CHCHD2 挽救 Mohr-Tranebjaerg 综合征患者 iPSC 衍生神经元的线粒体功能障碍

CHCHD2 rescues the mitochondrial dysfunction in iPSC-derived neurons from patient with Mohr-Tranebjaerg syndrome.

作者信息Yihua Huang, Zirui Chen, Weiling Deng, Yawei Jiang, Yue Pan, Zhirong Yuan, Hailiang Hu, Yongming Wu, Yafang Hu
PMID40075073
发布时间2025-03-12
DOI10.1038/s41419-025-07472-9

实验完整度

涉及患者 iPSC 模型、CRISPR/Cas9 同基因对照、神经元分化、线粒体功能分析、RNA-seq 和过表达挽救实验等多个验证层级。

主要模型

MTS 患者 iPSC 衍生的神经元 CRISPR/Cas9 编辑的等基因 MUT-iPSC 衍生的神经元 CTRL-iPSC 衍生的神经元

重点核对

TIMM8A 突变:c.225-229del, p.Q75fs95* 神经元分化时间:53 天 氧化应激处理:100 µM TBHP 处理 24 小时 CHCHD2 过表达:慢病毒载体(pKD-Flag-IRES2-Puro) 统计分析:one-way 或 two-way ANOVA,Tukey 事后检验;两组间采用双尾非配对 t 检验

摘要

Mohr-Tranebjaerg 综合征(MTS)是一种罕见的 X 连锁隐性神经退行性疾病,由线粒体内膜转位酶 8A(TIMM8A)基因突变引起,该基因编码定位于线粒体膜间空间(IMS)的蛋白 TIMM8a。MTS 的病理生理学仍知之甚少。为了探究 MTS 的分子机制,我们从一个携带新型 TIMM8A 突变(c.225-229del,p.Q75fs95*)的男性 MTS 患者中建立了诱导多能干细胞(iPSCs),称为 MTS-iPSCs。为了产生同基因对照,我们使用成簇规律间隔短回文重复序列/CRISPR 相关蛋白 9(CRISPR/Cas9)将相同突变引入健康对照 iPSCs(CTRL-iPSCs),得到突变 iPSCs(MUT-iPSCs)。我们将三个 iPSC 系分化为神经元,并评估了它们的线粒体功能和神经元发育。MTS-和 MUT-iPSCs 均表现出受损的神经元分化,其特征在于 iPSC 衍生神经元的胞体较小、分支较少和神经突较短。此外,这些神经元在应激条件下对凋亡的敏感性增加,表现为细胞色素 c 和 cleaved caspase-3 水平升高。线粒体功能分析显示,MTS-和 MUT-神经元中复合物 IV 的蛋白水平和活性降低,ATP 合成减少,活性氧(ROS)生成增加。此外,透射电子显微镜显示 MTS-神经元中的线粒体碎片化。RNA 测序鉴定了参与轴突发生、突触活性和凋亡相关通路的差异表达基因(DEGs)。在这些 DEGs 中,编码线粒体 IMS 蛋白、对线粒体稳态至关重要的卷曲螺旋-螺旋-卷曲螺旋-螺旋结构域蛋白 2(CHCHD2)在 MTS-神经元中显著下调。Western blot 分析证实 MTS-和 MUT-神经元中 CHCHD2 蛋白水平均降低。在 MTS-神经元中过表达 CHCHD2 可挽救线粒体功能障碍并促进神经突伸长,表明 CHCHD2 在 MTS 发病机制中作为 TIMM8a 的下游效应分子。总之,TIMM8a 功能丧失导致下游 CHCHD2 水平降低,通过破坏线粒体稳态共同损害神经发生。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
MTS 中 TIMM8A 突变如何导致线粒体功能障碍和神经元发育缺陷?
核心机制
TIMM8a 功能缺失导致下游 CHCHD2 水平降低,进而破坏线粒体稳态,导致复合物 IV 活性和 ATP 合成降低、ROS 增加、对氧化应激诱导的凋亡敏感性增加,最终损害神经发生。
主要证据
通过患者 iPSC 衍生神经元和 CRISPR/Cas9 生成的同基因 MUT 神经元,观察到复合物 IV 活性下降、ATP 减少、ROS 增加、神经元分化缺陷;RNA-seq 发现 CHCHD2 下调;Western blot 确认蛋白减少;CHCHD2 过表达可改善线粒体功能和神经突生长。
研究意义
提示 CHCHD2 过表达可能作为 MTS 的潜在治疗策略,并为理解 TIMM8a 在神经退行性变中的作用提供线索。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立 iPSC 模型

从患者和健康供体获取 iPSC,并通过 CRISPR/Cas9 引入相同突变以生成同基因对照。

从 MTS 患者和健康男性供体的 PBMC 中重编程获得 iPSC;使用 CRISPR/Cas9 在 CTRL-iPSCs 中引入 c.225-229del 突变;通过 Sanger 测序、Western blot 和多能性标记验证。

2

神经元分化

将 iPSC 分化为神经元以评估 TIMM8A 突变对神经发育的影响。

采用单层分化方案,通过双 SMAD 抑制,依次获得神经上皮细胞、NPC 和成熟神经元(53 天);通过免疫染色和 Western blot 检测 NPC 和神经元标记物,并进行形态学分析。

3

线粒体功能分析

检测 TIMM8A 突变对神经元线粒体功能的影响。

分离线粒体,通过 Western blot 检测复合物 IV 亚基 COX4;使用试剂盒测定复合物 IV 活性、ATP 水平和 ROS 水平;通过 TEM 分析线粒体形态。

4

凋亡敏感性评估

评估 TIMM8A 突变在氧化应激条件下对神经元凋亡的敏感性。

用 100 μM TBHP 处理神经元 24 小时,通过 Western blot 检测胞质中 cytochrome c 和 cleaved caspase-3 水平。

