确定最佳浓度比例
筛选视黄醇和视黄醇棕榈酸酯的最佳协同浓度,以最大化促进细胞活力。
使用SynergyFinder+分析不同浓度组合的协同效应,HaCaT细胞用0-60 µM的ROL和RPalm处理,通过CCK-8检测细胞活力。
Synergistic effects of retinol and retinyl palmitate in alleviating UVB-induced DNA damage and promoting the homologous recombination repair in keratinocytes.
体外细胞模型、重建人表皮、RNA测序、蛋白检测及功能验证,机制研究包括通路抑制和受体调控
HaCaT人角质形成细胞系 重建人表皮(RHE)模型
HaCaT细胞系和RHE模型的培养条件 UVB照射剂量:HaCaT用50 mJ/cm2,RHE用120 mJ/cm2 ROL和RPalm的使用浓度:15 µM ROL和30 µM RPalm 处理时间:UVB照射后应用药物,孵育24小时 细胞活性检测:CCK-8试剂盒,波长450 nm
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选视黄醇和视黄醇棕榈酸酯的最佳协同浓度,以最大化促进细胞活力。
使用SynergyFinder+分析不同浓度组合的协同效应,HaCaT细胞用0-60 µM的ROL和RPalm处理,通过CCK-8检测细胞活力。
评估ROL和RPalm组合对UVB诱导的炎症因子和胶原蛋白表达的影响,以验证其生物学功能。
HaCaT细胞经50 mJ/cm2 UVB照射后,用15 µM ROL和30 µM RPalm处理,通过RT-qPCR检测炎症因子(TNF-α, IL-6, IL-8)和透明质酸合成酶(HAS1, HAS2, HAS3, CD44)的mRNA表达,通过Western blot检测胶原蛋白(COL-1, COL-3)表达。
检测ROL和RPalm组合对UVB诱导的细胞凋亡的影响。
使用Annexin V-FITC/PI凋亡试剂盒,通过流式细胞术分析HaCaT细胞的凋亡率。
通过全转录组测序揭示ROL和RPalm组合影响的主要通路和基因表达变化。
对对照组、UVB组、UVB+ROL、UVB+RPalm和UVB+R+R组的HaCaT细胞进行bulk RNA测序,并进行差异基因表达、GO和KEGG富集分析。
验证ROL和RPalm组合对UVB诱导的DNA损伤的减轻和修复促进作用。
通过Western blot检测γH2AX和HMGB1蛋白水平,彗星实验检测DNA损伤,免疫荧光检测γH2AX焦点,流式细胞术分析细胞周期。
确定ROL和RPalm组合主要激活的DNA修复通路。
通过RT-qPCR检测NER、BER、MMR、HR和NHEJ相关基因的表达,并验证HR通路蛋白BRCA1和RAD52的表达。
在RHE模型中验证ROL和RPalm组合对UVB诱导的DNA损伤的修复效应。
RHE经120 mJ/cm2 UVB照射后,用15 µM ROL和30 µM RPalm处理,免疫荧光检测γH2AX焦点。
揭示ROL和RPalm协同作用的上游受体机制。
通过RT-qPCR检测RAR和RXR亚型的表达,并使用RAR拮抗剂AGN193109验证RAR通路在DNA修复中的作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | 视黄醇 | COACHCHEM | -- |
| 视黄醇棕榈酸酯 | DSM-firmenich | -- | |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 细胞活性检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0043 |
| RNA提取和RT-qPCR | TransZol Up Plus RNA试剂盒 | Transgen | -- |
| 5X Evo M-MLV反转录反应混合液 | Agbio | AG11728 | |
| RT-qPCR | SYBR Green混合液 | Yeasen | 11202 ES |
| QuantStudio 1 Plus实时荧光定量PCR仪 | Thermo Fisher | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012 | |
| 5X SDS上样缓冲液 | Beyotime | P0015L | |
| SurePAGE凝胶 | GenScript | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| 脱脂牛奶 | Beyotime | P0216 | |
| QuickBlock Western一抗稀释液 | Beyotime | P0256 | |
| ECL化学发光底物 | -- | -- | |
| β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 81115-1-RR | |
| I型胶原蛋白抗体 | Proteintech | 14695-1-AP | |
