临床队列粪便SCFAs分析
探究食物过敏和食物致敏耐受儿童粪便中SCFAs水平与健康对照的差异。
招募食物过敏(FA)儿童20例、食物致敏耐受(FST)儿童20例和健康对照(HC)儿童20例,采集粪便样本,分析乙酸、丙酸、丁酸和戊酸浓度。
Butyrate alleviates food allergy by improving intestinal barrier integrity through suppressing oxidative stress-mediated Notch signaling.
包含临床样本、OVA小鼠模型、细胞实验和多种组学分析,且进行了功能和机制验证。
OVA致敏的BALB/c小鼠模型 IEC-6大鼠小肠隐窝上皮细胞 RBL-2H3大鼠嗜碱性粒细胞白血病细胞 儿童粪便样本
OVA致敏小鼠的致敏和激发方案(腹腔注射50μg OVA加1mg铝钾佐剂,第0和14天;口服50mg OVA,第28、30、32、34、36天) 丁酸盐及其他SCFAs的给药浓度和方式(丁酸盐200mM,醋酸盐100mM,丙酸盐100mM,戊酸盐100mM,饮用水) IEC-6细胞处理条件(OVA 200μg/mL,丁酸盐0.25-5mM,H2O2 200μM) Notch信号通路相关分子(Jagged1、Hes1、NICD)及紧密连接蛋白(ZO-1、Occludin、E-Cadherin)的表达检测 氧化应激相关指标(ROS、GSH、SOD、CAT)的测定
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究食物过敏和食物致敏耐受儿童粪便中SCFAs水平与健康对照的差异。
招募食物过敏(FA)儿童20例、食物致敏耐受(FST)儿童20例和健康对照(HC)儿童20例,采集粪便样本,分析乙酸、丙酸、丁酸和戊酸浓度。
比较不同SCFAs对OVA诱导的食物过敏小鼠的缓解作用。
BALB/c小鼠分为NC、OVA、丁酸盐、醋酸盐、丙酸盐、戊酸盐组,通过腹腔注射OVA和铝佐剂致敏,口服OVA激发,并在饮水中给予相应SCFAs,评估过敏症状评分、血清OVA-sIgE、组胺、mMCP-1、细胞因子和Treg频率。
评估丁酸盐对OVA诱导的肠道黏膜结构和屏障功能的影响。
对小鼠空肠组织进行H&E、AB-PAS染色,观察形态结构、杯状细胞数量;通过免疫荧光检测ZO-1、Occludin和Muc2表达;检测血清DAO和d-LA水平。
探究丁酸盐对OVA诱导的肠道菌群结构和代谢物组成的影响。
对小鼠粪便进行16S rRNA测序分析菌群结构(α多样性、β多样性、LDA和LEfSe),并使用UPLC-MS分析非靶向代谢组,进行PCA、OPLS-DA和KEGG富集分析。
揭示丁酸盐对OVA诱导的IECs转录组的影响,并验证Notch通路相关基因表达。
对小鼠IECs进行RNA-seq分析差异表达基因和KEGG通路富集,并通过qRT-PCR验证Notch1、Jagged1、Hes1的mRNA水平。
验证OVA诱导的氧化应激是否通过激活Notch信号通路损害肠道屏障,以及丁酸盐的调节作用。
检测IECs中ROS水平、血清和小肠组织中GSH、SOD和CAT水平;检测IECs中Muc2、ZO-1、Occludin-1、Claudin-1、E-Cadherin的mRNA表达;在IEC-6细胞中,使用抗氧化剂EUK-134和γ-分泌酶抑制剂DAPT进行干预,检测Notch通路蛋白和紧密连接蛋白表达。
探究不同浓度丁酸盐对OVA诱导的氧化应激和Notch信号通路的影响。
在IEC-6细胞中,用OVA(200μg/mL)处理24h,同时或随后给予不同浓度丁酸盐(0.25, 0.5, 0.75, 1, 2, 5mM),检测ROS、抗氧化指标、Jagged1/Hes1 mRNA、以及紧密连接蛋白表达。
验证丁酸盐对氧化应激诱导的Notch信号激活的抑制作用。
IEC-6细胞用0.75mM丁酸盐预处理1小时,然后加入200μM H2O2培养4小时,检测ROS、抗氧化指标、Notch通路蛋白表达及核转位。
评估丁酸盐处理小鼠后上调的潜在抗过敏代谢物对肥大细胞脱颗粒的影响。
RBL-2H3细胞用鸡蛋过敏患者血清(1:25稀释)致敏24h,然后加入50μM代谢物(龙胆苦苷、6-姜酚、油酰乙醇胺、吲哚-3-甲醛、5-羟基吲哚乙酸、N-甲基血清素、N-乙酰血清素)处理1h,再用30μg/mL OVA激发1h,检测β-己糖胺酶释放率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 过敏原和佐剂 | 卵清蛋白 | Sigma-Aldrich | A5503 |
| 硫酸铝钾 | Sigma-Aldrich | A7210 | |
| 丁酸盐补充 | 丁酸钠 | -- | -- |
| ELISA检测 | OVA特异性IgE检测试剂盒 | CUSABIO | CSB-E08914m |
| 组胺检测试剂盒 | Elabscience | E-EL-0032 | |
| 小鼠肥大细胞蛋白酶1检测试剂盒 | Invitrogen | 88-7503-22 | |
| 细胞因子检测 | IL-4检测试剂盒 | CUSABIO | CSB-E04634m |
| IL-13检测试剂盒 | CUSABIO | CSB-E04602m | |
| IL-10检测试剂盒 | CUSABIO | CSB-E04594m | |
| 流式细胞术 | 佛波醇-12-十四酸酯-13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | P8139 |
| 离子霉素 | Sigma-Aldrich | I3909 | |
| 布雷菲德菌素A | Sigma-Aldrich | B5936 | |
| FITC标记的抗小鼠CD4抗体 | BD Biosciences | 553046 | |
| PE标记的抗小鼠CD25抗体 | BD Biosciences | 553075 | |
| Foxp3转录因子缓冲液套装 | eBioscience | 00-5523-00 | |
| Alexa Fluor 647标记的抗小鼠Foxp3抗体 | BD Biosciences | 560401 | |
| APC标记的抗小鼠IFN-γ抗体 | BD Biosciences | 554413 | |
| PE标记的抗小鼠IL-4抗体 | BD Biosciences | 554435 | |
| 肠道屏障功能检测 | 二胺氧化酶检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A088-3-1 |
| 细胞实验 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| IECs分离 | 二硫苏糖醇 | Beyotime | ST043 |
| qRT-PCR | 总RNA提取试剂盒 | Vazyme | R711-01 |
| HiScript®第一链cDNA合成试剂盒 | Vazyme | R323-01 | |
| ChamQ通用型SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q712-02 | |
| 细胞实验 | EUK-134 | MCE | HY-100594 |
| DAPT | MCE | -- | |
| 抗氧化检测 | 超氧化物歧化酶检测试剂盒 | Solarbio | BC516 |
| 谷胱甘肽检测试剂盒 | Solarbio | BC1175 | |
| 过氧化氢酶检测试剂盒 | Solarbio | BC4785 | |
| 活性氧检测 | DCFH-DA探针 | Beyotime | S0034S |
| 代谢物处理 | 龙胆苦苷 | -- | -- |
| 6-姜酚 | -- | -- | |
| 吲哚-3-甲醛 | -- | -- | |
| 5-羟基吲哚乙酸 | -- | -- | |
| N-甲基血清素 | -- | -- | |
| N-乙酰血清素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 儿童分组标准(FA、FST、HC),粪便样本采集和储存条件,SCFAs检测方法 阅读提示:METHODS: Study subjects and sample collection; Methods: SCFAs assessments (not detailed in main text, likely in supplement) |
| OVA诱导小鼠模型 | 小鼠品系、周龄和性别(BALB/c雌性4周龄),致敏和激发方案(OVA剂量、佐剂、时间点),SCFAs给药浓度和方式 阅读提示:METHODS: Mice; Food allergy model |
| 细胞实验 | IEC-6和RBL-2H3细胞培养条件,OVA、H2O2、丁酸盐、EUK-134、DAPT的处理浓度和时间 阅读提示:METHODS: Rat small intestine crypt epithelial cells (IEC-6); Induction of OS in IEC-6 cells by H2O2; Rat basophil leukemia cells (RBL-2H3) |
| 机制验证 | RNA-seq差异基因阈值(FDR≤0.05,FC≥1.5),qRT-PCR引物序列,Western blot抗体信息 阅读提示:METHODS: Quantitative real-time PCR (qRT-PCR); Results: Butyrate improved intestinal barrier integrity via inhibiting oxidative stress (OS)-mediated Notch signaling; Figure 5 and Figure 7 legends |
| 数据分析与统计 | 统计方法(t检验、ANOVA、卡方检验),显著性水平(p<0.05),样本量 阅读提示:METHODS: Statistical analysis |