临床样本收集与表型分析
验证AMA胎盘是否表现出衰老表型、氧化损伤和YAP表达变化。
收集AMA和年轻孕妇的足月胎盘组织,进行SA-β-Gal染色、IHC和Western blot检测衰老标志物、8-OHdG和YAP表达。
Placental trophoblast aging in advanced maternal age is related to increased oxidative damage and decreased YAP.
包含人胎盘组织样本、细胞模型(HTR8/SVneo)及分子干预(敲低/过表达)和转录组测序,但未涉及动物模型或类器官验证。
人足月胎盘组织(AMA与年轻孕妇) HTR8/SVneo滋养层细胞系
AMA组与对照组年龄范围分别为35-45岁和25-30岁,样本量n=23和n=19 H2O2处理浓度IC50为25μM,处理时间为30分钟 YAP敲低使用shRNA(序列GCCACCAAGCTAGATAAAGAA),过表达使用质粒载体PLKO-puro和Plvx-puro SA-β-Gal染色阳性率在3个随机视野中计算,每个样本3个独立实验 RNA-seq差异表达基因筛选标准为|log2FC|≥1且padj≤0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证AMA胎盘是否表现出衰老表型、氧化损伤和YAP表达变化。
收集AMA和年轻孕妇的足月胎盘组织,进行SA-β-Gal染色、IHC和Western blot检测衰老标志物、8-OHdG和YAP表达。
探讨H2O2诱导的氧化损伤对HTR8/SVneo细胞衰老和YAP表达的影响。
用不同浓度和时间的H2O2处理HTR8/SVneo细胞,通过CCK-8确定IC50,然后观察处理后的细胞形态、SA-β-Gal染色、衰老标志物表达和8-OHdG水平。
评估YAP敲低对滋养层细胞衰老、功能(迁移、侵袭)和DNA损伤的影响。
使用sh-YAP质粒转染HTR8/SVneo细胞,通过Western blot验证敲低效率,检测衰老标志物和8-OHdG,并进行划痕愈合和Matrigel侵袭实验。
验证YAP过表达是否能减轻H2O2诱导的细胞衰老和DNA氧化损伤。
在HTR8/SVneo细胞中过表达YAP,用H2O2处理,检测衰老标志物、SA-β-Gal染色和8-OHdG水平。
揭示YAP敲低对滋养层细胞转录组的影响,寻找相关通路。
对sh-YAP和sh-NC HTR8/SVneo细胞进行RNA-seq,分析差异表达基因并进行GSEA富集分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | FSP500 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 氧化损伤处理 | 过氧化氢 | Sigma-Aldrich | 323381-25ML |
| 细胞活力检测 | CCK8检测试剂盒 | APExBIO | 1018 |
| 衰老检测 | 衰老相关β-半乳糖苷酶染色试剂盒 | Beyotime | C0602 |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 |
| 蛋白质印迹 | PVDF膜 | Sigma-Aldrich | -- |
| 抗YAP抗体 | Cell Signaling | 14074S | |
| 抗p53抗体 | Santa Cruz | sc-126 | |
| 抗p21抗体 | Cell Signaling | 2947 | |
| 抗p16抗体 | Santa Cruz | sc-166760 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Servicebio | GB15001-100 | |
| 抗GAPDH抗体 | Servicebio | GB15002-100 | |
| ECL增强化学发光系统 | Bio-Rad | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V/PI凋亡检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A211 |
| 免疫组织化学 | 抗8-OHdG抗体 | Santa Cruz | sc-393871 |
| 免疫荧光 | Alexa-Fluor 488二抗 | Cell Signaling | 34963 |
| Cy3标记二抗 | Servicebio | GB21303 | |
| 侵袭实验 | Matrigel基质胶 | Corning | 356234 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA-seq | 5300生物分析仪 | Agilent | -- |
| ND-2000分光光度计 | NanoDrop Technologies | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | AMA组年龄35-45岁,对照组25-30岁;样本量AMA n=19,对照组n=23;排除IUGR、PE、GDM等并发症;收集时间产后15分钟内 阅读提示:Materials and methods - Patient and specimen collection,表1 |
| 细胞培养 | HTR8/SVneo细胞来源ATCC;培养基RPMI 1640+10% FBS+1%青霉素链霉素;培养条件37°C、5% CO2 阅读提示:Materials and methods - Cell culture |
| H2O2处理 | H2O2浓度25μM,处理30分钟,细胞汇合度60%-70%;处理后将培养基换为正常完全培养基 阅读提示:Materials and methods - H2O2 treatment in HTR8/SVneo cells |
| YAP敲低与过表达 | shRNA靶序列GCCACCAAGCTAGATAAAGAA;质粒载体PLKO-puro和Plvx-puro;转染浓度和细胞汇合度(50%-70%),转染时间24小时 阅读提示:Materials and methods - Cell transfection |
| 转录组测序分析 | RNA提取使用TRIzol;差异表达基因筛选标准|log2FC|≥1且padj≤0.05;GSEA分析参数 阅读提示:Materials and methods - RNA sequencing |