临床样本检测AIM2焦亡和NETs水平
评估慢性肝炎患者中AIM2炎症小体依赖性焦亡和NETs的水平及其相关性
收集慢性肝炎患者和健康对照的血清及肝活检组织,通过ELISA检测GSDMD、IL-1β、IL-18和MPO-DNA水平,通过IHC和IF染色检测焦亡指标和NETs标志物,并分析其与疾病严重程度的相关性。
Neutrophil extracellular traps facilitate liver inflammation/fibrosis progression by entering macrophages and triggering AIM2 inflammasome-dependent pyroptosis.
包含临床样本分析、体外细胞实验、体内动物模型等多层级实验,并通过基因沉默、抑制剂及中和抗体进行了功能验证和机制验证。
THP-1来源巨噬细胞 RAW264.7巨噬细胞 LX-2肝星状细胞 CCl4诱导慢性肝损伤小鼠模型
NETs刺激巨噬细胞时使用的浓度2 μg/mL及处理时间24小时 NETs降解剂DNase I的剂量(体外100 U/mL,体内100 U/只) AIM2炎症小体抑制剂ODN A151的剂量100 μg/只 CCl4小鼠模型给药方案(1 μL/g体重,腹腔注射,每周两次,4/6/8周) CCl4模型中各组小鼠数量n=5
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估慢性肝炎患者中AIM2炎症小体依赖性焦亡和NETs的水平及其相关性
收集慢性肝炎患者和健康对照的血清及肝活检组织,通过ELISA检测GSDMD、IL-1β、IL-18和MPO-DNA水平,通过IHC和IF染色检测焦亡指标和NETs标志物,并分析其与疾病严重程度的相关性。
验证NETs是否能诱导巨噬细胞发生AIM2炎症小体依赖性焦亡
使用纯化的NETs(2 μg/mL)或PMA刺激的中性粒细胞与巨噬细胞共培养,通过FCM检测caspase-1/PI双染,Western blot检测焦亡相关蛋白,ELISA检测IL-1β和IL-18分泌。
验证巨噬细胞通过吞噬NETs激活AIM2炎症小体,并确认dsDNA是关键成分
使用IF观察NETs被巨噬细胞吞噬,并检测AIM2与ASC共定位;使用DNase I消化NETs的dsDNA,评估对焦亡的影响;使用siRNA敲低AIM2,检测对焦亡及炎症因子释放的抑制。
探究NETs诱导的巨噬细胞焦亡是否通过释放IL-1β和IL-18激活肝星状细胞
用NETs处理的巨噬细胞条件培养基刺激LX-2细胞,检测α-SMA和COL1A1表达;使用IL-1β中和抗体或IL-1受体拮抗剂阻断IL-1β信号,观察对HSC活化的影响。
验证降解NETs或抑制AIM2炎症小体能否缓解CCl4诱导的慢性肝损伤和纤维化
CCl4诱导慢性肝损伤小鼠模型,腹腔注射DNase I或ODN A151,通过组织学染色、IHC、羟脯氨酸检测及血清ELISA评估肝损伤和纤维化程度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| RPMI 1640培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Cellmax | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Boster | PYG0016 | |
| 细胞分化 | 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | Solarbio | P1010 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Takara | -- |
| 反转录 | ABScript反转录酶 | Abclonal | RK20429 |
| qPCR | 通用SYBR Green快速qPCR预混液 | ABclonal | RK21203 |
| 中性粒细胞分离 | 人外周血中性粒细胞分离试剂盒 | Solarbio | P9040 |
| NETs降解 | 脱氧核糖核酸酶I | Sigma-Aldrich | -- |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Solarbio | T8200 |
| 山羊血清 | Boster | AR0009 | |
| DAPI染色液 | Boster | AR1177 | |
| 抗荧光淬灭封片剂 | Boster | AR1109 | |
| 免疫荧光(一抗) | 抗AIM2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-293174 |
| 抗ASC抗体 | Abcam | ab309497 | |
| 抗中性粒细胞弹性蛋白酶抗体 | Cell Signaling Technology | 89241S | |
| 抗髓过氧化物酶抗体 | Proteintech | 66177-1-Ig | |
| 抗瓜氨酸化组蛋白H3抗体 | Abcam | ab5103 | |
| 抗α平滑肌肌动蛋白抗体 | Proteintech | 80008-1-RR | |
| 免疫荧光(二抗) | Dylight 594标记的山羊抗小鼠/兔二抗 | Abbkine | A23410/A23420 |
| Dylight 488标记的山羊抗小鼠/兔二抗 | Abbkine | A23210/A23220 | |
| 免疫荧光(一抗) | 抗F4/80抗体 | Invitrogen | 14-4801-81 |
| 抗CD68抗体 | Invitrogen | 11-0689-41 | |
| 抗AIM2抗体 | Abcam | ab93015 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Keygen Biotech | KGB5302-50 |
| Western blot(一抗) | 抗AIM2抗体 | -- | -- |
| 抗GSDMD抗体 | -- | -- | |
