TBI后NETs的检测
验证TBI后脑组织和循环中NETs是否增加
通过Western blot检测脑组织中NE和citH3表达,免疫荧光检测NE+citH3+细胞及血管周围NETs,并检测患者和动物血浆中dsDNA浓度。
NINJ1-mediated plasma membrane rupture of pyroptotic endothelial cells exacerbates blood-brain barrier destruction caused by neutrophil extracellular traps in traumatic brain injury.
包含体外细胞实验(hCMEC/D3)、体内动物模型(小鼠TBI模型)、患者样本(脑组织和血液)等多个证据层级,并进行了功能验证(NINJ1敲低)和机制验证(TLR4/NF-κB通路)。
人脑微血管内皮细胞系(hCMEC/D3) 小鼠创伤性脑损伤模型(Feeney's weight-drop) TBI患者脑组织和血液样本
NETs浓度(100 ng/mL和500 ng/mL)及刺激时间(24小时) TLR4抑制剂TAK-242给药剂量(3 mg/kg,腹腔注射)及时间(TBI后30分钟,连续3天) PAD4抑制剂Cl-amidine给药剂量(50 mg/kg,腹腔注射)及时间(TBI后10分钟,连续3天) AAV-TIE-shNINJ1注射剂量(1.20×10^13 v.g/mL)及时间(TBI前21天,侧脑室注射) TBI模型参数(100g重量从5cm高度落下)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TBI后脑组织和循环中NETs是否增加
通过Western blot检测脑组织中NE和citH3表达,免疫荧光检测NE+citH3+细胞及血管周围NETs,并检测患者和动物血浆中dsDNA浓度。
验证NETs是否导致BBB破坏
体外用NETs刺激hCMECs检测紧密连接蛋白表达;体内使用PAD4抑制剂Cl-amidine抑制NETs形成后,检测紧密连接蛋白表达和Evans blue渗出。
验证NETs是否通过TLR4/NF-κB通路诱导bEC焦亡
体外用NETs刺激hCMECs,使用TAK-242或DNase I处理,检测NF-κB磷酸化和焦亡相关蛋白;体内小鼠给予TAK-242,检测脑血管成分中相关蛋白表达。
验证NINJ1是否在焦亡bEC中激活并介导PMR
体外用LPS+nigericin诱导hCMECs焦亡,免疫荧光检测NINJ1聚集;敲低NINJ1后检测LDH和HMGB1释放;体内检测NINJ1表达和定位。
验证敲低NINJ1是否通过减少HMGB1释放从而减少NET形成和BBB破坏
通过AAV-TIE-shNINJ1敲低bEC中的NINJ1,检测血浆HMGB1浓度、中性粒细胞和NET标志物、焦亡相关蛋白、紧密连接蛋白表达、Evans blue渗出及神经功能评分。
验证NINJ1敲低是否改善TBI后的神经功能
通过Western blot检测cleaved caspase-3,免疫荧光检测凋亡神经元,并进行mNSS评分。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Prigrow I 培养基 | Applied Biological Materials | TM001 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 151140122 | |
| siRNA转染 | jetPRIME转染试剂 | Polyplus | 101000046 |
| 药物处理 | TAK-242 | MedChemExpress | HY-11109 |
| 脱氧核糖核酸酶I | Beyotime | D7073 | |
| 脂多糖 | MedChemExpress | HY-D1056 | |
| 尼日利亚霉素 | TargetMol | T3092 | |
| Cl-amidine | GLPBIO | GC35706 | |
| dsDNA定量 | dsDNA高灵敏度检测试剂盒 | Yeasen | 12640ES60 |
| LDH检测 | LDH细胞毒性检测试剂盒 | Beyotime | C0016 |
| ELISA | 小鼠HMGB1 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0676 |
| 人HMGB1 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H1554 | |
| 中性粒细胞分离 | 人外周血中性粒细胞分离试剂盒 | Solarbio | P9040 |
| NET诱导 | 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | MedChemExpress | HY-18739 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 磷酸酶抑制剂混合物2 | Sigma-Aldrich | P5726 | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| Western blot stripping缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | 21059 | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Beyotime | P0096 |
| DAPI | Beyotime | C1005 | |
| Evans blue渗漏 | 伊文思蓝 | Aladdin | E104208 |
| Multiskan SkyHigh酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TBI模型 | 小鼠品系、年龄、体重;损伤参数(重量、高度、位置) 阅读提示:Methods: Weight-drop injury model |
| NETs检测 | 时间点(TBI后3天)、检测标志物(citH3、NE、dsDNA) 阅读提示:Methods: Quantification of plasma dsDNA, Results 第一部分 |
| NETs对BBB的影响 | NETs浓度(100, 500 ng/mL)、刺激时间(24h);Cl-amidine给药剂量(50 mg/kg)、时间(TBI后10min,连续3天) 阅读提示:Methods: In vivo drug administration, 图2图注 |
| TLR4/NF-κB通路验证 | TAK-242浓度(30μM体外,3mg/kg体内)、给药时间(TBI后30min,连续3天);检测蛋白(p-NF-κB、GSDMD-N、caspase-1) 阅读提示:Methods: Drug treatment and induction of pyroptosis in vitro, Results 第三部分 |
| NINJ1敲低实验 | AAV-TIE-shNINJ1滴度(1.20×10^13 v.g/mL)、注射体积(4μL)、注射时间(TBI前21天) 阅读提示:Methods: Adeno-associated virus (AAV) injection |
| BBB完整性检测 | Evans blue注射剂量(3mL/kg)、循环时间(2h)、检测时间(TBI后3天和7天) 阅读提示:Methods: Evans blue extravasation |
| 神经功能评估 | mNSS评分时间和标准 阅读提示:Methods: Neurological function assessment |