NRF2通过ME1维持氧化还原平衡,且NRF2抑制剂与维奈克拉在NPM1突变急性髓系白血病中协同作用

NRF2 maintains redox balance via ME1 and NRF2 inhibitor synergizes with venetoclax in NPM1-mutated acute myeloid leukemia.

作者信息Jiayuan Hu, Zihao Yuan, Yan Shu, Jun Ren, Jing Yang, Lisha Tang, Xingyu Wei, Yongcan Liu, Fangfang Jin, Qiaoling Xiao, Xinyi Chen, Nan Wu, Wen Zhao, Ziwei Li, Ling Zhang
PMID40533864
发布时间2025-06-18
DOI10.1186/s40170-025-00401-6

实验完整度

包含体外细胞模型、患者样本、CDX小鼠模型,以及功能验证和机制验证,如FTO调控NRF2、ChIP验证ME1为直接靶点。

主要模型

OCI-AML3细胞系(携带NPM1突变A型) OCI-AML2细胞系(NPM1野生型) NPM1突变AML患者原代白血病原始细胞 NOD/SCID小鼠CDX模型(OCI-AML3细胞)

重点核对

NRF2抑制剂ML385浓度(0, 10, 20 µM)及处理时间(72小时) 维奈克拉与ML385联合处理的剂量-反应矩阵及HSA协同评分(OCI-AML3和原代原始细胞) CDX小鼠模型中ML385(30 mg/kg)和维奈克拉(50 mg/kg)的给药剂量及频率 NPM1突变状态(NPM1-mA)及NRF2表达水平作为分层依据

摘要

背景:急性髓系白血病(AML)伴有核仁磷酸蛋白1(NPM1)突变代表了一种独特的白血病亚型。新兴证据表明,氧化还原代谢的调控有助于肿瘤发生,并揭示了抗肿瘤治疗中的代谢脆弱性。然而,活性氧(ROS)与抗氧化系统之间的氧化还原稳态在NPM1突变AML中的作用尚未完全阐明。方法:首先,利用RNA测序数据分析NPM1突变AML中ROS相关的代谢通路。使用流式细胞术(FCM)检测白血病细胞内的ROS和线粒体ROS水平。在公共数据库中分析核因子(红细胞衍生2)样2(NRF2)的表达,并通过定量实时PCR(qRT-PCR)、蛋白质印迹和免疫荧光在AML原代原始细胞和细胞系中进一步验证。接下来,通过RNA免疫沉淀(RIP)、甲基化RNA免疫沉淀(MeRIP)和挽救实验研究NRF2表达的机制。此外,通过生物信息学分析和染色质免疫沉淀(ChIP)实验确定了NRF2的下游靶基因。进一步,应用RNA干扰和NRF2抑制剂ML385探索NRF2在白血病中的作用。最后,使用FCM分析和蛋白质印迹研究ML385单独或与B细胞淋巴瘤2(BCL-2)抑制剂维奈克拉联合对AML细胞的抗白血病作用,并在细胞系来源异种移植(CDX)小鼠模型中进一步探索。结果:在本研究中,我们确定了NPM1突变白血病细胞中显著的ROS积累。同时,在NPM1突变AML细胞中观察到NRF2表达升高及其核定位。高NRF2表达水平至少部分由脂肪量和肥胖相关蛋白(FTO)通过m6A修饰诱导。功能上,NRF2通过转录上调苹果酸酶1(ME1)表达并增强其活性来发挥其抗氧化作用。靶向NRF2/ME1轴降低了NADPH/NADP+比值,增加了ROS水平,损害了白血病细胞活力,并促进了细胞凋亡。更重要的是,NRF2抑制剂ML385与维奈克拉联合在体外和体内显示出协同抗白血病活性。结论:总的来说,我们的发现为在NPM1突变AML中靶向NRF2的治疗潜力提供了新见解,并为开发创新联合疗法提供了指导。补充信息:在线版本包含补充材料,可在10.1186/s40170-025-00401-6获取。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
NPM1突变AML中氧化还原平衡失调是否构成可靶向的代谢脆弱性,以及靶向NRF2单独或联合维奈克拉是否具有抗白血病作用
核心机制
NPM1突变通过稳定FTO,经m6A去甲基化上调NRF2表达;NRF2转录激活ME1,促进NADPH生成,维持氧化还原平衡并促进细胞生存
主要证据
RNA-seq和GSEA显示NPM1突变细胞富集ROS通路;流式证实ROS升高;qRT-PCR、Western blot和免疫荧光显示NRF2高表达和核定位;RIP和MeRIP证明FTO-m6A调控;ChIP证明NRF2直接结合ME1启动子;敲降或抑制NRF2降低NADPH/NADP+,升高ROS,抑制增殖并诱导凋亡;CDX模型联合治疗降低白血病负荷并延长生存
研究意义
靶向NRF2或联合维奈克拉为NPM1突变AML提供潜在个体化治疗策略,支持新型联合疗法的发展

