检测脓毒症DC中脂质积累和SREBF1表达
验证脓毒症是否诱导DC脂质代谢重编程并上调SREBF1
收集脓毒症患者和健康对照PBMCs,进行油红O染色;对CLP模型小鼠脾DC进行BODIPY染色、RNA-seq、qPCR和Western blot分析SREBF1及脂质合成相关基因和蛋白表达。
SREBF1 mediates immunoparalysis of dendritic cells in sepsis by regulating lipid metabolism and endoplasmic reticulum stress.
包含CLP小鼠模型、Srebf1 cKO小鼠、BMDC体外实验、人PBMC样本等多个独立证据层级,并通过siRNA敲低、TM处理、RNA-seq、流式、ELISA等进行了功能与机制验证。
CLP诱导的脓毒症小鼠模型 Srebf1条件性敲除(cKO)小鼠 骨髓来源树突状细胞(BMDC) 人外周血单核细胞(PBMC)
CLP手术具体操作(1.5 cm结扎、18号针穿刺) 他莫昔芬剂量(100 mg/kg,连续7天,腹腔注射)用于诱导Srebf1敲除 siSREBF1转染试剂(RFect)及敲低效率验证 LPS刺激浓度(100 ng/mL)和时间(12 h) 衣霉素(TM)浓度(0.5 µg/mL,体外处理1 h)及体内剂量(1 mg/kg,CLP前1 h)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证脓毒症是否诱导DC脂质代谢重编程并上调SREBF1
收集脓毒症患者和健康对照PBMCs,进行油红O染色;对CLP模型小鼠脾DC进行BODIPY染色、RNA-seq、qPCR和Western blot分析SREBF1及脂质合成相关基因和蛋白表达。
评估SREBF1缺失是否影响脓毒症DC中脂质生物合成
使用Srebf1 cKO小鼠(他莫昔芬诱导敲除),进行CLP建模,分离脾DC,通过Western blot检测SREBF1及下游酶表达,BODIPY染色和FFA/TG/TC测定评估脂质含量。
确定SREBF1是否调控脓毒症DC的表型、细胞因子分泌和T细胞活化能力
分离WT和cKO小鼠脾DC,流式检测共刺激分子和MHC II,ELISA检测细胞因子,与CD4+ T细胞共培养检测增殖和Th1/Th2极化;体外用siRNA敲低BMDC中SREBF1并用LPS刺激进行验证。
探究SREBF1是否促进脓毒症DC凋亡
检测WT和cKO小鼠脾DC中凋亡相关蛋白(Bcl-2、Bax、cleaved caspase-3)表达,Annexin V-FITC/PI和TUNEL染色评估凋亡;体外siRNA敲低BMDC后LPS刺激验证。
验证SREBF1是否通过脂质依赖途径激活ER应激,并确定具体通路
在BMDC中敲低SREBF1并用LPS刺激,检测GRP78、PERK、eIF2α、ATF4、CHOP表达,TEM观察ER形态;用TM处理以区分脂质相关ER应激与其他类型的ER应激。
确认ER应激是SREBF1导致DC免疫麻痹和凋亡的关键下游介质
用TM诱导ER应激,观察BMDC中免疫表型、细胞因子和T细胞活化变化及SREBF1敲低的挽救效果;在小鼠中结合TM和CLP观察生存率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 脂质染色 | 油红O染色试剂盒 | Beyotime | C0158S |
| -- | Invitrogen | D3922 | |
| 细胞分离 | 小鼠脾脏单个核细胞分离试剂盒 | TBDscience | LDS1090PK |
| CD11c磁珠 | Miltenyi Biotech | 130-125-835 | |
| CD4磁珠 | Miltenyi Biotech | 130-117-043 | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 重组小鼠GM-CSF | PeproTech | AF-315-03-20 | |
| 小鼠IL-4 | PeproTech | AF-214-14-20 | |
| 人PBMC分离 | 人PBMC分离液 | TBDsciences | LTS1077 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026CN |
| siRNA转染 | RFect siRNA/miRNA转染试剂 | Baidai Biotech | 11026 |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Scientific | 23227 |
| Western blot | 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | IPVH00010 |
| SREBF1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365514 | |
| FASN抗体 | Abcam | ab128870 | |
| ACACA抗体 | Abcam | ab45174 | |
| SCD1抗体 | Abcam | ab236868 | |
| Bcl-2抗体 | Abcam | ab182858 | |
| Bax抗体 | Cell Signaling Technology | 2772s | |
| cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| PERK抗体 | Cell Signaling Technology | 3192 | |
| p-eIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | 3398 | |
| eIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | 5324 | |
| ATF4抗体 | Cell Signaling Technology | 11815 | |
| GRP78抗体 | ProteinTech | 11587-1-AP | |
| CHOP抗体 | ProteinTech | 15204-1-AP | |
| β-肌动蛋白抗体 | ProteinTech | 81115-1-RR | |
| p-PERK抗体 | Abmart | TA4499M | |
| Western blot成像 | iBright成像系统 | Invitrogen | CL1500 |
| 流式细胞术 | PE偶联抗小鼠CD40 | eBioscience | 12-04-1082 |
| PE偶联抗小鼠CD80 | eBioscience | 12-0801-82 | |
| FITC偶联抗小鼠CD86 | eBioscience | 11-0862-82 | |
| APC偶联抗小鼠MHCII | eBioscience | 17-5320-82 | |
| BD FACS CantoII流式细胞仪 | BD | -- | |
| CFSE | -- | -- | |
| ELISA | 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Jianglai | -- |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Jianglai | -- | |
| 小鼠IL-4 ELISA试剂盒 | Jianglai | -- | |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Jianglai | -- | |
| 小鼠IL-12 ELISA试剂盒 | Jianglai | -- | |
| 小鼠IFN-γ ELISA试剂盒 | Jianglai | -- | |
| 生化分析 | 游离脂肪酸检测试剂盒 | Mlbio | -- |
| 甘油三酯检测试剂盒 | Mlbio | -- | |
| 总胆固醇检测试剂盒 | Mlbio | -- | |
| 免疫荧光 | 兔抗GRP78抗体 | ProteinTech | 11587-1-AP |
| Alexa Fluor 488偶联抗兔抗体 | Abcam | ab150077 | |
| TUNEL检测 | TUNEL检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A321 |
| 透射电镜 | HT7800透射电子显微镜 | Hitachi | -- |
| RNA测序 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596018CN |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | -- | -- |
| 衣霉素 | -- | -- | |
| 细胞染色 | DAPI | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CLP模型 | 小鼠品系、年龄、性别;麻醉方式;结扎位置和穿刺针规格;术后补液量 阅读提示:Materials and methods: Mice, CLP |
| Srebf1条件性敲除 | 他莫昔芬给药剂量、途径、时间;基因敲除确认方法 阅读提示:Materials and methods: Mice |
| BMDC生成 | 骨髓来源;GM-CSF和IL-4浓度;培养时间和培养基更换频率 阅读提示:Materials and methods: BMDCs generation in vitro |
| siRNA敲低 | siRNA序列;转染试剂和用量;转染后收获时间 阅读提示:Materials and methods: Transfection of siRNA |
| 细胞刺激处理 | LPS浓度和时间;TM浓度和处理时间 阅读提示:Figure legends(图5-8) |
| DC和T细胞共培养 | DC与T细胞比例;共培养时间;检测指标(如CFSE稀释、IFN-γ/IL-4) 阅读提示:Materials and methods: Carboxyl fluorescein succinimidyl ester staining; Flow cytometry; Figure legends(图3, 6) |
| 流式分析 | 表面标志物抗体及克隆号;染色条件;仪器设置 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry assay |
| 统计分析 | 样本量(n);统计检验方法;显著性阈值 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |