临床样本LCN2表达分析
评估LCN2在儿童ALL患者及对照中的表达差异及其与临床特征的相关性。
收集ALL患儿和对照的骨髓、外周血和脑脊液样本,通过qRT-PCR和ELISA检测LCN2表达,并分析其与预后、化疗反应等临床参数的关系。
Prognostic value, biological role, and mechanisms of LCN2 in childhood acute lymphoblastic leukemia.
包含临床样本表达分析、细胞系过表达功能验证、铁死亡检测及机制通路验证等多个证据层级。
儿童ALL骨髓、外周血和脑脊液样本 GC敏感ALL细胞系Nalm6和CEM-C7 GC耐药ALL细胞系CEM-C1和Molt4
LCN2在骨髓、血浆和脑脊液中的表达水平及其与临床特征的相关性 LCN2过表达对细胞生长、增殖、铁死亡和GC敏感性的影响 LCN2对GR、p-GR和Notch1蛋白表达的影响 外源性LCN2处理浓度50 ng/mL及处理时间48小时 Dex IC50值变化及细胞凋亡比例
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估LCN2在儿童ALL患者及对照中的表达差异及其与临床特征的相关性。
收集ALL患儿和对照的骨髓、外周血和脑脊液样本,通过qRT-PCR和ELISA检测LCN2表达,并分析其与预后、化疗反应等临床参数的关系。
构建LCN2稳定过表达的ALL细胞系以研究其生物学功能。
使用携带LCN2的慢病毒转导Nalm6、CEM-C7、CEM-C1和Molt4细胞,通过嘌呤霉素筛选和流式细胞术筛选GFP阳性细胞。
评估LCN2过表达对ALL细胞生长和增殖的影响。
使用细胞计数板和CCK-8法检测LCN2过表达和对照细胞的生长曲线和增殖活力。
评估LCN2过表达对铁死亡的影响。
检测总铁、亚铁、ROS、MDA和GSH水平。
探究LCN2对GC耐药性的影响及其分子机制。
检测LCN2过表达对Dex IC50的影响,并通过Western blot分析GR、p-GR、Notch1及凋亡相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Thermo | -- |
| cDNA合成 | Transcriptor cDNA合成试剂盒 | Roche | -- |
| RT-qPCR | GoTaq qPCR预混液 | -- | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| PVDF膜 | Roche | -- | |
| 化学发光底物 | Immobilon | -- | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| LCN2抗体 | Abcam | ab23477 | |
| GR抗体 | Santa Cruz Biotech | sc-393232 | |
| p-GR(Ser211)抗体 | Cell Signaling Technology | 4161S | |
| p-GR(Ser226)抗体 | Abcam | ab228972 | |
| Notch1抗体 | Cell Signaling Technology | 4380S | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4691S | |
| p-AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060S | |
| P38抗体 | Cell Signaling Technology | 8690S | |
| p-P38抗体 | Cell Signaling Technology | 4511S | |
| JNK1+JNK2+JNK3抗体 | Abcam | ab179461 | |
| p-JNK1+JNK2+JNK3抗体 | Abcam | ab124956 | |
| Bim抗体 | Cell Signaling Technology | 2933S | |
| Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662S | |
| Cleaved Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| ELISA | RayBio人LCN2 ELISA试剂盒 | RayBio | ELH-Lipocalin2-1 |
| 慢病毒转导 | GV513载体 | GeneChem | -- |
| 流式细胞术 | 膜联蛋白V | DOJINDO | AD11 |
| 碘化丙啶 | DOJINDO | C543 | |
| 铁检测 | 铁检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K880-M |
| 亚铁检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K881-M | |
| ROS检测 | 2',7'-二氯二氢荧光素二乙酸酯 | Sigma-Aldrich | D6883 |
| MDA检测 | 丙二醛检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K028-M |
| GSH检测 | 谷胱甘肽检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K030-M |
| 外源性LCN2处理 | 重组人LCN2蛋白 | MCE | HY-P70658A |
| CCK-8检测 | CCK-8试剂盒 | Dogesce | CK04 |
| 微孔板读数 | Biotek Synergy H1酶标仪 | BioTek | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本采集 | 样本类型和来源,分组(实验组和对照组),化疗时间点(第19天和第46天),样本量 阅读提示:Methods: Collection of clinical samples |
| LCN2表达检测 | 检测方法(qRT-PCR和ELISA),样本稀释倍数,内参基因(GAPDH) 阅读提示:Methods: RNA isolation and quantitative real-time PCR; ELISA |
| 细胞培养与处理 | 细胞系及来源,培养条件(培养基、血清浓度、温度、CO2浓度) 阅读提示:Methods: Cell culture |
| LCN2过表达 | 慢病毒载体,感染后筛选方法(嘌呤霉素浓度和时间) 阅读提示:Methods: Lentiviral transduction |
| 功能实验 | 细胞接种密度,检测时间点,试剂和试剂盒信息 阅读提示:Methods: CCK-8 assay; Flow cytometry analyses; Iron, ferrous iron, malondialdehyde, reactive oxygen species and glutathione measurement |
| GC耐药性评估 | Dex浓度梯度,IC50计算方法,处理时间,细胞凋亡检测方法 阅读提示:Methods: Flow cytometry analyses; Results: Reversal of GC resistance by LCN2 and underlying molecular mechanisms |
| 机制研究 | Western blot抗体信息,蛋白表达检测(GR, p-GR, Notch1等) 阅读提示:Methods: Western blot; Results: Reversal of GC resistance by LCN2 and underlying molecular mechanisms |
| 统计分析 | 统计检验方法(T检验、Mann-Whitney检验),相关性分析(Spearman),生存分析方法(Kaplan-Meier、log-rank),显著性阈值 阅读提示:Methods: Statistical analysis |