体 | BioLegend | 334708 | |
| TLR7-PE抗体 | BioLegend | 376904 | |
| TLR9-PE抗体 | BioLegend | 394804 | |
| Western blot | 抗TLR2抗体 | Cell Signalling Technology | 12276T |
| 磷酸化P65抗体 | Cell Signalling Technology | 3033T | |
| P65抗体 | Cell Signalling Technology | 8242T | |
| IκBα抗体 | Cell Signalling Technology | 4812T | |
| 磷酸化IκBα抗体 | Cell Signalling Technology | 2859T | |
| MyD88抗体 | Cell Signalling Technology | 4283T | |
| β-肌动蛋白抗体 | Cell Signalling Technology | 4967S | |
| ELISA | 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Beyotime Biotechnology | PI326 |
| 小鼠IL-17A ELISA试剂盒 | Beyotime Biotechnology | PI545 | |
| 小鼠IL-22 ELISA试剂盒 | Beyotime Biotechnology | PI591 | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Beyotime Biotechnology | PT512 | |
| 小鼠IFN-β ELISA试剂盒 | Beyotime Biotechnology | PI568 | |
| 小鼠抗dsDNA抗体(总A+G+M)ELISA试剂盒 | Alpha Diagnostic | 5110 | |
| 小鼠抗核抗原(ANA/ENA)抗体(总A+G+M)ELISA试剂盒 | Alpha Diagnostic | 5210 | |
| LTA ELISA试剂盒 | CELL BIOLABS | AKR-5153 | |
| 药物处理 | TLR2抑制剂C29 | MedChemExpress | HY-100461 |
| TLR4抑制剂Stepharine | MedChemExpress | HY-N9347 | |
| TLR7抑制剂Enpatoran | MedChemExpress | HY-134581A | |
| TLR9抑制剂AT791 | MedChemExpress | HY-124603 | |
| MyD88抑制剂MyD88-IN-1 | MedChemExpress | HY-149992 | |
| 免疫荧光染色 | 抗小鼠Nephrin抗体 | R&D Systems | AF3159 |
| 山羊抗小鼠IgG抗体 | Thermo Fisher Scientific | A10524 | |
| C3抗体 | Novus | NB200-540 | |
| F4/80抗体 | Cell Signalling Technology | 30325T | |
| CD206抗体 | Cell Signalling Technology | 24595T | |
| NKp44抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-44850 | |
| NKp46抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-102860 | |
| TNF-α抗体 | Cell Signalling Technology | 11948T | |
| 活化caspase-3抗体 | Cell Signalling Technology | 9664T | |
| 细胞培养 | RPTEC/TERT1细胞 | ATCC | CRL-4031 |
| HK-2细胞 | ATCC | CRL-2190 | |
| DMEM:F12培养基 | Thermo Fisher Scientific | 10565018 | |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | A5256701 | |
| 青霉素/链霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15070063 | |
| 角质细胞无血清培养基试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 17005042 | |
| NK细胞分离 | MACS阴性选择分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-092-657 |
| NK细胞培养 | 完全NK培养基 | Nobimpex | -- |
| 白细胞介素-2 | Proleukin, Clinigen | -- | |
| 细胞毒性实验 | CellTracker CM-Dil染料 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Live/Dead可固定V500-Aqua死细胞染色试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 流式细胞术 | Fortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| BD Canto II流式细胞仪 | BD | -- | |
| 流式分析 | Multitest TM 6色TBNK细胞染色试剂盒 | BD | 662995 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本收集 | SLE患者(n=54)和HC(n=43);样本类型:粪便、血液、血清;排除标准:急性并发疾病、感染、近期使用益生菌或抗生素(一个月内);疾病活动评估时间:样本采集时 阅读提示:Methods 2.1 |
| 细菌丰度检测 | qPCR绝对菌落计数方法;S. anginosus丰度与SLEDAI和NK细胞计数的相关性 阅读提示:Results 3.1, Figure S1 |
| EVs提取和表征 | SA-EVs和SS-EVs的纯化方法(文中未明确说明);EVs粒径约100 nm;LTA浓度检测方法;口服后生物分布(20 µg,肾脏积累) 阅读提示:Methods 2.2, Results 3.2, Figure 2 |
| NK细胞活化实验 | NK细胞来源(SLE患者和健康供体buffy coats);NK细胞分离方法(MACS阴性选择);SA-EVs浓度(1 µg/mL);检测时间点(mRNA 24h, 蛋白48h);细胞毒性实验效靶比(0.5:1至4:1)及共培养时间(4h) 阅读提示:Methods 2.3, 2.4, Results 3.2 |
| 机制验证 | 免疫沉淀实验条件;Western blot检测MyD88, p-p65, p-IκBα;抑制剂浓度和时间(TLR2抑制剂C29, MyD88抑制剂MyD88-IN-1等,文中未明确说明) 阅读提示:Methods 2.2, Results 3.3, Figure 4 |
| 体内动物实验 | MRL/lpr小鼠品系;SA-EVs口服剂量(20 µg,100 µL PBS);给药频率(每3天一次);处理时间(4周);检测指标(蛋白尿、血清CRE/BUN/UA/UREA/自身抗体、组织学) 阅读提示:Results 3.4, Figure 5 |
| 免疫细胞耗竭实验 | 抗NK1.1抗体剂量和给药方案(文中未明确说明);抗CD20抗体剂量和给药方案(文中未明确说明);观察时间(40天) 阅读提示:Results 3.4, Figure 5h |