5

RNA-seq 和差异表达基因分析

识别 MTS 神经元中受影响的基因和通路,特别是与线粒体和神经发育相关的 DEGs。

对第 53 天的神经元进行 RNA-seq,筛选差异表达基因,进行 GO 和 KEGG 通路富集分析,并验证候选基因(如 CHCHD2)的蛋白水平。

6

CHCHD2 过表达挽救实验

验证 CHCHD2 过表达是否能挽救 MTS 神经元的线粒体功能障碍和神经发育缺陷。

通过慢病毒感染构建稳定表达 CHCHD2-Flag 的 iPSC,分化后检测 ATP、ROS、线粒体形态、COX4 水平以及 TBHP 处理后的凋亡指标,并评估神经突生长。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
Matrigel 基质胶Corning356234
mTeSR Plus 培养基STEMCELL Technologies100-0276
CytoTune-iPS 2.0 Sendai 重编程试剂盒Thermo Fisher ScientificA16517
Accutase 细胞分离液STEMCELL Technologies07920
pX330-2A-Puro 质粒----
人干细胞核转染试剂盒LonzaVPH-5022
Y-27632Selleck ChemicalsS1049
嘌呤霉素BeyotimeST551
DMEM/F12 培养基Gibco11320033
Neurobasal 培养基Gibco21103049
N2 补充剂Gibco17502048
B27 补充剂Gibco17504044
GlutaMAX 补充剂Gibco35050061
非必需氨基酸补充剂Gibco11140050
人胰岛素Sigma-AldrichI9278
SB431542Selleck ChemicalsS1067
dorsomorphinSelleck ChemicalsS7306
碱性成纤维细胞生长因子PeproTech100-18B
胶质细胞源性神经营养因子PeproTech450-10
脑源性神经营养因子PeproTech450-02
多聚赖氨酸----
层粘连蛋白----
线粒体分离试剂盒Abcamab110170
TRIzol 试剂Sigma-AldrichT3934
HiScript III RT SuperMix 用于 qPCRVazymeR323-01
ChamQ 通用 SYBR qPCR 预混液VazymeQ711-02
QuantStudio 3 仪器Thermo Fisher--
含 DAPI 的抗荧光淬灭封片剂SolarbioS2110
抗 NANOG 抗体Cell Signaling Technology3580
抗 OCT4 抗体Santa Cruzsc-5279
抗 SOX2 抗体R&D SystemsMAB2018
抗 SSEA4 抗体Abcamab16287
抗 PAX6 抗体BiolegendPRB-278P
抗 SOX1 抗体R&D SystemsAF3369-SP
抗 Nestin 抗体MilliporeABD69
抗 TUJ1 抗体GeneTexGTX130245
抗 MAP2 抗体Cell Signaling Technology4542
抗 SOX2 抗体Cell Signaling Technology2748
抗 PAX6 抗体BiolegendPRB-278P
抗 Nestin 抗体MilliporeABD69
抗 TIMM8A 抗体Proteintech11179-1-AP
抗 HSP60 抗体Proteintech15282-1-AP
抗 TOMM40 抗体Proteintech18409-1-AP
抗 TIMM23 抗体Proteintech11123-1-AP
抗 COX4 抗体Proteintech11242-1-AP
抗细胞色素 c 抗体Proteintech10993-1-AP
抗裂解的 caspase-3 抗体Cell Signaling Technology9661
抗 BCL-2 抗体ABclonalA19693
抗 BAX 抗体Proteintech60267-1-Ig
抗 CHCHD2 抗体Proteintech19424-1-AP
抗 Flag 抗体Proteintech66008-4-Ig
抗 β-微管蛋白抗体Proteintech66240-1-Ig
HRP 标记的山羊抗兔 IgG(H+L) 抗体ProteintechSA00001-2
HRP 标记的山羊抗小鼠 IgG(H+L) 抗体ProteintechSA00001-1
自动化化学发光成像系统Tanon--
CellTiter-Glo 发光细胞活力检测试剂盒PromegaG7570
DCFDA/H2DCFDA 细胞 ROS 检测试剂盒Abcamab113851
细胞线粒体复合物 IV(细胞色素 C 氧化酶)活性检测试剂盒ElabscienceE-BC-K837-M
pKD-Flag-IRES2-Puro 转移质粒----
pMD2.G 包膜质粒----
psPAX2 包装质粒----
Lipofectamine 3000 转染试剂InvitrogenL3000015
透射电子显微镜(HITACHI-H7500)Hitachi--
GraphPad Prism 9 软件GraphPad Software--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
iPSC 建立
PBMC 来源、重编程试剂盒、培养条件(mTeSR Plus 等)、传代比例
阅读提示:Materials and methods: Generation of iPSCs from PBMCs
CRISPR/Cas9 基因编辑
sgRNA 序列、ssODN 序列、电穿孔参数(细胞数、质粒量)、筛选浓度(嘌呤霉素)
阅读提示:Materials and methods: CRISPR/Cas9-mediated generation of the TIMM8A mutation in CTRL-iPSCs
神经元分化
分化时间、培养基成分(N2B27)、因子(SB431542, dorsomorphin, bFGF, GDNF, BDNF)、细胞密度
阅读提示:Materials and methods: Differentiation of iPSCs into neurons
线粒体功能检测
线粒体分离试剂盒、复合物 IV 活性试剂盒、ATP/ROS 检测试剂盒及细胞密度
阅读提示:Materials and methods: Isolation of mitochondria, ATP measurement, ROS measurement, Activity analysis of mitochondrial complex IV
凋亡敏感性评估
TBHP 浓度和处理时间、Western blot 检测 Cyt c 和 cleaved caspase-3
阅读提示:Results: TIMM8A mutation causes mitochondrial dysfunction..., Figure 3H-I
CHCHD2 过表达
慢病毒包装质粒和比例、感染 MOI、嘌呤霉素筛选浓度
阅读提示:Materials and methods: Construction of stable cell lines overexpressing CHCHD2