VEGFD对细胞骨架的影响
探究VEGFD对树突肌动蛋白和微管动力学的作用
通过FRAP分析树突棘中肌动蛋白的回收率,用AFM测量神经元膜刚度,并通过EB3-GFP时间推移成像分析微管生长动力学。
VEGFD signaling balances stability and activity-dependent structural plasticity of dendrites.
包含体外海马神经元培养、FRAP、AFM、EB3微管成像、磷酸化抗体芯片、体内立体定位注射rAAV、条件性恐惧记忆模型及行为学测试,涵盖多层级功能与机制验证。
原代小鼠海马神经元培养 成年小鼠海马CA1区神经元 小鼠条件性恐惧记忆模型
体外VEGFD处理浓度100 ng/ml Bicuculline处理浓度50 µM VEGFR3抑制剂SAR131675浓度23 nM 体内rAAV立体定位注射,坐标:前囟后-2 mm,旁开±1.5 mm,深度-1.7,-1.9,-2.1 mm 每组小鼠数量5-9只
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究VEGFD对树突肌动蛋白和微管动力学的作用
通过FRAP分析树突棘中肌动蛋白的回收率,用AFM测量神经元膜刚度,并通过EB3-GFP时间推移成像分析微管生长动力学。
确定持续的突触活动是否调节VEGFD表达
用Bic或BDNF刺激培养的海马神经元,通过QRT-PCR和ELISA检测VEGFD mRNA和蛋白水平,并检查受体VEGFR2和VEGFR3的表达。
验证VEGFD是否阻止突触活动诱导的树突生长
通过形态学分析和活细胞成像,观察Bic引起的树突增长是否被VEGFD过表达或外源性rVEGFD所抑制。
评估在体内VEGFD高表达是否影响条件性恐惧记忆导致的树突重塑
成年小鼠海马背侧立体定位注射rAAV-VEGFD或对照,进行条件性恐惧记忆训练,通过高尔基染色分析基底树突长度和复杂性。
寻找VEGFD介导树突稳定的下游信号分子
使用磷酸化抗体芯片筛选受VEGFD调节的细胞骨架蛋白,并通过免疫印迹、PLA验证ezrin Y478去磷酸化,利用药物抑制剂和过表达验证STEP的作用。
探究Y478位点磷酸化缺失(Y478F突变)如何影响树突对突触活动的响应
在培养神经元中过表达WT或Y478F ezrin,并结合Bic处理,进行形态学分析和机器学习辅助的单树突追踪。
在体内验证ezrin Y478磷酸化缺失是否影响恐惧记忆诱导的树突重塑
成年小鼠海马注射rAAV表达WT或Y478F ezrin,进行CFC,通过高尔基染色分析树突变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 药物处理 | 重组小鼠VEGFD | R&D Systems | -- |
| 重组小鼠VEGFD-Alt | Elabscience | -- | |
| 重组小鼠VEGFA | R&D Systems | -- | |
| 重组小鼠VEGFC | Biocat | -- | |
| 荷包牡丹碱 | Tocris Bioscience | -- | |
| TC-2153 | Sigma Aldrich | -- | |
| PP2 | Sigma Aldrich | -- | |
| SAR131675 | Selleckchem | -- | |
| DC101抗体 | Thermo Fisher | -- | |
| 组织处理 | Tissue-Tek包埋剂 | Leica | -- |
| 组织切片 | Leica CM1950冰冻切片机 | Leica | -- |
| FRAP | Leica Sp8共聚焦激光扫描显微镜 | Leica | -- |
| AFM | Nanowizard 3原子力显微镜 | JPK Instruments | -- |
| 胶体探针(SiO2,直径2微米) | sQube | -- | |
| QRT-PCR | RNeasy Mini试剂盒 | QIAGEN | -- |
| 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| StepOne Plus实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| TaqMan基因表达分析 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blotting | ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- |
| Odyssey红外成像系统 | LI-COR Biosciences | -- | |
| 免疫细胞化学 | Duolink原位红启动试剂盒 | Sigma Aldrich | -- |
| Hoechst染料 | Serva Electrophoresis | -- | |
| ELISA | 小鼠VEGFD ELISA试剂盒 | Cusabio | -- |
| Golgi染色 | 快速高尔基染色试剂盒 | FD Neuro Technologies | -- |
| 免疫组化 | Nikon Eclipse Ni-E宽场显微镜 | Nikon | -- |
| 药物处理 | X-gal | Sigma Aldrich | B4252 |
| Western blotting | 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- |
| 磷酸酶抑制剂混合物2 | Sigma Aldrich | -- | |
| 免疫印迹 | 抗VEGFD抗体 | R&D Systems | AF469 |