| 抗裂解IL-1β抗体 | Cell Signaling Technology | 83186S/63124S | |
| 抗裂解IL-18抗体 | Cell Applications | CA1339 | |
| 抗裂解caspase-1抗体 | Cell Signaling Technology | 4199S | |
| 抗COL1A1抗体 | Proteintech | 66761-1-AP | |
| 抗α平滑肌肌动蛋白抗体 | AiFang Biological | AF06495 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Servicebio | GB15001 | |
| Western blot(二抗) | 辣根过氧化物酶标记的二抗 | -- | -- |
| Western blot(显影) | 增强化学发光试剂 | NCL | P10100 |
| 羟脯氨酸测定 | 羟脯氨酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A032-2-1 |
| ELISA | 人GSDMD ELISA试剂盒 | Jianglai | JL46090 |
| 人IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H0149 | |
| 人IL-18 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H0253 | |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0037 | |
| 小鼠IL-18 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H0730 | |
| ELISA(MPO-DNA检测) | 细胞死亡检测ELISA试剂盒 | Roche | 11774425001 |
| 流式检测 | FLICA 660 Caspase-1检测试剂盒 | Immunochemistry Technologies | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 体外处理 | 脂多糖 | -- | -- |
| 中性粒细胞刺激 | 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯(100 ng/mL) | -- | -- |
| 动物实验 | 橄榄油 | Aladdin | O108686 |
| 动物实验(AIM2抑制剂) | ODN A151 | MCE | HY-150751 |
| HSC活化阻断 | IL-1β中和抗体 | Abcam | ab2105 |
| IL-1受体拮抗剂 | MCE | HY-P7029 | |
| IL-18中和抗体 | MCE | HY-P7525 | |
| IHC(一抗) | 抗GSDMD抗体 | Proteintech | 20770-1-AP |
| 抗IL-1β抗体 | AiFang Biological | AF0279 | |
| 抗IL-18抗体 | Proteintech | 10663-1-AP | |
| 抗α平滑肌肌动蛋白抗体 | Proteintech | 14395-1-AP | |
| 仪器(生化分析) | 日立7600-110全自动生化分析仪 | Hitachi | 7600-110 |
| 仪器(显微镜) | 光学显微镜 | Olympus | BX53 |
| 仪器(共聚焦显微镜) | 共聚焦显微镜 | Olympus | FV12-IXCOV |
| 仪器(酶标仪) | 酶标仪 | KHB | ST-960 |
| 数据分析 | Image-Pro Plus 6.0软件 | -- | -- |
| ImageJ分析软件 | -- | -- | |
| GraphPad统计软件 | GraphPad | version 10.1.2 | |
| STRING数据库 | -- | -- | |
| Cytoscape软件 | -- | version 3.10.2 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本检测 | 样本量:HC 55例,CH 184例;组织HC 9例,CH 15例;血清ALT/AST/TP测定方法 阅读提示:Materials and methods: Patients and clinical samples |
| NETs诱导及巨噬细胞焦亡检测 | NETs浓度2 μg/mL,处理时间24小时;PMA浓度100 ng/mL刺激中性粒细胞4小时;共培养时间48小时;DNase I浓度100 U/mL 阅读提示:Materials and methods: Human neutrophil isolation, NETs formation and treatment assay; 图3 |
| AIM2基因沉默 | siRNA序列及转染条件需查阅补充表S1 阅读提示:Materials and methods: AIM2 gene silencing; 补充文件1:表S1 |
| HSC活化实验 | LX-2细胞血清饥饿时间12小时;CM处理时间24小时;IL-1β中和抗体或IL-1RA处理浓度未明确说明 阅读提示:Materials and methods: Conditioned medium; Results: 图5 |
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、周龄:C57BL/6雄性6-8周;CCl4剂量、给药方式和频率:1 μL/g腹腔注射,每周两次,4-8周;DNase I剂量100 U/只,ODN A151剂量100 μg/只;每组n=5 阅读提示:Materials and methods: CCl4-induced chronic liver injury mouse models; 图6 |