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

验证NPM1突变白血病细胞中ROS水平升高

比较NPM1突变与野生型细胞中的细胞内和线粒体ROS水平

使用DHE和MitoSOX Red染色,通过流式细胞术检测OCI-AML2(过表达NPM1-mA或wt)和OCI-AML3(天然NPM1-mA)及NPM1敲降细胞的ROS水平

2

评估NRF2表达与预后

检测NPM1突变AML中NRF2的表达水平、亚细胞定位及其与预后的关系

利用公共数据库(GSE68466、TCGA、Beat AML)分析NRF2表达和生存;qRT-PCR、Western blot和免疫荧光检测患者原代细胞和细胞系中的NRF2表达和定位;通过敲降或过表达NPM1-mA观察NRF2变化

3

阐明FTO通过m6A修饰调控NRF2的机制

验证FTO是否通过m6A去甲基化调控NRF2表达

预测m6A位点;敲降或过表达FTO检测NRF2表达;使用FTO抑制剂MA和FB23-2;进行RIP、MeRIP和mRNA稳定性实验;进行挽救实验验证NPM1-mA/FTO/NRF2轴

4

鉴定NRF2下游靶基因ME1及其功能

确定NRF2的下游靶基因,并验证NRF2/ME1轴在维持氧化还原平衡和细胞存活中的作用

筛选潜在靶基因;ChIP验证NRF2结合ME1启动子;敲降ME1检测NADPH/NADP+、ROS、增殖和凋亡;敲降NRF2检测ME1表达和活性

5

评估遗传和药理学抑制NRF2的效果

验证NRF2抑制是否破坏氧化还原稳态并诱导白血病细胞死亡

敲降NRF2或使用ML385处理,检测NADPH/NADP+、ROS、细胞活力、凋亡、ME1表达和活性

6

体外评估ML385与维奈克拉联合的协同抗白血病作用

测试ML385与维奈克拉等药物联合是否具有协同杀伤AML细胞的作用

进行剂量-反应实验,计算HSA协同分数;CCK-8检测细胞活力;流式检测凋亡和细胞周期;Western blot检测凋亡蛋白

7

体内验证ML385单药及联合维奈克拉的抗白血病效果

评估ML385单药或与维奈克拉联合在CDX小鼠模型中的疗效

NOD/SCID小鼠尾静脉注射OCI-AML3细胞,分为对照组、ML385组、VEN组和联合组,治疗4周后检测骨髓中hCD45+细胞、脾/肝重量、组织病理、生存期

