CGE成分鉴定
明确CGE的主要化学成分,为后续机制研究提供物质基础。
采用UPLC-Q-Orbitrap-MS分析CGE,通过精确质量数、二级碎片和数据库比对,鉴定出81种化合物,主要分为萜类、黄酮类和苯丙素类。
Ethyl Acetate Extract of Cichorium glandulosum Activates the P21/Nrf2/HO-1 Pathway to Alleviate Oxidative Stress in a Mouse Model of Alcoholic Liver Disease.
包含体外成分鉴定(UPLC-MS)、体内动物模型(小鼠ALD模型)、转录组学和网络药理学分析,以及RT-qPCR和Western blot验证,具备多证据层级和机制验证。
C57BL/6J小鼠酒精性肝病模型 小鼠肝组织样本
动物模型:雄性SPF级C57BL/6J小鼠,6周龄,20±2g,随机分为5组,每组10只 造模方式:每日灌胃56%白酒(10 mL/kg)持续6周 给药剂量:CGE低剂量100 mg/kg,高剂量200 mg/kg,阳性对照水飞蓟素100 mg/kg 样本量:每组10只,生化检测n=6,转录组测序n=3 统计:one-way ANOVA,p<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确CGE的主要化学成分,为后续机制研究提供物质基础。
采用UPLC-Q-Orbitrap-MS分析CGE,通过精确质量数、二级碎片和数据库比对,鉴定出81种化合物,主要分为萜类、黄酮类和苯丙素类。
在体内评估CGE对酒精诱导的肝损伤和氧化应激的保护作用。
C57BL/6J小鼠(除对照组)每日灌胃56%白酒(10 mL/kg)持续6周建立ALD模型,同时给予CGE低剂量(10 mg/mL)或高剂量(20 mg/mL)溶液(10 mL/kg),水飞蓟素(10 mg/mL)作为阳性对照。
评估CGE对肝损伤、炎症和氧化应激标志物的影响。
通过H&E染色观察肝脏组织病理变化;测定血清ALT、AST、ALP水平,肝脏TNF-α、IL-1β、CXCL-10水平,以及血清T-AOC、T-SOD和肝脏MDA水平。
识别CGE调节的差异表达基因和相关信号通路,探索其抗氧化的分子机制。
对对照组、模型组和CGE-H组小鼠肝组织进行RNA-seq,分析差异表达基因,与氧化应激相关基因取交集,进行GO和KEGG富集分析,构建PPI网络并识别核心基因。
从化合物-靶点-疾病的角度预测CGE抗ALD氧化应激的关键靶点和通路,并与转录组结果整合。
基于CGE的81个化合物进行靶点预测,与ALD和氧化应激相关基因取交集,构建网络,进行GO和KEGG富集分析,并与转录组KEGG通路取交集,确定关键通路和基因。
验证转录组和网络药理学分析识别的七个抗氧化相关基因的表达变化。
提取肝组织RNA,逆转录后进行RT-qPCR,检测HMOX1、CDKN1A、THBD、RSAD2、BCL6、SLC2A4和TGFβ3的mRNA表达水平。
验证CGE对P21、Nrf2、HO-1和Keap1蛋白表达的影响,以确认通路激活。
提取肝组织蛋白,经SDS-PAGE电泳、转膜、抗体孵育和显色,检测P21、Nrf2、HO-1和Keap1的蛋白水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 成分鉴定 | ACQUITY UPLC I-Class HF系统 | Waters | -- |
| ACQUITY UPLC HSS T3色谱柱 | Waters | -- | |
| Thermo Orbitrap QE高分辨液质联用系统 | Thermo | -- | |
| 动物实验 | 56%白酒 | Beijing Red Star Co., Ltd. | 20190929 |
| 吐温-80 | Beijing Solarbio | T8360 | |
| 水飞蓟素 | Tianjin Tasly-Synthe Pharmaceutical Co., Ltd. | 350705027 | |
| 组织学 | Eclipse C-E显微镜 | Nikon | -- |
| 生化检测 | ALT检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C009-2-1 |
| AST检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C010-2-1 | |
| ALP检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A059-2 | |
| 炎症因子检测 | TNF-α ELISA试剂盒 | Shanghai Youxuan Biotechnology Co., Ltd. | YX-201407M |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Shanghai Youxuan Biotechnology Co., Ltd. | YX-091203M | |
| CXCL-10 ELISA试剂盒 | Shanghai Youxuan Biotechnology Co., Ltd. | YX-091610M | |
| 氧化应激检测 | T-AOC检测试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | E-BC-K136-M |
| T-SOD检测试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | E-BC-K020-M | |
| MDA检测试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | E-BC-K025-M | |
| 转录组测序 | TRNzol Universal RNA试剂盒 | TIANGEN | DP424 |
| Hieff NGS® Ultima双模式RNA文库制备试剂盒 | -- | -- | |
| RT-qPCR | PrimeScript RT试剂盒 | Takara Bio | RR047A |
| TB Green Premix Ex Taq II试剂盒 | Takara | RR047A | |
| Western blot | BCA试剂盒 | Beijing Solarbio | PC0020 |
| SDS-PAGE上样缓冲液 | Beijing Solarbio | P1040 | |
| Nrf2抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology Co., Ltd. | 80593-1-RR | |
| HO-1抗体 | Cell Signaling Technology | 43966 | |
| Keap1抗体 | Cell Signaling Technology | 8047 | |
| P21抗体 | Cell Signaling Technology | 37543 | |
| β-actin抗体 | Affinity Biosciences | AF7018 | |
| 二抗 | Affinity Biosciences | S0001 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、周龄、体重、性别、分组、每组数量、造模剂(56%白酒)剂量和频率、持续时间、饲养环境 阅读提示:参见2.3.1和2.3.2节 |
| CGE制备与给药 | CGE提取方法、给药剂量(100和200 mg/kg)、溶媒(1% Tween-80)、灌胃体积(10 mL/kg)、给药时间 阅读提示:参见2.1和2.3.2节 |
| 生化指标检测 | 血清AST、ALT、ALP检测试剂盒及货号,TNF-α、IL-1β、CXCL-10 ELISA试剂盒及货号,T-AOC、T-SOD、MDA检测试剂盒及货号 阅读提示:参见2.3.6和2.3.7节 |
| 转录组测序 | 每组样本数(n=3)、RNA提取试剂盒、文库构建试剂盒、测序平台、差异基因筛选标准(|log2(FC)|>1, p<0.05) 阅读提示:参见2.4.1和2.4.2节 |
| RT-qPCR验证 | 逆转录试剂盒、qPCR试剂盒、引物序列(Table S3)、内参基因、反应条件 阅读提示:参见2.6节和Table S3 |
| Western blot验证 | 蛋白提取方法、BCA定量、一抗及货号、二抗及货号、上样量、曝光方式 阅读提示:参见2.7节 |