高内涵筛选天然产物
鉴定具有抗衰老活性的天然化合物
使用复制性衰老IMR-90细胞模型,筛选805种天然产物(10μM处理3天),检测SA-β-Gal、核面积等指标;再通过HUVEC多种衰老模型、MEF和L02验证,最终确定GAA为候选化合物
High-content screening identifies ganoderic acid A as a senotherapeutic to prevent cellular senescence and extend healthspan in preclinical models.
涵盖体外细胞模型、线虫、多种小鼠模型(早衰、自然老龄、肥胖)及蛋白质组学,并包含功能验证(如核糖体抑制、基因敲低)和机制验证(CETSA、DARTS、磷酸化检测)。
IMR-90细胞 HUVEC C57BL/6J小鼠(照射诱导早衰、自然老龄、西方饮食诱导肥胖模型) 秀丽隐杆线虫
高内涵筛选:805种天然产物,IMR-90细胞复制性衰老模型,10μM处理3天 GAA浓度及处理时间:体外10μM,线虫10-1000μM,小鼠15mg/kg或饮食120mg/kg 照射模型:2.8Gy全身照射,GAA或DQ给药方案(15mg/kg vs 5+50mg/kg) 自然老龄小鼠:16月龄开始,饮食添加GAA 6个月,n=40 vs 46 机制验证:TCOF1敲低、CX-5461及放线菌酮处理、OPP掺入检测核糖体功能
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定具有抗衰老活性的天然化合物
使用复制性衰老IMR-90细胞模型,筛选805种天然产物(10μM处理3天),检测SA-β-Gal、核面积等指标;再通过HUVEC多种衰老模型、MEF和L02验证,最终确定GAA为候选化合物
评估GAA在不同细胞类型和线虫中的抗衰老作用
在多种哺乳动物细胞(如3T3-L1, C2C12等)中检测GAA对SA-β-Gal、LDH、核面积、EdU掺入的影响;在线虫中测定寿命、健康寿命指标(应激抵抗、脂褐素、ROS、脂质、运动功能)
检测GAA是否引起异常增殖或损伤
对中年小鼠饲喂含GAA饮食3个月,检测血清和组织中GAA水平,生化指标(CKMB、肌酐、ALT),组织病理和增殖标志物(Ki67);对荷瘤小鼠腹腔注射GAA;体外检测多种年轻细胞和癌细胞增殖、迁移
评估GAA对辐射诱导衰老小鼠的预防和治疗作用
小鼠预先灌胃GAA 5天,然后低剂量全身照射(2.8Gy),随后给予GAA或DQ或对照(每3天一次),评估衰老细胞积累、组织病理、器官功能、体力表现
评估GAA对自然衰老小鼠健康寿命的改善
16月龄小鼠饮食添加GAA 6个月,监测生存率、虚弱指数、衰老标志物、器官功能、体力、代谢和认知功能
评估GAA对西方饮食诱导肥胖小鼠年龄相关表型的改善
小鼠先高脂饮食16周,然后腹腔注射GAA 12周,评估体重、衰老细胞、器官功能、纤维化、体力、骨微结构、代谢指标
揭示GAA预防细胞衰老的分子机制
对老年小鼠和衰老细胞进行蛋白质组学分析,发现核糖体通路变化;使用OPP掺入评估翻译功能;通过CX-5461和CHX抑制核糖体功能,以及siRNA敲低核糖体蛋白RPL7/RPL32,观察对GAA效应的影响
寻找GAA的直接蛋白靶点并验证结合
通过HuProt蛋白质芯片筛选GAA结合蛋白,分子对接预测,CETSA和DARTS实验验证GAA与TCOF1的直接结合,并检测磷酸化水平变化
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 高内涵筛选 | Operetta CLS高内涵成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞损伤检测 | LDH检测液 | Beyotime | -- |
| 细胞增殖检测 | EdU(5-乙炔基-2'-脱氧尿苷) | Beyotime | -- |
| 细胞培养 | 结晶紫 | Beyotime | -- |
| 线虫实验 | 雷帕霉素 | -- | -- |
| DCFH-DA探针 | Beyotime | -- | |
| 尼罗红 | Sigma | -- | |
| 动物实验 | 灵芝酸A | Chengdu Pufei De Biotech Co., Ltd | -- |
| 达沙替尼 | Sigma | -- | |
| 槲皮素 | Sigma | -- | |
| 西方饮食 | TP 26304 | -- | |
| D-葡萄糖 | Sigma | -- | |
| 血液生化分析 | ELISA试剂盒 | Elabscience | -- |
| 总胆固醇、高密度脂蛋白胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇、甘油三酯、游离脂肪酸检测试剂 | Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| 组织学分析 | Masson三色染色试剂盒 | Solarbio | -- |
| 油红O | Sigma | -- | |
| 免疫组化/免疫荧光 | γ-H2AX抗体 | Cell Signaling Technology | 9718S |
| p16INK4a抗体 | Cell Signaling Technology | 18769S | |
