临床样本和体外模型验证ATXN2L表达
确认DR中ATXN2L的表达水平及其与疾病的相关性
使用qRT-PCR检测DR患者血清和HG诱导的HRMECs中ATXN2L的mRNA和蛋白表达。
Exosomal FOXL1 from bone marrow mesenchymal stem cells activates the METTL3/ATXN2L pathway to ameliorate high glucose-induced human retinal microvascular endothelial cell injury.
研究包含临床样本(DR患者血清)、体外细胞模型、外泌体分离鉴定及多种功能与机制实验,但缺乏动物模型等体内验证。
人视网膜微血管内皮细胞(HRMECs) 骨髓间充质干细胞(BMSCs) DR患者血清样本
高糖浓度30 mM处理HRMECs 24小时建立DR模型 临床样本:17名DR患者和17名健康对照血清 外泌体分离通过超速离心(100,000g) 关键基因过表达和敲低:ATXN2L、METTL3、FOXL1 统计方法:t检验或单因素方差分析,P<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认DR中ATXN2L的表达水平及其与疾病的相关性
使用qRT-PCR检测DR患者血清和HG诱导的HRMECs中ATXN2L的mRNA和蛋白表达。
验证ATXN2L对高糖诱导的HRMECs炎症、凋亡和氧化应激的影响
将ATXN2L过表达质粒转染HRMECs,用CCK-8、ELISA、流式、比色法和荧光显微镜检测细胞活力、炎症因子、凋亡和氧化指标。
验证METTL3通过m6A甲基化调控ATXN2L表达
用双荧光素酶报告基因、MeRIP、放线菌素D实验验证METTL3与ATXN2L的结合及对mRNA稳定性的影响,并检测METTL3在DR中的表达。
确认METTL3的保护作用依赖于ATXN2L
在METTL3过表达的基础上敲低ATXN2L,检测细胞活力、炎症、凋亡和氧化应激指标。
验证FOXL1作为转录因子结合METTL3启动子并调控其表达
用JASPAR预测结合位点,RIP和双荧光素酶报告基因验证FOXL1与METTL3的结合,检测FOXL1表达,并在FOXL1过表达的基础上敲低METTL3观察功能变化。
验证BMSC外泌体通过转移FOXL1改善高糖诱导的HRMEC损伤
分离BMSC外泌体并鉴定(TEM、NTA、标志物),用PKH67标记观察摄取,将外泌体与HRMECs共孵育,检测FOXL1、METTL3、ATXN2L表达及细胞功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | GENIA Bioscience | -- |
| 胎牛血清 | Yuanye Bio-Technology | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Solarbio | -- | |
| 葡萄糖 | ybiotech | -- | |
| 甘露醇 | Yuanye Bio-Technology | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher | -- |
| Opti-MEM培养基 | Solarbio | -- | |
| 流式分析 | Attune NxT流式细胞仪 | Thermo Fisher | -- |
| Annexin V-FITC | Solarbio | -- | |
| 碘化丙啶 | Solarbio | -- | |
| 抗CD45抗体 | Elabscience | E-AB-F1137D | |
| 抗CD73抗体 | Elabscience | E-AB-F1242D | |
| 抗CD105抗体 | Elabscience | E-AB-F1310D | |
| 外泌体鉴定 | Tecnai T20透射电子显微镜 | FEI | -- |
| 磷钨酸 | ybiotech | -- | |
| NTA 3.2软件 | NanoSight | -- | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗ATXN2L抗体 | Abcam | ab184834 | |
| 抗METTL3抗体 | Abcam | ab195352 | |
| 抗FOXL1抗体 | Thermo Fisher | 2299-MSM2-P0 | |
| 抗TSG101抗体 | Thermo Fisher | MA1-23296 | |
| 抗CD63抗体 | Thermo Fisher | PA5-92370 | |
| 抗CD81抗体 | Thermo Fisher | MA5-32333 | |
| 抗β-actin抗体 | Thermo Fisher | MA1-140 | |
| 山羊抗小鼠IgG | Thermo Fisher | 31430 | |
| 山羊抗兔IgG | Thermo Fisher | 31460 | |
| Tris缓冲盐溶液含Tween-20 | Bei Jing Think-Far Technology Co.,Ltd | -- | |
| RNA提取和qPCR | Trizol试剂 | Khayal Bio-Technology | -- |
| RNAsimple试剂盒 | Tiangen | -- | |
| FastKing逆转录试剂盒 | Tiangen | -- | |
| SuperReal PreMix Color | Tiangen | -- | |
| IQ5热循环仪 | Bio-Rad | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | -- |
| RNE90002酶标仪 | REAGEN | -- | |
| ELISA | 人TNF-α ELISA试剂盒 | Beyotime | PT518 |
| 人IL-1β ELISA试剂盒 | Beyotime | PI305 | |
| 人IL-6 ELISA试剂盒 | Beyotime | PI325 | |
| 氧化应激分析 | MDA含量检测试剂盒 | Solarbio | BC0020 |
| GSH-PX检测试剂 | Qiyi Biotech | QYS-23071 | |
| 细胞ROS检测试剂盒 | Abcam | ab113851 | |
| IX71荧光显微镜 | Olympus | -- | |
| 双荧光素酶报告基因实验 | GloMax Explorer多功能检测仪 | YPH biotech | -- |
| 被动裂解缓冲液 | Solarbio | -- | |
| MeRIP实验 | PGM磁珠 | CLOUNSEQ | -- |
| 抗m6A抗体 | CLOUNSEQ | -- | |
| IgG抗体 | CLOUNSEQ | -- | |
| RIP实验 | RIP裂解缓冲液 | Millipore | -- |
| 磁珠 | Millipore | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本 | 血清样本来自17名DR患者和17名健康对照,DR诊断由专业医师确认 阅读提示:Methods: Clinical samples |
| 细胞模型 | 高糖浓度30 mM处理HRMECs 24小时,甘露醇30 mM作为渗透压对照 阅读提示:Methods: Cell culture and treatment |
| 细胞转染 | 转染使用Lipofectamine 2000,shRNA或质粒浓度未明确,转染时间4-6小时 阅读提示:Methods: Cell transfection |
| 外泌体分离与鉴定 | 差速离心步骤:1500g 20min, 10000g 40min, 100000g 1.5h两次 阅读提示:Methods: Isolation of exosomes from BMSCs |
| 功能实验 | CCK-8检测在48小时,ELISA检测TNF-α, IL-1β, IL-6,流式检测凋亡,MDA, GSH-Px, ROS检测 阅读提示:Methods: CCK-8 assay, ELISA, Flow cytometry, Oxidative stress analysis |
| 机制实验 | 双荧光素酶报告基因和RIP实验验证METTL3与ATXN2L、FOXL1与METTL3的结合 阅读提示:Methods: Dual-luciferase reporter assay, RIP assay, MeRIP assay |