| III型胶原蛋白抗体 | Proteintech | 22734-1-AP | |
| γH2A.X(磷酸化S139)抗体 | Abcam | ab81299 | |
| HMGB1抗体 | Proteintech | 10829-1-AP | |
| ATM(磷酸化S1987)抗体 | Abcam | ab315019 | |
| P53(磷酸化Ser15)抗体 | Proteintech | 80195-1-RR | |
| P53抗体 | Proteintech | 10442-1-AP | |
| CHK2(磷酸化Thr68)抗体 | Proteintech | 29012-1-AP | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 | |
| RAD52抗体 | Proteintech | 28045-1-AP | |
| BRCA1抗体 | Proteintech | 22362-1-AP | |
| 山羊抗兔IgG-HRP | Jackson | 111-035-003 | |
| 山羊抗小鼠IgG-HRP | Jackson | 115-035-003 | |
| 彗星实验 | 彗星实验试剂盒 | Beyotime | C2041S |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 荧光显微镜 | DMi8显微镜 | Leica | -- |
| RHE培养 | SkinEthic重建人表皮 | EPISKIN | -- |
| 维持培养基 | SkinEthic | 24-SMM-0919 | |
| RHE防冻切片 | 组织冷冻包埋剂 | Leica | 14020108926 |
| 防冻切片 | 冷冻切片机 | Leica | CM1950 |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| Alexa Fluor 594偶联的山羊抗兔抗体 | Life Technologies | -- | |
| DAPI | Beyotime | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡试剂盒 | Elabscience | E-CK-A211 |
| 细胞周期分析 | 细胞周期检测试剂盒(红色荧光) | Elabscience | E-CK-A351 |
| 流式细胞术 | CytoFlex流式细胞仪 | Beckman | -- |
| RNA测序 | TRIzol试剂 | Gibco | 15596026CN |
| UVB照射 | UVB交联仪 | Luyor | UCL-3500M |
| 紫外辐照计 | Speedre | SDR-297 | |
| 细胞活性检测 | 酶标仪 | Tecan | -- |
| 机制研究 | AGN193109 | MedChemExpress | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与UVB照射 | HaCaT细胞系来源(EK-Bioscience, CC-H1149);UVB剂量50 mJ/cm2;照射时覆盖培养基 阅读提示:Methods 2.1 |
| 药物处理 | ROL浓度15 µM,RPalm浓度30 µM,溶剂DMSO(0.1%),处理时间24小时 阅读提示:Methods 2.1,Results 3.1 |
| 细胞活性检测 | CCK-8试剂盒(Beyotime, C0043),细胞数1×10^4,波长450 nm 阅读提示:Methods 2.2 |
| RNA提取与RT-qPCR | RNA提取试剂盒(TransGen),反转录试剂盒(Agbio),SYBR Green Mix(Yeasen),内参β-Actin,引物序列见表1 阅读提示:Methods 2.3,Table 1 |
| Western blot | 蛋白裂解液(Beyotime),BCA试剂盒,抗体信息(Proteintech, Abcam),ECL底物 阅读提示:Methods 2.4 |
| 彗星实验 | 试剂盒(Beyotime, C2041S),碱性电泳,PI染色 阅读提示:Methods 2.5 |
| RHE实验 | RHE模型(EPISKIN),UVB剂量120 mJ/cm2,维持培养基(SkinEthic, 24-SMM-0919) 阅读提示:Methods 2.6 |
| 免疫荧光 | 一抗γH2AX(Abcam, ab81299),二抗Alexa Fluor 594,DAPI染色 阅读提示:Methods 2.7 |
| 凋亡检测 | 细胞数5×10^5,Annexin V-FITC/PI试剂盒(Elabscience) 阅读提示:Methods 2.8 |
| 细胞周期分析 | 细胞数5×10^5,PI染色,流式细胞仪 阅读提示:Methods 2.9 |
| RNA测序 | 每组N=3,平台Illumina NovaSeq 6000,差异基因筛选标准 阅读提示:Methods 2.10 |
| 机制研究 | RAR拮抗剂AGN193109的使用,浓度文中未明确说明 阅读提示:Methods 3.5,Figure 5 |