临床样本与动物模型验证焦亡激活
验证在肾结石患者和小鼠模型中,GSDMD介导的焦亡是否被激活及其与疾病严重程度的关系。
收集肾结石患者和正常人的肾组织及血液样本,检测焦亡相关基因和蛋白表达;建立Gly诱导的CaOx小鼠模型,进行RNA-seq分析。
Regulating the balance between GSDMD-mediated pyroptosis and CHMP4B-dependent cell repair attenuates calcium oxalate kidney stone formation.
包含临床样本分析、细胞模型、动物模型及RNA-seq等多层级验证,并明确进行功能获得与缺失实验及机制研究。
人肾小管上皮细胞系HK-2 C57BL/6小鼠乙醛酸盐诱导的草酸钙肾结石模型 GSDMD基因敲除小鼠 肾结石患者和健康对照的肾组织和血液样本
HK-2细胞使用0.8 mmol/L草酸盐处理24小时 NSA(GSDMD抑制剂)使用浓度:体外15 μmol/L,体内50 mg/kg/d腹腔注射 乙醛酸盐体内造模剂量:100 mg/kg/d腹腔注射,连续7天 AAV-FLEX-CHMP4B通过尾静脉注射(80 mg/kg,100 μL),注射后2周开始造模 体内实验中每组小鼠数量为6只
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证在肾结石患者和小鼠模型中,GSDMD介导的焦亡是否被激活及其与疾病严重程度的关系。
收集肾结石患者和正常人的肾组织及血液样本,检测焦亡相关基因和蛋白表达;建立Gly诱导的CaOx小鼠模型,进行RNA-seq分析。
评估GSDMD缺乏或抑制是否能减轻草酸钙诱导的细胞损伤、炎症和晶体沉积。
使用GSDMD-KO小鼠和NSA处理小鼠,检测肾功能指标(CRE、BUN)、炎症因子、肾组织病理、晶体沉积和粘附蛋白表达;在HK-2细胞中通过siRNA或NSA抑制GSDMD,检测细胞活死、LDH释放和晶体粘附。
研究CHMP4B在草酸钙诱导的焦亡过程中的表达变化和亚细胞定位。
通过免疫组化、Western blot和免疫荧光检测人和小鼠肾组织及HK-2细胞中CHMP4B的表达和定位,观察其与GSDMD-N的共定位。
验证CHMP4B过表达或敲低对Ox诱导的细胞损伤、焦亡和晶体粘附的影响。
在HK-2细胞中转染oe-CHMP4B或si-CHMP4B,检测细胞骨架、LDH释放、细胞内Ca2+、细胞活死、晶体粘附及细胞膜变化。
评估CHMP4B过表达在小鼠体内对肾损伤、炎症和晶体沉积的保护作用。
通过尾静脉注射AAV-FLEX-CHMP4B实现肾内过表达,随后建立CaOx模型,检测肾功能、炎症因子、组织病理和转录组变化。
探究同时抑制焦亡和增强细胞修复是否能协同减轻草酸钙肾结石。
在HK-2细胞和小鼠模型中联合使用NSA和CHMP4B过表达,比较单独和联合治疗的效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 血液RNA提取 | 血液总RNA提取试剂盒 | Foregene | RE-04013 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Meilunbio | MA0212 |
| 胎牛血清 | ExCell | FSD500 | |
| 青霉素-链霉素 | Meilunbio | MA0110 | |
| 动物造模 | 乙醛酸盐 | Macklin | 563-96-2 |
| 药物处理 | 坏死磺酰胺 | Abcam | ab143839 |
| TUNEL检测 | 一步法TUNEL细胞凋亡检测试剂盒 | meilunbio | MA0224 |
| 含DAPI的抗淬灭封片剂 | meilunbio | MA0236 | |
| 细胞-晶体粘附 | 草酸钠 | Solarbio | D6830 |
| 氯化钙 | Solarbio | C7250 | |
| siRNA转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 磷酸酶抑制剂 | Glpbio | GK10012 | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Yamei | ZJ102 |
| 4× SDS-PAGE上样缓冲液 | Solarbio | P1016 | |
| PVDF膜 | Solarbio | ISEQ0001 | |
| 脱脂奶粉 | Solarbio | D8340 | |
| ECL检测试剂盒 | Elabscience | E-IR-R308 | |
| Tanon-5200成像系统 | Tanon | 5200 | |
| RNA提取 | Trizol替代物 | Solarbio | R1100 |
| qRT-PCR | cDNA合成预混液 | Yeasen | 11141ES60 |
| SYBR Green预混液 | Yeasen | 11201ES08 | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| 正常山羊血清 | -- | -- | |
