验证TS-2021诱导GBM细胞凋亡
确定TS-2021感染是否引起GBM细胞凋亡
使用透射电镜观察细胞形态变化,Annexin V/PI流式细胞术检测凋亡,Western blot检测凋亡相关蛋白(cleaved caspase-3、cleaved PARP)。
Olaparib Enhances the Efficacy of Third-Generation Oncolytic Adenoviruses Against Glioblastoma by Modulating DNA Damage Response and p66shc-Induced Apoptosis.
包含体外细胞实验(细胞凋亡、DNA损伤、病毒复制检测)、机制研究(siRNA沉默p66shc)和体内动物模型(原位异种移植瘤)等多层级验证。
U251胶质母细胞瘤细胞系 U87胶质母细胞瘤细胞系 BT-01患者来源胶质母细胞瘤细胞系 BALB/c裸鼠原位U87-Luc异种移植模型
TS-2021感染MOI=300,处理72小时 奥拉帕利浓度:体外1 μM,体内50 mg/kg灌胃 p66shc沉默使用siRNA3#(20 μM)预处理48小时 体内实验:U87-Luc细胞注射2×10^5,TS-2021瘤内注射8 μL(5.0×10^11 vp/mL)每周一次 病毒复制检测采用qPCR,标准曲线来自TS-2021(5.0×10^11 vp/mL)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定TS-2021感染是否引起GBM细胞凋亡
使用透射电镜观察细胞形态变化,Annexin V/PI流式细胞术检测凋亡,Western blot检测凋亡相关蛋白(cleaved caspase-3、cleaved PARP)。
探究TS-2021诱导凋亡的机制,是否涉及DNA损伤和DDR
流式细胞术检测细胞周期,免疫荧光和Western blot检测γH2AX,Western blot检测PARylation水平。
验证奥拉帕利是否能增强TS-2021的抗肿瘤活性
用流式细胞术检测凋亡比例,免疫荧光和Western blot检测γH2AX和PARP表达。
探究奥拉帕利是否影响TS-2021的感染和复制
使用AdGFP感染观察GFP荧光强度,通过qPCR检测细胞内和细胞外病毒滴度。
探究联合治疗促进凋亡的分子机制是否依赖p66shc
检测ROS水平,Western blot检测p66shc磷酸化,siRNA沉默p66shc后检测ROS和凋亡。
评估联合治疗在体内的疗效和安全性
建立原位U87-Luc异种移植瘤模型,IVIS监测肿瘤生长,记录生存期和体重,H&E染色评估主要器官毒性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | 奥拉帕利 | MedChemExpress | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 磺丁基醚-β-环糊精 | Yuanye Bio-technology | -- | |
| 流式分析 | 核糖核酸酶A | -- | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| Annexin V-FITC/PI凋亡试剂盒 | Elabscience | -- | |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| DCFH-DA | -- | -- | |
| 免疫荧光 | DNA损伤检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | 抗caspase-3抗体 | CST | 9665 |
| 抗PARP抗体 | CST | 9532 | |
| 抗γH2AX Ser139抗体 | Beyotime | AF5836 | |
| 抗PAR抗体 | CST | 83732 | |
| 抗p66shc抗体 | ABclonal | A7725 | |
| 抗磷酸化Ser36-p66shc抗体 | Immunoway | YP1075 | |
| 二抗 | LABLEAD | S0100, S0101 | |
| ECL蛋白质印迹检测试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| β-肌动蛋白抗体 | LABLEAD | -- | |
| 病毒实验 | TIANamp基因组DNA试剂盒 | Tiangen Biotech | -- |
| siRNA转染 | p66shc siRNA | RiboBio | -- |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| IVIS Spectrum成像系统 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与药物处理 | 细胞系U251、U87、BT-01的来源、培养条件(DMEM+10%FBS+100U/mL青霉素/链霉素);奥拉帕利体外浓度1 μM(DMSO溶解);体内浓度2.5 mg/mL(20%磺丁基醚-β-环糊精溶液)。 阅读提示:Materials and Methods, Cell Culture and Reagents |
| 病毒感染 | TS-2021和AdGFP的MOI=300;感染时间72小时(凋亡检测)、48小时(病毒复制检测)。 阅读提示:Materials and Methods, Oncolytic Adenovirus; Results, Figure Legends |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI染色试剂盒(Elabscience)操作流程;流式细胞仪(Accuri C6)检测。 阅读提示:Materials and Methods, Flow Cytometry - Apoptosis Analysis |
| DNA损伤检测 | γH2AX免疫荧光染色使用DNA Damage Assay Kit(Beyotime);Western blot检测γH2AX Ser139。 阅读提示:Materials and Methods, Immunofluorescence Assay; Western Blotting |
| 病毒复制检测 | qPCR检测E1A区域,标准曲线使用TS-2021(5.0×10^11 vp/mL),细胞内和细胞外病毒DNA提取。 阅读提示:Materials and Methods, Evaluation of Viral Infectivity, Replication, and Release |
| p66shc沉默实验 | siRNA3#序列和转染浓度(20 μM);转染时间48小时。 阅读提示:Materials and Methods, Small Interfering RNA Transfection; Results, Figure 5 |
| 体内动物实验 | BALB/c裸鼠(6周龄,雌性)原位U87-Luc模型建立(2×10^5细胞注入右侧纹状体);奥拉帕利50 mg/kg灌胃,每周5天;TS-2021 8 μL(5.0×10^11 vp/mL)瘤内注射每周一次;监测时间7、14、21、28天。 阅读提示:Materials and Methods, Animal Experiments |