| 抗ezrin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-58758 | |
| 抗磷酸化(Y478)ezrin抗体 | OriGene Technologies | TA326188 | |
| 抗STEP抗体 | Cell Signaling Technology | 4396 | |
| 抗非磷酸化(S221)STEP抗体 | Cell Signaling Technology | 5659 | |
| 抗磷酸化(Y1472)GluN2B抗体 | NEB | 4208 | |
| 抗磷酸化(T202/Y204)p44/42 ERK抗体 | NEB | 9106 | |
| 抗磷酸化(T180/Y182)p38抗体 | BD Biosciences | 612288 | |
| 抗磷酸化(S473)Akt抗体 | Cell Signaling | 9271 | |
| 抗磷酸化(S172)NFATc1抗体 | Invitrogen | PA5-64696 | |
| 抗磷酸化(Y416)Src家族抗体 | Cell Signaling | 6943 | |
| 抗VEGFR3抗体 | R&D Systems | AF743 | |
| 抗VEGFR2抗体 | R&D Systems | 2479 | |
| 抗Flag抗体 | Sigma Aldrich | F3165 | |
| 抗dsRed抗体 | Clontech Laboratories | 632496 | |
| 抗HA抗体 | Covance | MMS-101R | |
| 抗cFos抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-52 | |
| 抗gapdh抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 | |
| 抗微管蛋白抗体 | Merck Millipore | T9026 | |
| 山羊抗小鼠IgG(H+L)辣根过氧化物酶 | AffiniPure Jackson Immuno Research | 115-035-003 | |
| 山羊抗兔IgG(H+L)辣根过氧化物酶 | AffiniPure Jackson Immuno Research | 111-035-144 | |
| 驴抗山羊IgG(H+L)辣根过氧化物酶 | AffiniPure Jackson Immuno Research | 705-035-147 | |
| 荧光免疫印迹 | IRDye 680LT驴抗小鼠二抗 | LI-COR Biosciences | -- |
| IRDye 800CW驴抗兔二抗 | LI-COR Biosciences | -- | |
| 免疫细胞化学 | 山羊抗小鼠IgG(H+L)Alexa Fluor 488 | Life Technologies | A11001 |
| 山羊抗小鼠IgG(H+L)Alexa Fluor 594 | Life Technologies | A11005 | |
| 山羊抗兔IgG(H+L)Alexa Fluor 488 | Life Technologies | A11008 | |
| 组织染色 | Nikon Eclipse 90i正置自动显微镜 | Nikon | -- |
| 活细胞成像 | Nikon Eclipse Ti2宽场显微镜 | Nikon | -- |
| 软件分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
| GraphPad Prism软件 | GraphPad Software, Inc. | -- | |
| R 3.6.3统计软件 | R Foundation for Statistical Computing | -- | |
| 活细胞成像 | Incucyte S3活细胞分析系统 | Sartorius | 4647 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和转染 | 使用P0 C57Bl/6N小鼠海马神经元,转染方法、培养天数(DIV 8-14) 阅读提示:Materials and methods: Hippocampal cultures, transfections, and treatments |
| 药物处理 | 重组VEGFD浓度100 ng/ml,VEGFC 100 ng/ml,Bic 50 µM,TC-2153 10 µM,PP2 1或10 µM,SAR131675 23 nM,DC101 2 µg/ml,处理时间详见图注 阅读提示:Materials and methods: Hippocampal cultures, transfections, and treatments; 相应图注 |
| 在体实验 | 小鼠品系、性别、年龄(C57Bl/6N,雄性,8-12周),rAAV注射坐标、体积、注射速度 阅读提示:Materials and methods: Mice, Stereotaxic delivery of rAAVs |
| 行为学分析 | 条件性恐惧训练参数:电击强度(0.6 mA,1秒)、声音(5000 Hz,85 dB,30秒)、训练和测试时间 阅读提示:Materials and methods: Contextual and cued fear conditioning |
| 形态学分析 | 高尔基染色切片厚度(100 μm)、图像获取参数(z系列间隔5 μm) 阅读提示:Materials and methods: Golgi staining and analyses |