| Alexa Fluor 594山羊抗兔二抗 | Invitrogen | A-11012 | |
| Alexa Fluor 488山羊抗小鼠二抗 | Invitrogen | A-11001 | |
| DAPI染料 | Solarbio | C0065 | |
| 免疫组化 | Tris-EDTA缓冲液 | Solarbio | C1038 |
| PV-9000两步法免疫组化试剂盒 | ZSGB-BIO | PV-9000 | |
| DAB显色试剂盒 | Solarbio | DA1010 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Glpbio | GK10001 |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0037 |
| IL-18 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0730 | |
| 细胞内Ca2+检测 | Fluo-4钙离子检测试剂盒 | Beyotime | S1061S |
| 细胞膜染色 | Dil细胞膜染色试剂盒 | Beyotime | C1991S |
| 细胞核染色 | Hoechst 33342染料 | Solarbio | C0030 |
| 活死细胞染色 | Calcein-AM/PI双染试剂盒 | Elabscience | E-CK-A354 |
| 透射电镜 | 电镜固定液 | Servicebio | G1102 |
| 醋酸铀 | -- | -- | |
| 柠檬酸铅 | -- | -- | |
| RNA测序 | RNA 6000 Nano试剂盒 | Agilent | -- |
| Illumina NovaSeq 6000测序系统 | Illumina | 6000 | |
| 荧光显微镜 | 荧光显微镜 | Nikon | -- |
| 酶标仪 | 800TS酶标仪 | BIOTEK | 800TS |
| 透射电镜 | 透射电子显微镜HT7700 | Hitachi | HT7700 |
| 组织成像 | Nikon Eclipse Ci显微镜 | Nikon | Ci |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系(C57BL/6)、性别(雄性)、年龄(6-8周)、体重?;乙醛酸盐剂量(100 mg/kg/d)、给药途径(腹腔注射)、给药时间(7天);对照组给予等量生理盐水 阅读提示:Materials and Methods: Animal experiments |
| 细胞培养和处理 | HK-2细胞培养条件(DMEM+10%FBS+1%青霉素-链霉素,5% CO2,37°C);Ox处理浓度(0.8 mmol/L)、时间(24小时);NSA浓度(15 μmol/L);siRNA和质粒转染方法(Lipofectamine 3000)及转染时间 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture and intervention; siRNA transfection and plasmid transfection |
| GSDMD敲除或抑制 | GSDMD-KO小鼠的基因型确认;NSA给药剂量(50 mg/kg/d)和途径(腹腔注射);siRNA序列(si-GSDMD)及转染效率验证 阅读提示:Materials and Methods: Animal experiments; siRNA transfection; Results: GSDMD deficiency...; Figure legends |
| CHMP4B过表达 | AAV-FLEX-CHMP4B注射剂量(80 mg/kg, 100 μL)、途径(尾静脉)、时间(造模前2周);体外oe-CHMP4B质粒转染条件;CHMP4B表达验证方法 阅读提示:Materials and Methods: Animal experiments; Cell culture; Results: CHMP4B overexpression... |
| 联合治疗 | NSA和AAV-CHMP4B联合使用的剂量、时间和顺序;与单独治疗的比较 阅读提示:Materials and Methods: Animal experiments; Results: Maintaining the balance... |
| 检测指标 | 肾功能指标(CRE、BUN)、炎症因子(IL-1β、IL-18)的检测方法;晶体沉积(Von Kossa染色)、细胞死亡(TUNEL、Calcein-AM/PI)、细胞粘附(COM晶体粘附)、蛋白表达(Western blot)的具体步骤和定量方法 阅读提示:Materials and Methods: 相应检测方法部分; Figure legends |