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
RPMI-1640培养基Thermo Fisher Scientific11875093
胎牛血清Thermo Fisher Scientific10099141C
青链霉素溶液BeyotimeC0222
MG-132TopscienceT2154
甲氯芬那酸SelleckS4295
FB23-2SelleckS8837
ML385MCEHY-100523
维奈克拉MCEHY-15531
HitransG P转染增强剂GenechemREVG005
TRIzol试剂Takara--
PrimeScript RT预混液TakaraRR036A
SYBR Green预混液TakaraRR820A
CFX Connect实时PCR检测系统Bio-Rad--
RIPA裂解液BeyotimeP0013C
蛋白酶抑制剂BimakeB14001
核浆蛋白提取试剂盒BeyotimeP0027
BCA蛋白检测试剂盒BeyotimeP0010S
5× SDS-PAGE上样缓冲液BeyotimeP0015
PVDF膜Bio-Rad1620177
HRP标记的山羊抗兔IgGBiosharpBL003A
HRP标记的山羊抗小鼠IgGBiosharpBL001A
抗NRF2抗体Proteintech16396-1-AP
抗ME1抗体Proteintech16619-1-AP
抗FTO抗体Proteintech27226-1-AP
抗NPM1-mA抗体InvitrogenPA1-46356
抗NPM1抗体InvitrogenMA3-25200-A488
抗组蛋白H3抗体HUABIOM1309-1
抗BCL2抗体SelleckchemA5010
抗CASP3抗体SelleckchemA5185
抗BAX抗体BimakeA51310200020010
抗剪切CASP3抗体Cell Signaling Technology9664T
抗β-actin抗体ZSGB-BIOTA-09
TRIzol试剂Thermo Fisher Scientific15596026
二氢乙啶BeyotimeS0063
MitoSOX RedBeyotimeS0061S
FACSCalibur流式细胞仪BD Biosciences--
Ficoll单个核细胞分离液Hao Yang Biological Manufacture Co.TBD2013CHU05
10%胎羊血清BOSTERAR0009
Coralite 594偶联的山羊抗兔二抗ProteintechSA00013-4
DAPIBeyotime1005
荧光显微镜Nikon--
RNA免疫沉淀试剂盒GENESEEDP0101
抗FTO兔多克隆抗体Proteintech27226-1-AP
抗m6A兔多克隆抗体Abcamab286164
对照IgGCell Signaling Technology2729S
NADP+/NADPH检测试剂盒(WST-8)BeyotimeS0179
NADP苹果酸酶活性检测试剂盒SolarbioBC1125
BeyoChIP酶促ChIP检测试剂盒BeyotimeP2083S
Lipofectamine 2000转染试剂Invitrogen11668500
CCK-8试剂盒SolarbioCA1210
Annexin V-APC/DAPI凋亡试剂盒ElabscienceE-CK-A258
Annexin V-FITC/PI凋亡试剂盒ElabscienceE-CK-A211
细胞周期检测试剂盒ElabscienceE-CK-A351
GraphPad Prism软件----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养与处理
细胞系(OCI-AML2、OCI-AML3、THP-1、HL-60)、培养基(RPMI-1640)、FBS浓度、青霉素-链霉素浓度;药物处理浓度和时间(MG-132、MA、FB23-2、ML385、venetoclax)
阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment
慢病毒转染与稳定细胞系建立
shRNA序列、转染增强剂、嘌呤霉素筛选时间(7天)
阅读提示:Materials and methods: Establishment of stable cell lines, Table 1
ROS检测
探针(DHE、MitoSOX Red)浓度、孵育时间(30分钟)、检测细胞数(1×10^6)
阅读提示:Materials and methods: Measurement of ROS levels
蛋白质印迹
抗体稀释比例、抗体来源(品牌和货号)、内参(β-actin)
阅读提示:Materials and methods: Western blotting
qRT-PCR
PCR引物序列(表2)、循环条件、内参基因(β-actin)
阅读提示:Materials and methods: RNA isolation and qRT-PCR, Table 2
ChIP实验
细胞数量、甲醛交联时间、抗体(anti-NRF2、IgG)、ME1-ARE引物(表2)
阅读提示:Materials and methods: Chromatin immunoprecipitation assays, Table 2
体内实验
小鼠品系和性别(7周龄雌性NOD/SCID)、细胞注射数量(2×10^6)、给药剂量(ML385 30 mg/kg、VEN 50 mg/kg)、给药方式(腹腔注射、隔日一次)、治疗周期(4周)
阅读提示:Materials and methods: Animal experiments
数据分析与统计
统计检验方法(t检验、ANOVA、log-rank)、显著性阈值(p<0.05)、重复次数(三次独立实验)
阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis