体内模型验证SFTSV诱导肝损伤和铁死亡
确定SFTSV感染是否能引起体内铁死亡并导致肝损伤
使用AG6小鼠腹腔注射104 TCID50 SFTSV(E-JS-2013-24株),感染3天后取肝脏;设置Fer-1预处理组。检测血清GOT1/AST、GPT/ALT、炎症因子、凝血指标、铁离子、MDA、GSH、SLC7A11和GPX4表达,并进行H&E染色和病毒载量检测。
SFTSV induces liver ferroptosis through m6A-related ferritinophagy.
包含体内动物模型和体外细胞实验,并通过铁死亡抑制剂、m6A位点突变、基因敲除等手段进行了功能验证和机制验证。
AG6小鼠模型 Huh-7细胞 HepG2细胞 HEK-293T细胞(用于过表达和敲除实验)
SFTSV感染剂量:104 TCID50/只 Fer-1处理浓度:10 mg/kg(体内)、1 μM(体外) SFTSV感染时间:3天(体内)、36-48小时(体外) ATG5 m6A位点突变对铁蛋白自噬的抑制作用 NSs蛋白在ATG5 m6A修饰中的关键作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定SFTSV感染是否能引起体内铁死亡并导致肝损伤
使用AG6小鼠腹腔注射104 TCID50 SFTSV(E-JS-2013-24株),感染3天后取肝脏;设置Fer-1预处理组。检测血清GOT1/AST、GPT/ALT、炎症因子、凝血指标、铁离子、MDA、GSH、SLC7A11和GPX4表达,并进行H&E染色和病毒载量检测。
确认SFTSV在细胞中诱导铁死亡,并验证Fer-1对病毒复制的抑制
在Huh-7和HepG2细胞中感染SFTSV(MOI=1),检测铁离子水平、线粒体形态、ROS、MDA、GSH;用Fer-1预处理后检测以上指标及病毒NP蛋白表达。
确定SFTSV哪个病毒蛋白在诱导铁死亡中发挥作用
在HEK-293T细胞中分别过表达GFP-NSs、flag-NP、his-Gn,检测GPX4、SLC7A11表达,以及MDA、GSH、Fe2+水平。
证实SFTSV感染通过WTAP上调ATG5 m6A修饰,并促进其表达
进行MeRIP-seq和m6A-RIP-qPCR分析ATG5 m6A修饰;构建ATG5 3'UTR荧光素酶报告载体(WT和m6A突变体),检测荧光素酶活性;敲低WTAP后检测m6A水平和铁蛋白自噬相关蛋白。
证明SFTSV诱导的铁蛋白自噬导致铁死亡,且ATG5 m6A修饰对此至关重要
检测ATG5、LC3-II/I、SQSTM1/p62、NCOA4、FTH1表达;使用Baf-A1抑制自噬;敲低NCOA4;在ATG5敲除细胞中回补WT或m6A突变ATG5,共转染NSs,检测铁蛋白降解、MDA、ROS、Fe2+水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | Ferrostatin-1 (Fer-1) | Selleckchem | s6702 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | C11965500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | A5256701 | |
| TRIzol试剂 | Takara Bio | T9108 | |
| 蛋白质免疫印迹 | RIPA裂解液 | Santa Cruz Biotechnology | 364162A |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Life Technologies | 23227 | |
| PVDF膜 | Millipore | ISEQ00010 | |
| 抗GFP抗体 | Proteintech | 66002-1-Ig | |
| 抗Flag抗体 | Proteintech | 66008-4-Ig | |
| 抗His抗体 | Proteintech | 66005-1-Ig | |
| 抗SLC7A11抗体 | ABclonal | A2413 | |
| 抗GPX4抗体 | Proteintech | 67763-1-Ig | |
| 抗SQSTM1/p62抗体 | ABclonal | A19700 | |
| 抗ATG5抗体 | Proteintech | 10181-2-AP | |
| 抗LC3抗体 | Proteintech | 14600-1-AP | |
| 抗FTH1抗体 | Proteintech | 10727-1-AP | |
| 抗NCOA4抗体 | Cell Signaling Technology | 66849 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0038 |
| RT-qPCR | HiScript III RT SuperMix for qPCR | Vazyme | R323-01 |
| RIP-qPCR | Magna RIPTM RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒 | Millipore | 17-701 |
| 抗m6A抗体 | Proteintech | 68055-1-Ig | |
| Dot blot | Amersham bond-N+膜 | Millipore | HATF02500 |
| 吐温20 | Sigma Aldrich | P9416 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma Aldrich | A7638 | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Beyotime | P0096 |
| DAPI | -- | -- | |
| 抗小鼠IgG二抗 | Invitrogen | A-11008 | |
| 抗兔IgG二抗 | Invitrogen | A-11012 | |
| ProLong Gold抗淬灭剂 | Invitrogen | P36971 | |
| MDA检测 | MDA检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | M496 |
| Fe2+检测 | FerroOrange检测试剂盒 | DOJINDO | F374 |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime | RG010M |
| 仪器 | 奥林巴斯共聚焦显微镜FV3000 | Olympus | -- |
| ABI Prism 7500序列检测系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Illumina NovaseqTM测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体内动物模型 | AG6小鼠品系、SFTSV毒株、感染剂量、感染时间、Fer-1给药剂量和途径 阅读提示:Materials and methods: SFTSV infection of AG6 mice; Figure 1 legend |
| 体外细胞感染 | 细胞系来源和培养条件、MOI、感染时间、Fer-1和Erastin处理浓度 阅读提示:Materials and methods: Cell culture; Figure 2 legend |
| 病毒蛋白过表达 | HEK-293T细胞、质粒(GFP-NSs、flag-NP、his-Gn)、转染和检测时间 阅读提示:Materials and methods: Western blot; Figure 3 legend |
| m6A检测 | MeRIP-seq方法、RIP-qPCR条件、ATG5探针和抗体、感染时间 阅读提示:Materials and methods: MeRIP-seq, RNA immunoprecipitation; Figure 4 legend |
| ATG5功能验证 | ATG5敲除细胞系、WT-ATG5和mut-ATG5质粒构建、共转染条件、检测指标 阅读提示:Materials and methods: Cell culture, Western blot; Figure 6 legend |