| 免疫荧光 | 羊抗兔IgG (H+L) Superclonal二抗,Alexa Fluor 555 | Thermo Scientific | A27039 |
| 免疫印迹 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| p53抗体 | Cell Signaling Technology | 2524S | |
| p53抗体 | Proteintech | 10442-1-AP | |
| p16INK4a抗体 | Abcam | ab211542 | |
| p16INK4a抗体 | Proteintech | 10883-1-AP | |
| p21抗体 | Proteintech | 27296-1-AP | |
| p21抗体 | Abcam | ab188224 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118L | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 蛋白质组学分析 | 胰蛋白酶 | Promega | -- |
| LTQ-Orbitrap Velos质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| 二硫苏糖醇 | Sigma | -- | |
| 超滤管(10k) | Vivacon | -- | |
| OPP实验 | Click-iT Plus OPP Alexa Fluor 488试剂盒 | Thermo Fisher | C10456 |
| 基因沉默 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 蛋白芯片 | HuProt 20K人类蛋白质组芯片 | CDI Laboratories | -- |
| Cy5-链霉亲和素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| GenePix 4000B扫描仪 | Axon Instruments | -- | |
| CETSA/DARTS | 链霉蛋白酶 | -- | -- |
| Lambda蛋白磷酸酶 | -- | -- | |
| 磷酸化检测 | Phos-assay磷酸化检测试剂 | Vazyme | -- |
| 代谢评估 | 血糖仪 | Roche | -- |
| 体成分分析 | Minispec LF50体成分分析仪 | Bruker | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 高内涵筛选 | IMR-90细胞初始衰老程度、化合物浓度(10μM)、处理时长(3天)、筛选阈值(SA-β-Gal减少30%以上) 阅读提示:Methods: High-content screening; Fig. 1a |
| 细胞衰老诱导 | 细胞来源、诱导方法(复制、H2O2、依托泊苷及混合)、诱导时间和浓度(例如H2O2 125μM 4h) 阅读提示:Methods: Cell culture and senescence induction; Supplementary Table 2 |
| 线虫实验 | 线虫株(N2)、培养条件(20°C)、药物浓度(雷帕霉素100μM,GAA 10/100/1000μM)、处理时间(寿命分析全程,氧化应激等7天预处理) 阅读提示:Methods: Aging-related phenotypes analysis in C. elegans, Lifespan analysis |
| 照射诱导早衰小鼠模型 | 小鼠品系和年龄(C57BL/6J,2月龄)、GAA预防剂量和时长(15mg/kg灌胃5天)、照射剂量(2.8Gy,1Gy/min)、后续治疗给药方案(每3天一次,共21天) 阅读提示:Methods: IR-stimulated mice; Fig. 4a |
| 自然老龄小鼠实验 | 小鼠年龄(16月龄)、GAA饮食浓度(120mg/kg饮食)、处理时长(6个月)、雄鼠样本量(n=40 vs 46) 阅读提示:Methods: Natural aging mice (aged 22 months); Fig. 5a |
| 西方饮食诱导肥胖模型 | 饮食组成(42%脂肪)、诱导时长(16周)、GAA给药途径及剂量(腹腔注射15mg/kg每3天一次)、干预时长(12周) 阅读提示:Methods: Western diet-induced obesity in mice; Fig. 7a |
| 机制验证(核糖体功能) | OPP浓度(10μM)和标记时间(30min)、CX-5461和CHX浓度(125nM)及处理时间(5天)、siRNA敲低条件 阅读提示:Methods: OPP assay, Gene silencing; Fig. 8 |
| GAA靶点验证 | HuProt芯片孵育条件(生物素化GAA)、CETSA温度梯度(47-71°C)、DARTS蛋白酶和磷酸酶浓度(pronase 5mg/ml,Lambda磷酸酶70U)、GAA处理浓度和时间(10μM 6天或100μM 2h) 阅读提示:Methods: Proteome microarray assays, CETSA, DARTS assay; Fig. 9 |