建立铁死亡模型并评估敏感性
确定AML细胞对铁死亡诱导剂erastin的敏感性
用不同浓度erastin处理四种AML细胞系(Kasumi-1, HL-60, THP-1, U-937),MTS法检测细胞活力,计算IC50。
Exogenous dihomo-γ-linolenic acid triggers ferroptosis via ACSL4-mediated lipid metabolic reprogramming in acute myeloid leukemia cells.
包含体外细胞实验、脂质组学分析、CRISPR/Cas9基因敲除、体内异种移植瘤模型等多个证据层级。
Kasumi-1细胞系 HL-60细胞系 THP-1细胞系 U-937细胞系 BALB/c裸鼠异种移植瘤模型
AML细胞系:Kasumi-1、HL-60、THP-1、U-937(ATCC来源,STR验证) DGLA处理条件:浓度0-40 μM,处理24小时 ACSL4敲除细胞系:Kasumi-1细胞,CRISPR/Cas9介导,sgRNA序列特定 体内实验:BALB/c裸鼠,皮下接种Kasumi-1细胞(1×10^7),DGLA口服灌胃(5 mg/只/天) 铁死亡抑制剂:ferrostatin-1(2 μM)、liproxstatin-1(2 μM)、deferoxamine(100 μM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定AML细胞对铁死亡诱导剂erastin的敏感性
用不同浓度erastin处理四种AML细胞系(Kasumi-1, HL-60, THP-1, U-937),MTS法检测细胞活力,计算IC50。
确认erastin诱导的细胞死亡是铁死亡
使用多种细胞死亡抑制剂(凋亡、自噬、焦亡、铁死亡抑制剂)预处理后加入erastin,检测细胞活力;检测脂质ROS、MDA、Fe2+水平;TEM观察线粒体超微结构。
识别铁死亡过程中变化的脂肪酸
用erastin处理Kasumi-1细胞,提取脂质,LC-MS/MS分析脂肪酸谱。
确定哪些脂肪酸增强erastin的毒性或单独诱导死亡
将12种脂肪酸与erastin共处理AML细胞,检测细胞死亡;随后单独处理检测细胞活力。
确认外源性DGLA单独处理能否诱导AML细胞铁死亡
用DGLA处理AML细胞,检测细胞活力、脂质ROS、MDA、Fe2+水平,TEM观察线粒体形态,并使用铁死亡抑制剂验证死亡方式。
分析外源性DGLA对细胞脂质组成的影响
用DGLA处理Kasumi-1细胞,提取脂质,LC-MS/MS分析脂质类别和脂肪酸链组成。
评估ACSL4在DGLA诱导铁死亡中的作用
在Kasumi-1细胞中敲除ACSL4,验证敲除效率;检测ACSL4敲除对DGLA诱导的铁死亡、脂质过氧化、Fe2+和线粒体形态的影响。
评估DGLA在体内对AML肿瘤生长的抑制及ACSL4的作用
将稳定表达sgNC或sgACSL4的Kasumi-1细胞皮下注射到BALB/c裸鼠,待肿瘤生长后每日灌胃DGLA或对照,监测肿瘤体积和重量,检测脂质过氧化和Fe2+,TEM观察肿瘤组织。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Sigma | R8758 |
| 胎牛血清 | Cegrogen | A0500-3210 | |
| 药物处理 | 二甲基亚砜 | Solarbio | D8370 |
| Erastin | Selleck | S7242 | |
| 细胞死亡抑制 | Z-VAD-FMK | APExBIO | A1902 |
| 氯喹 | APExBIO | A8628 | |
| Z-YVAD-FMK | APExBIO | A8955 | |
| Ferrostatin-1 | Selleck | S7243 | |
| Liproxstatin-1 | Selleck | S7699 | |
| 去铁胺 | Selleck | S5742 | |
| 脂肪酸处理 | 二高-γ-亚麻酸 | NU-CHEK | -- |
| 细胞活力检测 | MTS细胞增殖比色检测试剂盒 | Promega | G3580 |
| 脂质过氧化检测 | BODIPY 581/591 C11 | Thermo Fisher | D3861 |
| BODIPY 665/676 | Thermo Fisher | B3932 | |
| 丙二醛检测试剂盒 | Solarbio | BC0025 | |
| 铁含量检测 | 铁检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K773-M |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Epizyme | PC101 |
| 蛋白酶抑制剂 | APExBIO | K1007 | |
| 磷酸酶抑制剂 | APExBIO | K1015-B | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量 | Sigma | 71285-M |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 |
| ACSL4抗体 | Abcam | ab155282 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Immunoway | YT0099 | |
| 辣根过氧化物酶标记山羊抗兔IgG | Immunoway | RS0002 | |
| 增强化学发光试剂 | Meilunbio | MA0186 | |
| 脂质组学分析 | 超高效液相色谱系统 | Shimadzu | Nexera LC-30A |
| QTRAP质谱仪 | Sciex | 6500+ | |
| 亲水相互作用色谱柱 | Phenomenex | -- | |
| C18色谱柱 | Phenomenex | -- | |
| 流式分析 | Accuri 6流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 蛋白印迹成像 | ChemiDoc Touch成像系统 | Bio-Rad | -- |
| 显微镜观察 | 透射电子显微镜 | FEI | Tecnai G2 |
| 基因敲除 | 嘌呤霉素 | Solarbio | P8230 |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | SLAC Laboratory Animal Co. Ltd | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系来源(ATCC)、培养基(RPMI-1640)、血清浓度(10% FBS)、CO2浓度(5%)、温度(37°C);脂肪酸处理浓度(0-40 μM)和时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment |
| 铁死亡模型 | erastin浓度(IC50,Kasumi-1最低)、处理时间(24小时)、抑制剂使用浓度 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment; Results: Lipid metabolism reprogramming during ferroptosis in AML cells |
| 脂质过氧化检测 | BODIPY 581/591 C11染料浓度、孵育时间(30分钟)、流式细胞仪设置、MDA检测步骤 阅读提示:Materials and methods: Lipid peroxidation assay, MDA assay |
| 铁含量检测 | 铁检测试剂盒、组织处理、孵育时间和波长(593 nm) 阅读提示:Materials and methods: Iron assay |
| ACSL4敲除 | sgRNA序列、载体、嘌呤霉素筛选浓度、验证方法(Western blot) 阅读提示:Materials and methods: CRISPR/Cas9-mediated knockout of ACSL4; Results: Fig. 4a |
| 体内实验 | 小鼠品系(BALB/c nude)、性别(雌性)、年龄(4-6周)、细胞接种数量(1×10^7)、DGLA剂量(5 mg/只/天)、给药方式(口服灌胃)、处理时间(18天) 阅读提示:Materials and methods: Mouse xenograft model; Results: Fig. 6 |
| 统计分析 | 重复次数(n≥3)、统计方法(t检验或单因素方差分析)、显著性阈值(P<0.05) 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |